More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0001 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  100 
 
 
453 aa  935  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  2.08022e-10  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0001  chromosomal replication initiation protein  66.96 
 
 
450 aa  633  1e-180  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0001  chromosomal replication initiation protein  67.11 
 
 
446 aa  632  1e-180  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  3.25337e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0001  chromosomal replication initiation protein  66.67 
 
 
446 aa  629  1e-179  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000594007  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0001  chromosomal replication initiation protein  66.44 
 
 
446 aa  628  1e-179  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.63866e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0001  chromosomal replication initiation protein  66.44 
 
 
446 aa  628  1e-179  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  4.59109e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0001  chromosomal replication initiation protein  66.44 
 
 
446 aa  628  1e-179  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0001  chromosomal replication initiation protein  66.67 
 
 
450 aa  629  1e-179  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  4.47845e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0001  chromosomal replication initiation protein  66.44 
 
 
446 aa  628  1e-179  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  2.44098e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0001  chromosomal replication initiation protein  66.67 
 
 
446 aa  629  1e-179  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  1.84902e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0001  chromosomal replication initiation protein  66.44 
 
 
446 aa  628  1e-179  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  4.25777e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0001  chromosomal replication initiation protein  66 
 
 
446 aa  626  1e-178  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.562714  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0001  chromosomal replication initiation protein  66.44 
 
 
446 aa  627  1e-178  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000585905  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5319  chromosomal replication initiation protein  66.44 
 
 
446 aa  626  1e-178  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.679479  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  61.06 
 
 
463 aa  579  1e-164  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00536902  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0001  chromosomal replication initiation protein  60.31 
 
 
457 aa  568  1e-161  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  5.97417e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0001  chromosomal replication initiation protein  60.31 
 
 
457 aa  569  1e-161  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000458864  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  63.03 
 
 
449 aa  565  1e-160  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.41272e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0001  chromosomal replication initiation protein  59.51 
 
 
440 aa  561  1e-159  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  1.18947e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0001  chromosomal replication initiation protein  60.49 
 
 
441 aa  563  1e-159  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000247534  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0002  chromosomal replication initiation protein  60.81 
 
 
442 aa  554  1e-156  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0135977  hitchhiker  1.01386e-05 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  56.98 
 
 
454 aa  550  1e-155  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00039195  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  58.04 
 
 
446 aa  538  1e-152  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  2.08181e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2371  chromosomal replication initiation protein  58.77 
 
 
443 aa  535  1e-151  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0166544  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0001  chromosomal replication initiation protein  55.31 
 
 
443 aa  527  1e-148  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00172749  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  57.14 
 
 
444 aa  518  1e-146  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0001  initiation of chromosome replication  56.06 
 
 
436 aa  519  1e-146  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2553  chromosomal replication initiation protein  56.48 
 
 
451 aa  516  1e-145  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000248403  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0001  chromosomal replication initiation protein  56.82 
 
 
445 aa  509  1e-143  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00343862  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0001  chromosomal replication initiation protein  56.11 
 
 
453 aa  509  1e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.101414  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0001  chromosomal replication initiation protein  56.11 
 
 
453 aa  509  1e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  7.95473e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  54.34 
 
 
443 aa  488  1e-137  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  54.15 
 
 
454 aa  466  1e-130  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  3.31762e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  50.34 
 
 
450 aa  461  1e-128  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000842824  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0000.1  chromosomal replication initiation protein  50.11 
 
 
445 aa  457  1e-127  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.159401  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  50.43 
 
 
480 aa  453  1e-126  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0001  chromosomal replication initiation protein  45.94 
 
 
472 aa  447  1e-124  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  3.68077e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0001  chromosomal replication initiation protein  46.96 
 
 
481 aa  442  1e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  5.6365e-07  unclonable  1.12062e-05 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0001  chromosomal replication initiation protein  45.86 
 
 
478 aa  440  1e-122  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  3.39822e-05  hitchhiker  3.14878e-05 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0001  chromosomal replication initiation protein  46.41 
 
 
480 aa  439  1e-122  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000170377  unclonable  6.50471e-10 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  47.25 
 
 
456 aa  441  1e-122  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0001  chromosomal replication initiation protein  49.45 
 
 
459 aa  439  1e-122  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  3.86226e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  46.78 
 
 
461 aa  438  1e-122  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  7.04659e-08  normal  0.0525005 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0001  chromosomal replication initiation protein  49.12 
 
 
470 aa  437  1e-121  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000177247  normal  0.980205 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  48.44 
 
 
439 aa  430  1e-119  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00780596  normal  0.982574 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0001  chromosomal replication initiation protein  47.53 
 
 
449 aa  431  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  49.67 
 
 
447 aa  430  1e-119  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0001  chromosomal replication initiation protein  45.73 
 
 
458 aa  429  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  3.04436e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  48.02 
 
