More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0163 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0163  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 		 306 aa  615  1e-175  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0186  2-dehydropantoate 2-reductase  81.7 
 
 		 306 aa  507  9.999999999999999e-143  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0018  2-dehydropantoate 2-reductase  65.69 
 
 		 306 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0729  2-dehydropantoate 2-reductase  65.36 
 
 		 306 aa  408  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.691763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0313  2-dehydropantoate 2-reductase  66.99 
 
 		 307 aa  408  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.82281 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0016  2-dehydropantoate 2-reductase  64.38 
 
 		 307 aa  401  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0021  2-dehydropantoate 2-reductase  63.07 
 
 		 306 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3118  2-dehydropantoate 2-reductase  57.65 
 
 		 312 aa  343  2e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.782034 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2936  2-dehydropantoate 2-reductase  56.03 
 
 		 312 aa  330  2e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.178942 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5770  2-dehydropantoate 2-reductase  54.75 
 
 		 307 aa  328  5.0000000000000004e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3162  2-dehydropantoate 2-reductase  56.35 
 
 		 312 aa  328  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4498  2-dehydropantoate 2-reductase  56.21 
 
 		 312 aa  323  2e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.399113 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2967  2-dehydropantoate 2-reductase  55.7 
 
 		 311 aa  323  2e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.53344  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6687  2-dehydropantoate 2-reductase  57.65 
 
 		 312 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6167  2-dehydropantoate 2-reductase  57.43 
 
 		 314 aa  315  6e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2600  2-dehydropantoate 2-reductase  53.77 
 
 		 311 aa  308  5.9999999999999995e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.11896 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2669  2-dehydropantoate 2-reductase  54.1 
 
 		 310 aa  308  8e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0588922  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0743  ketopantoate reductase ApbA/PanE  53.57 
 
 		 311 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.786977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4423  2-dehydropantoate 2-reductase  53.9 
 
 		 311 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.852681 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0085  2-dehydropantoate 2-reductase  55.02 
 
 		 314 aa  301  1e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4726  2-dehydropantoate 2-reductase  53.77 
 
 		 315 aa  296  2e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.14221 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3781  2-dehydropantoate 2-reductase  52.65 
 
 		 312 aa  290  3e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0449567 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4203  2-dehydropantoate 2-reductase  54.1 
 
 		 315 aa  289  3e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.379422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0882  2-dehydropantoate 2-reductase  53.07 
 
 		 315 aa  288  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.277426 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5461  2-dehydropantoate 2-reductase  53.07 
 
 		 315 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.853784  normal  0.141843 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3545  2-dehydropantoate 2-reductase  53.07 
 
 		 315 aa  285  7e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16372  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4822  2-dehydropantoate 2-reductase  53.07 
 
 		 315 aa  285  7e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0191  2-dehydropantoate 2-reductase  53.11 
 
 		 305 aa  281  7.000000000000001e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0174  2-dehydropantoate 2-reductase  52.58 
 
 		 313 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.170216 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1713  2-dehydropantoate 2-reductase  45.07 
 
 		 306 aa  263  2e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3518  2-dehydropantoate 2-reductase  51.57 
 
 		 305 aa  255  6e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0059  2-dehydropantoate 2-reductase  50.96 
 
 		 321 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0067  2-dehydropantoate 2-reductase  50.96 
 
 		 321 aa  252  5.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2980  Ketopantoate reductase ApbA/PanE domain protein  46.11 
 
 		 323 aa  249  3e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0600  2-dehydropantoate 2-reductase  43.46 
 
 		 314 aa  246  4e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000137771  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1405  2-dehydropantoate 2-reductase  45.57 
 
 		 307 aa  245  6e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1991  2-dehydropantoate 2-reductase  39.44 
 
 		 314 aa  226  3e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3467  2-dehydropantoate 2-reductase  40.14 
 
 		 314 aa  226  3e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000905297  hitchhiker  8.32908e-18 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1877  2-dehydropantoate 2-reductase  40.14 
 
 		 314 aa  226  4e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0355332  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1738  2-dehydropantoate 2-reductase  39.79 
 
 		 314 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0314725  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4552  2-dehydropantoate 2-reductase  45.25 
 
 		 307 aa  222  6e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3883  2-dehydropantoate 2-reductase  48.88 
 
 		 312 aa  221  8e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.535579 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1964  2-dehydropantoate 2-reductase  38.38 
 
 		 314 aa  220  3e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00305796  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1746  2-dehydropantoate 2-reductase  38.38 
 
 		 314 aa  217  2e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1884  2-dehydropantoate 2-reductase  38.38 
 
 		 314 aa  217  2e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1918  2-dehydropantoate 2-reductase  37.68 
 
 		 314 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000931177 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2408  2-dehydropantoate 2-reductase  40.2 
 
 		 306 aa  214  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0790989 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1696  2-dehydropantoate 2-reductase  36.97 
 
 		 314 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.231571  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1913  ketopantoate reductase ApbA/PanE  42.81 
 
 		 304 aa  212  4.9999999999999996e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02788  2-dehydropantoate 2-reductase  45.81 
 
