234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0960 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0960  hypothetical protein  100 
 
 		 219 aa  420  1e-117  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.239073  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0054  protein of unknown function UPF0029  68.25 
 
 		 206 aa  229  3e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00609862 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06100  conserved hypothetical protein TIGR00257  57.21 
 
 		 210 aa  219  3.9999999999999997e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3242  protein of unknown function UPF0029  42.79 
 
 		 213 aa  168  7e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3045  protein of unknown function UPF0029  40.28 
 
 		 211 aa  167  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0019281  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3734  hypothetical protein  39.13 
 
 		 212 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11160  conserved hypothetical protein TIGR00257  53.33 
 
 		 233 aa  164  1.0000000000000001e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.9655  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5502  protein of unknown function UPF0029  47.44 
 
 		 209 aa  162  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5318  conserved hypothetical protein TIGR00257  39.22 
 
 		 211 aa  161  9e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4991  hypothetical protein  38.65 
 
 		 211 aa  160  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2757  hypothetical protein  47.14 
 
 		 213 aa  160  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5305  hypothetical protein  38.24 
 
 		 211 aa  159  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5363  conserved hypothetical protein TIGR00257  38.24 
 
 		 211 aa  159  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4876  hypothetical protein  38.24 
 
 		 211 aa  159  4e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4891  hypothetical protein  38.24 
 
 		 211 aa  159  4e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5287  conserved hypothetical protein TIGR00257  38.24 
 
 		 211 aa  159  4e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000948336 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5046  hypothetical protein  38.24 
 
 		 211 aa  158  7e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5431  hypothetical protein  38.24 
 
 		 211 aa  158  7e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5641  hypothetical protein TIGR00257  38.73 
 
 		 211 aa  157  9e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.989891  hitchhiker  0.000000000000266179 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2068  hypothetical protein  49.1 
 
 		 232 aa  157  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0096752  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1806  protein of unknown function UPF0029  49.1 
 
 		 233 aa  151  8.999999999999999e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000000629698 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17110  hypothetical protein  46.6 
 
 		 212 aa  151  8.999999999999999e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.46381 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1191  hypothetical protein  39.59 
 
 		 211 aa  149  5e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.952586  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0084  protein of unknown function UPF0029  44.22 
 
 		 212 aa  148  6e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0405  hypothetical protein  37.44 
 
 		 208 aa  145  5e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0134  protein of unknown function UPF0029  35.96 
 
 		 207 aa  145  5e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000670968  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0335  hypothetical protein  37.67 
 
 		 214 aa  142  6e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1793  protein of unknown function UPF0029  49.3 
 
 		 215 aa  141  7e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.128113  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4048  hypothetical protein  44.71 
 
 		 209 aa  138  7e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173399  decreased coverage  0.000882934 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0733  hypothetical protein  42.86 
 
 		 212 aa  133  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000337539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0180  protein of unknown function UPF0029  39.22 
 
 		 216 aa  129  4.0000000000000003e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.190284  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3185  hypothetical protein  50 
 
 		 199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0320756  hitchhiker  0.00000000052125 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0004  protein of unknown function UPF0029  40.76 
 
 		 210 aa  126  2.0000000000000002e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.528127 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0415  hypothetical protein  33.33 
 
 		 213 aa  126  3e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2078  hypothetical protein  37.24 
 
 		 219 aa  126  3e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0813  protein of unknown function UPF0029  35.5 
 
 		 206 aa  124  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0467204  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1310  hypothetical protein  36.95 
 
 		 205 aa  123  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00619746  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0246  hypothetical protein  36.22 
 
 		 211 aa  121  9e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4229  hypothetical protein  37.95 
 
 		 204 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000219511  normal  0.021598 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0361  hypothetical protein  35.48 
 
 		 210 aa  120  9.999999999999999e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4042  hypothetical protein  40.11 
 
 		 203 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0955788  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24840  hypothetical protein  38.64 
 
 		 225 aa  118  4.9999999999999996e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.070142  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0499  hypothetical protein  35.81 
 
 		 218 aa  118  7.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000766856  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12020  conserved hypothetical protein TIGR00257  33.18 
 
 		 208 aa  117  9e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3148  protein of unknown function UPF0029  41.88 
 
 		 194 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2891  hypothetical protein  38.25 
 
 		 205 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1335  hypothetical protein  28.57 
 
