More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4353 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_4353  DedA family membrane protein  100 
 
 
247 aa  493  1e-138  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1552  DedA family membrane protein  61.5 
 
 
216 aa  263  2e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.487737  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4180  SNARE associated Golgi protein  41.78 
 
 
246 aa  169  3e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.531841  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6926  SNARE associated Golgi protein  42.27 
 
 
249 aa  163  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35260  uncharacterized membrane-associated protein  39.3 
 
 
277 aa  156  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2971  SNARE associated Golgi protein-related protein  38.18 
 
 
286 aa  154  2e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0017  SNARE associated Golgi protein  38.56 
 
 
363 aa  152  6e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447324  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1142  SNARE associated Golgi protein  42.86 
 
 
216 aa  150  2e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2579  hypothetical protein  38.39 
 
 
256 aa  149  5e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00440757  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1369  hypothetical protein  40.78 
 
 
221 aa  147  1e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25777  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0031  hypothetical protein  41.58 
 
 
268 aa  146  3e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0237  hypothetical protein  38.79 
 
 
236 aa  146  4e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2311  SNARE associated Golgi protein  37.56 
 
 
259 aa  145  5e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.16146e-09 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0127  hypothetical protein  39.52 
 
 
237 aa  145  7e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0132  SNARE associated Golgi protein  40 
 
 
237 aa  145  7e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365407  decreased coverage  2.35996e-05 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0575  DedA family protein  42.44 
 
 
213 aa  145  9e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.684924  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5157  SNARE associated Golgi protein  37.76 
 
 
235 aa  142  5e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4065  SNARE associated Golgi protein-like protein  36.71 
 
 
240 aa  142  6e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0509  SNARE associated Golgi protein-related protein  40.83 
 
 
239 aa  142  6e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1466  hypothetical protein  39.71 
 
 
221 aa  140  1e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0668  hypothetical protein  37.56 
 
 
232 aa  141  1e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.791744 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2799  hypothetical protein  39.22 
 
 
220 aa  141  1e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2866  hypothetical protein  37.2 
 
 
219 aa  139  4e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3333  hypothetical protein  37.5 
 
 
220 aa  139  5e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00119993  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1421  hypothetical protein  37.5 
 
 
220 aa  138  7e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0360  hypothetical protein  37.5 
 
 
220 aa  138  7e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1530  hypothetical protein  37.5 
 
 
220 aa  138  7e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2555  hypothetical protein  37.75 
 
 
219 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2597  hypothetical protein  37.75 
 
 
219 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.651507 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2509  hypothetical protein  37.75 
 
 
219 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2718  hypothetical protein  37.75 
 
 
219 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261998  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2609  hypothetical protein  37.75 
 
 
219 aa  136  3e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36856  normal  0.051576 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2715  SNARE associated Golgi protein  38.83 
 
 
221 aa  134  2e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.65306 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1987  SNARE associated Golgi protein  38.89 
 
 
222 aa  134  2e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.446526  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1150  SNARE associated Golgi protein  35.51 
 
 
224 aa  132  7e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.66321e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4066  SNARE associated Golgi protein-like protein  37 
 
 
248 aa  131  9e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2173  hypothetical protein  38.54 
 
 
218 aa  130  2e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2611  hypothetical protein  36.87 
 
 
219 aa  130  3e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1167  DedA protein (DSG-1 protein)  38.61 
 
 
219 aa  129  3e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.482076  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2575  hypothetical protein  37.56 
 
 
232 aa  129  4e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0512  hypothetical protein  38.03 
 
 
231 aa  128  7e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0501  hypothetical protein  38.03 
 
 
231 aa  128  7e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0490  hypothetical protein  38.03 
 
 
231 aa  128  7e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164166  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2695  hypothetical protein  36.87 
 
 
219 aa  128  8e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2029  DedA protein (DSG-1 protein)  37.44 
 
 
218 aa  128  8e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3457  hypothetical protein  36.36 
 
 
219 aa  128  9e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2468  hypothetical protein  36.36 
 
 
219 aa  128  9e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1335  hypothetical protein  36.36 
 
 
219 aa  128  9e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.64425 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1339  SNARE associated Golgi protein-like protein  36.36 
 
 
219 aa  128  9e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.217693  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02242  conserved inner membrane protein  36.36 
 
 
219 aa  128  9e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02202  hypothetical protein  36.36 
 
 
219 aa  128  9e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2201  hypothetical protein  37.5 
 