 
453 aa  431  1e-119  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0001  chromosomal replication initiation protein  45.53 
 
 
460 aa  427  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  58.65 
 
 
721 aa  427  1e-118  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  4.23182e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  45.55 
 
 
528 aa  426  1e-118  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.561876  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0001  chromosomal replication initiation protein  47.58 
 
 
453 aa  426  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0001  chromosomal replication initiation protein  46.77 
 
 
450 aa  427  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0001  chromosomal replication initiation protein  47.11 
 
 
460 aa  425  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.831436  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  47.45 
 
 
439 aa  428  1e-118  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  1.09214e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  59.16 
 
 
591 aa  424  1e-117  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.000633656  unclonable  2.92755e-08 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  59.16 
 
 
587 aa  423  1e-117  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  7.18914e-09  hitchhiker  0.000588843 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0198  chromosomal replication initiation protein  45.13 
 
 
460 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00733858  normal  0.0821352 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  47.92 
 
 
468 aa  420  1e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0001  chromosomal replication initiation protein  47.01 
 
 
452 aa  420  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98376e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.38 
 
 
509 aa  420  1e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0827  chromosomal replication initiation protein  46.68 
 
 
492 aa  421  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  47.86 
 
 
489 aa  417  1e-115  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0001  chromosomal replication initiation protein  46.27 
 
 
494 aa  416  1e-115  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.124904  normal  0.26229 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0001  chromosomal replication initiation protein  47.29 
 
 
453 aa  417  1e-115  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.755155  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0001  chromosomal replication initiation protein  46.14 
 
 
495 aa  416  1e-115  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0001  chromosomal replication initiation protein  46.14 
 
 
495 aa  416  1e-115  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0454037 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1100  chromosomal replication initiation protein  44.25 
 
 
482 aa  417  1e-115  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.018395 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0009  chromosomal replication initiation protein  46.14 
 
 
495 aa  416  1e-115  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166715  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0003  chromosomal replication initiation protein  47.29 
 
 
453 aa  418  1e-115  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  64.65 
 
 
527 aa  414  1e-114  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0861644  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05681  chromosomal replication initiation protein  45.13 
 
 
454 aa  412  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.263255  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0001  DNA replication initiation ATPase- like protein  60 
 
 
582 aa  411  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  5.23076e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0001  chromosomal replication initiation protein  46.34 
 
 
456 aa  410  1e-113  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0001  chromosomal replication initiation protein  48.32 
 
 
440 aa  409  1e-113  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.203604  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  44.56 
 
 
527 aa  409  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  59.17 
 
 
566 aa  405  1e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  1.50843e-05  normal  0.201816 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  47.88 
 
 
490 aa  406  1e-112  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0001  chromosomal replication initiation protein  59.94 
 
 
615 aa  405  1e-112  Thermobifida fusca YX  Bacteria  unclonable  4.79277e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0001  chromosomal replication initiation protein  47.36 
 
 
450 aa  406  1e-112  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  3.22878e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  44.71 
 
 
458 aa  408  1e-112  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  50.48 
 
 
473 aa  404  1e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.84064e-14 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0001  chromosomal replication initiation protein  44.49 
 
 
495 aa  404  1e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  58.17 
 
 
652 aa  402  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  5.05913e-06  hitchhiker  0.00770539 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00010  chromosomal replication initiation protein  56.85 
 
 
597 aa  402  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  2.78732e-07  normal  0.616682 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0001  chromosomal replication initiation protein  45.29 
 
 
451 aa  402  1e-111  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  1.23931e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0001  chromosomal replication initiation protein  45.29 
 
 
451 aa  402  1e-111  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00187127  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4153  chromosomal replication initiation protein  45.74 
 
 
462 aa  400  1e-110  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  7.6269e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10001  chromosomal replication initiation protein  47.17 
 
 
507 aa  399  1e-110  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  46.41 
 
 
462 aa  399  1e-110  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.138659  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  60.36 
 
 
562 aa  399  1e-110  Frankia sp. CcI3  Bacteria  unclonable  6.90317e-08  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  45.98 
 
 
464 aa  399  1e-110  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00240104  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0886  chromosomal replication initiation protein  45.1 
 
 
462 aa  398  1e-110  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0001  chromosomal replication initiation protein  45.88 
 
 
465 aa  401  1e-110  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00429077  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  59.94 
 
 
570 aa  401  1e-110  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000116219  normal  0.231349 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  47.37 
 
 
476 aa  399  1e-110  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  unclonable  2.40109e-09  normal  0.165841 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4177  chromosomal replication initiation protein  45.74 
 
 
462 aa  400  1e-110  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  5.10804e-08  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  50.48 
 
 
474 aa  399  1e-110  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  3.98294e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4223  chromosomal replication initiation protein  45.23 
 
 
467 aa  397  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  6.6194e-08  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>