 		 221 aa  116  3e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000275512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3177  protein of unknown function UPF0029  40.58 
 
 		 274 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3947  hypothetical protein  40.74 
 
 		 204 aa  115  5e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.037804  decreased coverage  0.00180988 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4232  hypothetical protein  39.57 
 
 		 203 aa  115  7.999999999999999e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0996008  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4174  hypothetical protein  40.74 
 
 		 195 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.388301  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3325  hypothetical protein  40.74 
 
 		 195 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0536454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4192  hypothetical protein  40.74 
 
 		 195 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.343369 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1716  hypothetical protein  45.7 
 
 		 206 aa  113  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0789  hypothetical protein  33.66 
 
 		 213 aa  112  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0502356  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0772  hypothetical protein  33.66 
 
 		 213 aa  112  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.540579  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1146  hypothetical protein  43.02 
 
 		 204 aa  112  5e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3475  protein of unknown function UPF0029  41.36 
 
 		 194 aa  112  5e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1444  hypothetical protein  35.75 
 
 		 216 aa  112  6e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1183  hypothetical protein  36.75 
 
 		 200 aa  111  7.000000000000001e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.895174  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1832  hypothetical protein  38.62 
 
 		 195 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971114  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4071  hypothetical protein  39.68 
 
 		 195 aa  111  9e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0233425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1280  protein of unknown function UPF0029  47.65 
 
 		 214 aa  110  1.0000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.313223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00461  hypothetical protein  38.12 
 
 		 207 aa  109  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5111  hypothetical protein  39.11 
 
 		 213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.335458  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2244  hypothetical protein  37.69 
 
 		 194 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18640  hypothetical protein  45.36 
 
 		 231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.685754  normal  0.475195 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0268  protein of unknown function UPF0029  38.03 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6009  protein of unknown function UPF0029  37.69 
 
 		 239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.69631 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0023  hypothetical protein  33.99 
 
 		 204 aa  109  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1076  protein of unknown function UPF0029  27.51 
 
 		 192 aa  109  3e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3596  hypothetical protein  39.68 
 
 		 195 aa  109  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466647  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3277  hypothetical protein  41.05 
 
 		 195 aa  108  5e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.78794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3848  hypothetical protein  40.33 
 
 		 290 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.128299  normal  0.727016 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3825  hypothetical protein  39.89 
 
 		 245 aa  108  9.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0366225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0264  hypothetical protein  37.87 
 
 		 204 aa  108  9.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00131939  normal  0.0250602 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0899  protein of unknown function UPF0029  39.8 
 
 		 211 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000186376  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2729  hypothetical protein  34.11 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0015  hypothetical protein  32.51 
 
 		 204 aa  107  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.191945  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4412  hypothetical protein  39.29 
 
 		 195 aa  107  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0944  hypothetical protein  39.36 
 
 		 242 aa  106  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.404461 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2997  protein of unknown function UPF0029  44.08 
 
 		 211 aa  106  3e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3899  hypothetical protein  37.87 
 
 		 204 aa  105  5e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00283954  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0025  hypothetical protein  33.33 
 
 		 204 aa  104  9e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.224364  normal  0.033343 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1558  protein of unknown function UPF0029  38.31 
 
 		 203 aa  103  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.17892  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4318  hypothetical protein  38.46 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000068448  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5287  hypothetical protein  38.46 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00411387  hitchhiker  0.00913074 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4071  hypothetical protein  38.46 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000121216  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0022  protein of unknown function UPF0029  34.48 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000169816 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4162  hypothetical protein  38.46 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0381893  hitchhiker  0.0000831038 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4367  hypothetical protein  38.46 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000932269  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0018  hypothetical protein  34.48 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.919089  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3745  hypothetical protein  39.05 
 
 		 204 aa  103  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00302159  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4133  protein of unknown function UPF0029  38.46 
 
 		 204 aa  102  4e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0235776  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1630  protein of unknown function UPF0029  38.54 
 
 		 197 aa  102  4e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.329042  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4183  protein of unknown function UPF0029  57.79 
 
 		 201 aa  102  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.630826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3931  hypothetical protein  32.02 
 
 		 203 aa  102  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.457043  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3042  hypothetical protein  36.65 
 
 		 200 aa  102  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1914  hypothetical protein  32.02 
 
 		 203 aa  102  4e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00064118  normal  0.0316098 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0285  hypothetical protein  32.02 
 
 		 203 aa  102  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000001725  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>