 
218 aa  127  1e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2473  hypothetical protein  36.36 
 
 
219 aa  128  1e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0005  integral membrane protein; DedA family protein  37.84 
 
 
218 aa  127  2e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.695694  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  33.02 
 
 
217 aa  127  2e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3465  SNARE associated Golgi protein  37.44 
 
 
222 aa  126  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.133962  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4068  SNARE associated Golgi protein  34.95 
 
 
220 aa  126  4e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.379921  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0392  DedA family protein  37.32 
 
 
241 aa  126  4e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11720  hypothetical protein  37.69 
 
 
221 aa  125  6e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3305  DedA protein (DSG-1 protein)  38.31 
 
 
215 aa  125  7e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25714  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3163  hypothetical protein  36.82 
 
 
213 aa  124  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2559  DEDA DSG-1 protein transmembrane  38.46 
 
 
218 aa  124  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0105855  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1127  SNARE associated Golgi protein  38.35 
 
 
219 aa  124  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10369  transmembrane protein  36.82 
 
 
227 aa  124  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.702136 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3208  DedA protein (DSG-1 protein)  37.25 
 
 
215 aa  124  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.043821  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2768  hypothetical protein  38.73 
 
 
212 aa  123  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.375842  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30240  uncharacterized membrane-associated protein  40.19 
 
 
228 aa  123  3e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.397546 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3233  SNARE associated Golgi protein  36.51 
 
 
230 aa  123  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0801636 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1368  integral membrane protein  36.1 
 
 
221 aa  120  1e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.377957  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1076  hypothetical protein  36.68 
 
 
221 aa  121  1e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313022  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1301  DedA protein (DSG-1 protein)  38.73 
 
 
230 aa  121  1e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0955835  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4379  hypothetical protein  39.73 
 
 
234 aa  120  2e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.76296  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2429  SNARE associated Golgi protein  37.07 
 
 
215 aa  120  2e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1317  SNARE associated Golgi protein  37.22 
 
 
223 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0112006  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4224  DedA protein (DSG-1 protein)  36.23 
 
 
220 aa  119  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0539738  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2835  SNARE associated Golgi protein  37.89 
 
 
215 aa  119  5e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.691658  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0086  SNARE associated Golgi protein  33.98 
 
 
216 aa  118  7e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.862215  hitchhiker  0.00916794 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5129  SNARE associated Golgi protein  37.06 
 
 
244 aa  118  7e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.958225 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1148  hypothetical protein  33.33 
 
 
211 aa  117  1e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1321  hypothetical protein  37.21 
 
 
253 aa  117  2e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.777218  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1467  SNARE associated Golgi protein  38 
 
 
213 aa  117  2e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1759  hypothetical protein  35.26 
 
 
213 aa  116  3e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.335415  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2620  SNARE associated Golgi protein  36.92 
 
 
227 aa  116  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2484  SNARE associated Golgi protein  35.94 
 
 
229 aa  116  4e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.87707  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1653  SNARE associated Golgi protein  36.11 
 
 
214 aa  115  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0179  SNARE associated Golgi protein-related protein  35.75 
 
 
229 aa  115  8e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.843652  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2527  membrane protein, DedA family  37.37 
 
 
215 aa  115  8e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2156  SNARE associated Golgi protein  37.37 
 
 
215 aa  115  8e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  1.42104e-05 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3296  DedA family membrane protein  36.57 
 
 
226 aa  114  1e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0603316  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27115  predicted protein  35 
 
 
252 aa  114  1e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000197052  normal  0.0145567 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3307  hypothetical protein  36.57 
 
 
283 aa  114  2e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.370816  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3263  DedA family membrane protein  36.57 
 
 
242 aa  114  2e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.666613  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2191  DedA family membrane protein  34.87 
 
 
226 aa  114  2e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1084  dedA family protein  34.87 
 
 
226 aa  114  2e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0515  dedA family protein  34.87 
 
 
226 aa  114  2e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.557526  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2313  dedA family protein  34.87 
 
 
226 aa  114  2e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.485565  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1474  SNARE associated Golgi protein  32.86 
 
 
214 aa  113  3e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2907  hypothetical protein  37.93 
 
 
219 aa  113  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1269  SNARE associated Golgi protein  38.07 
 
 
201 aa  112  5e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0089  SNARE associated Golgi protein  39.77 
 
 
214 aa  112  5e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.061617 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>