 		 312 aa  213  4.9999999999999996e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4737  ketopantoate reductase ApbA/PanE  43.46 
 
 		 310 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4116  2-dehydropantoate 2-reductase  40.13 
 
 		 308 aa  204  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.605632 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1107  2-dehydropantoate 2-reductase  43.23 
 
 		 319 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06250  2-dehydropantoate 2-reductase  42.62 
 
 		 305 aa  189  5e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0294  2-dehydropantoate 2-reductase  33 
 
 		 307 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.220777  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5181  2-dehydropantoate 2-reductase  32.46 
 
 		 307 aa  142  8e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000387537  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0535  2-dehydropantoate 2-reductase  32.46 
 
 		 307 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000195412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2865  2-dehydropantoate 2-reductase  29.49 
 
 		 311 aa  112  5e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0328  2-dehydropantoate 2-reductase  32.42 
 
 		 315 aa  109  6e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0244641  normal  0.0158618 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  29.32 
 
 		 299 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1736  2-dehydropantoate 2-reductase  26.49 
 
 		 309 aa  107  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0419891 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6243  2-dehydropantoate 2-reductase  29.58 
 
 		 316 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1979  2-dehydropantoate 2-reductase  28.43 
 
 		 313 aa  106  6e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0057409  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2523  2-dehydropantoate 2-reductase  29.41 
 
 		 312 aa  105  7e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  26.32 
 
 		 307 aa  105  7e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3896  ketopantoate reductase ApbA/PanE  29.18 
 
 		 337 aa  104  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4507  2-dehydropantoate 2-reductase  27.33 
 
 		 335 aa  103  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28047  normal  0.622175 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2230  2-dehydropantoate 2-reductase  31.13 
 
 		 305 aa  102  7e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157651  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6528  2-dehydropantoate 2-reductase  29.26 
 
 		 316 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0839  2-dehydropantoate 2-reductase  25.99 
 
 		 307 aa  101  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0270  2-dehydropantoate 2-reductase  30.92 
 
 		 318 aa  100  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.267073 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0858  2-dehydropantoate 2-reductase  32.09 
 
 		 311 aa  100  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00149615  normal  0.0154258 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0713  2-dehydropantoate 2-reductase  25.69 
 
 		 306 aa  100  4e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  28.99 
 
 		 300 aa  99.8  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2525  2-dehydropantoate 2-reductase  27.9 
 
 		 326 aa  98.2  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1997  2-dehydropantoate 2-reductase  25.83 
 
 		 315 aa  97.8  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.515886 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1859  2-dehydropantoate 2-reductase  27.94 
 
 		 311 aa  94.4  2e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.540128  normal  0.594276 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2643  2-dehydropantoate 2-reductase  29.77 
 
 		 302 aa  93.6  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0600227  normal  0.533415 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1998  2-dehydropantoate 2-reductase  28.48 
 
 		 310 aa  93.6  4e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1861  2-dehydropantoate 2-reductase  28.62 
 
 		 317 aa  93.2  5e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2753  2-dehydropantoate 2-reductase  28.66 
 
 		 309 aa  93.2  5e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4615  2-dehydropantoate 2-reductase  28.95 
 
 		 312 aa  92.8  6e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4479  2-dehydropantoate 2-reductase  28.11 
 
 		 337 aa  91.7  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1673  ketopantoate reductase ApbA/PanE  28.1 
 
 		 334 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.662338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4344  2-dehydropantoate 2-reductase  27.05 
 
 		 332 aa  90.9  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.244617  decreased coverage  0.000830744 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1695  ketopantoate reductase ApbA/PanE-like protein  28.1 
 
 		 334 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1723  ketopantoate reductase ApbA/PanE  28.1 
 
 		 334 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.711694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1739  ketopantoate reductase ApbA/PanE  28.1 
 
 		 334 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.753948  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2998  2-dehydropantoate 2-reductase, putative  31.6 
 
 		 315 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0207469 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4016  2-dehydropantoate 2-reductase  26.28 
 
 		 317 aa  90.1  5e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2683  2-dehydropantoate 2-reductase  28.9 
 
 		 302 aa  89.4  8e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2695  2-dehydropantoate 2-reductase  29.08 
 
 		 315 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.120286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0557  ketopantoate reductase ApbA/PanE  27.79 
 
 		 334 aa  89  9e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.302954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  27.69 
 
 		 301 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0533  ketopantoate reductase ApbA/PanE  27.49 
 
 		 334 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2226  2-dehydropantoate 2-reductase  26.79 
 
 		 336 aa  87.4  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6020  2-dehydropantoate 2-reductase  28.34 
 
 		 316 aa  87  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.217101  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0698  2-dehydropantoate 2-reductase  26.52 
 
 		 332 aa  87  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0555265  hitchhiker  0.000214293 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5528  2-dehydropantoate 2-reductase  28.57 
 
 		 316 aa  86.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5892  2-dehydropantoate 2-reductase  28.57 
 
 		 316 aa  86.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700658  normal  0.998449 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>