More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4211 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4211  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 		 337 aa  683    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7629  oxidoreductase domain protein  63.86 
 
 		 338 aa  428  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.733324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1689  oxidoreductase domain-containing protein  61.11 
 
 		 344 aa  415  9.999999999999999e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08630  predicted dehydrogenase  60.62 
 
 		 332 aa  417  9.999999999999999e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1684  oxidoreductase domain-containing protein  61.42 
 
 		 344 aa  411  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0360838 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21020  predicted dehydrogenase  58.72 
 
 		 332 aa  390  1e-107  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09010  predicted dehydrogenase  57.01 
 
 		 328 aa  379  1e-104  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  38.75 
 
 		 344 aa  219  6e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1135  oxidoreductase domain-containing protein  40.18 
 
 		 361 aa  214  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022586  normal  0.596478 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3975  oxidoreductase domain-containing protein  40.34 
 
 		 361 aa  204  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000585399  hitchhiker  0.00367656 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5494  oxidoreductase domain protein  39.47 
 
 		 345 aa  190  2.9999999999999997e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  36.1 
 
 		 344 aa  174  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1076  oxidoreductase  35.85 
 
 		 345 aa  172  7.999999999999999e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1608  oxidoreductase-like  34.6 
 
 		 332 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  34.38 
 
 		 346 aa  163  4.0000000000000004e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  34.08 
 
 		 331 aa  162  6e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1619  oxidoreductase-like  34.29 
 
 		 332 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  30.93 
 
 		 313 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0878  oxidoreductase domain-containing protein  31.38 
 
 		 310 aa  150  2e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  30.42 
 
 		 312 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5615  NAD(P)-dependent oxidoreductase  32.51 
 
 		 335 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.341393 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1434  oxidoreductase-like  31.92 
 
 		 334 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.367315 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0204  oxidoreductase domain-containing protein  29.22 
 
 		 311 aa  144  2e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0947  oxidoreductase domain protein  31.17 
 
 		 319 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0234  oxidoreductase  32.93 
 
 		 335 aa  138  2e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0901  oxidoreductase-like  31.08 
 
 		 302 aa  135  9.999999999999999e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.780576  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03061  putative oxidoreductase  30.86 
 
 		 334 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2030  oxidoreductase-like protein  28.96 
 
 		 310 aa  133  5e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2126  oxidoreductase domain protein  24.23 
 
 		 320 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0093  oxidoreductase domain-containing protein  29.73 
 
 		 310 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2596  oxidoreductase  31.76 
 
 		 353 aa  131  2.0000000000000002e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.724229 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0263  oxidoreductase  32.22 
 
 		 335 aa  130  3e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.998176  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0275  putative oxidoreductase  31.4 
 
 		 334 aa  130  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1639  putative oxidoreductase  31.06 
 
 		 340 aa  130  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0783296  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0702  oxidoreductase domain protein  30.22 
 
 		 359 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.519642 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03531  putative oxidoreductase  30.75 
 
 		 340 aa  129  6e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02961  putative oxidoreductase  29.87 
 
 		 334 aa  128  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3039  oxidoreductase domain protein  30.43 
 
 		 356 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3081  oxidoreductase domain protein  30.43 
 
 		 356 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4717  oxidoreductase domain-containing protein  29.18 
 
 		 360 aa  127  2.0000000000000002e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.113453  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5202  oxidoreductase domain protein  29.6 
 
 		 355 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03001  putative oxidoreductase  30.37 
 
 		 334 aa  127  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02951  putative oxidoreductase  30.56 
 
 		 334 aa  127  3e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2363  oxidoreductase-like  28.75 
 
 		 354 aa  126  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000565136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0084  oxidoreductase domain-containing protein  29.22 
 
 		 312 aa  122  7e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.481662  normal  0.273394 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1611  oxidoreductase-like protein  26.43 
 
 		 335 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24931  putative oxidoreductase  30.91 
 
 		 340 aa  121  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1132  oxidoreductase domain-containing protein  28.53 
 
 		 311 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000981534 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1459  oxidoreductase domain-containing protein  31.31 
 
 		 303 aa  119  7.999999999999999e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.520648  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1914  oxidoreductase-like  30.03 
 
 		 356 aa  119  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00346071  normal  0.174579 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5181  oxidoreductase domain protein  30.82 
 
 		 327 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1853  oxidoreductase domain-containing protein  30.67 
 
 		 331 aa  117  3e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0058  oxidoreductase domain-containing protein  28.53 
 
 		 310 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2038  oxidoreductase domain protein  31.55 
 
 		 327 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0899813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3013  oxidoreductase domain protein  29.94 
 
 		 340 aa  110  5e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0917  oxidoreductase domain protein  30.52 
 
 		 359 aa  108  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.441331  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0974  oxidoreductase domain-containing protein  28.14 
 
 		 333 aa  108  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.104378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1509  oxidoreductase domain-containing protein  27.87 
 
 		 355 aa  108  2e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000679007 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2814  oxidoreductase domain protein  28.99 
 
 		 363 aa  107  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0247  oxidoreductase domain-containing protein  24.46 
 
 		 311 aa  107  4e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0611  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.79 
 
 		 288 aa  106  6e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2762  oxidoreductase domain protein  25.69 
 
 		 328 aa  106  7e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1431  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.79 
 
 		 288 aa  105  9e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.953147  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2141  oxidoreductase-like  27.3 
 
 		 305 aa  105  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.740066 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1070  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  31.55 
 
 		 286 aa  104  3e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0826  oxidoreductase domain protein  24.92 
 
 		 315 aa  104  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1607  oxidoreductase domain-containing protein  31.23 
 
 		 295 aa  103  5e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0765  oxidoreductase domain protein  31.47 
 
 		 314 aa  103  5e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.209696  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0487  oxidoreductase domain protein  30.23 
 
 		 323 aa  102  9e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00988737  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0532  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.21 
 
 		 288 aa  101  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1531  oxidoreductase domain protein  27.6 
 
 		 326 aa  100  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1833  oxidoreductase domain-containing protein  30.85 
 
 		 307 aa  100  3e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0269797  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3196  oxidoreductase domain protein  31.35 
 
 		 341 aa  100  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4613  oxidoreductase domain-containing protein  27.93 
 
 		 342 aa  100  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.500705  normal  0.21491 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3041  oxidoreductase-like  28.17 
 
 		 350 aa  100  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1859  oxidoreductase domain-containing protein  28.27 
 
 		 326 aa  100  3e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4291  oxidoreductase domain protein  29.14 
 
 		 317 aa  100  4e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.250893  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0657  oxidoreductase domain protein  26.43 
 
 		 320 aa  99.8  6e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.488554  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5773  oxidoreductase domain protein  25.53 
 
 		 345 aa  99.4  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4805  oxidoreductase domain-containing protein  27.65 
 
 		 341 aa  98.6  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.468504  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09533  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family protein  26.67 
 
 		 319 aa  98.6  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1256  dehydrogenase  27.81 
 
 		 316 aa  97.8  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00213509  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1065  oxidoreductase domain protein  30.56 
 
 		 341 aa  97.8  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2352  oxidoreductase-like  26.1 
 
 		 310 aa  97.1  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1174  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.68 
 
 		 317 aa  96.7  5e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1150  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  34.21 
 
 		 352 aa  95.5  1e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.651822 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1986  oxidoreductase domain protein  24.84 
 
 		 344 aa  95.5  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00630154 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3022  oxidoreductase domain-containing protein  29.01 
 
 		 322 aa  95.1  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00116221  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6223  oxidoreductase domain protein  25.87 
 
 		 345 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323534  normal  0.274066 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0993  oxidoreductase domain protein  27.06 
 
 		 344 aa  94.4  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1704  oxidoreductase domain-containing protein  28.67 
 
 		 344 aa  94.4  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6419  oxidoreductase domain protein  25.58 
 
 		 345 aa  94.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.477739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1110  oxidoreductase domain-containing protein  27.57 
 
 		 353 aa  95.1  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1013  oxidoreductase domain-containing protein  27.67 
 
 		 337 aa  94.7  2e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5946  oxidoreductase domain protein  27.95 
 
 		 355 aa  95.1  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0234266 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1397  oxidoreductase domain-containing protein  25.65 
 
 		 352 aa  94.4  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2838  oxidoreductase domain-containing protein  28.08 
 
 		 318 aa  94.4  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  26.2 
 
 		 350 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3468  oxidoreductase domain protein  24.93 
 
 		 345 aa  92.8  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  25.98 
 
 		 350 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>