130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0415 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0415  hypothetical protein  100 
 
 		 203 aa  390  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.237491  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0703  protein of unknown function DUF161  49.01 
 
 		 204 aa  193  2e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0736  protein of unknown function DUF161  49.74 
 
 		 204 aa  187  5.999999999999999e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3641  protein of unknown function DUF161  47.92 
 
 		 204 aa  186  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.992222  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3503  hypothetical protein  49.21 
 
 		 204 aa  185  4e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2596  hypothetical protein  49.22 
 
 		 208 aa  184  8e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.166389  normal  0.516686 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1212  protein of unknown function DUF161  49.22 
 
 		 208 aa  184  8e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00200303  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1814  hypothetical protein  50.26 
 
 		 212 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.0045868  normal  0.591821 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3591  protein of unknown function DUF161  49.74 
 
 		 222 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.827166  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4668  protein of unknown function DUF161  49.74 
 
 		 222 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.116519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1417  hypothetical protein  43.08 
 
 		 206 aa  177  1e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.895878 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3745  protein of unknown function DUF161  59.49 
 
 		 233 aa  173  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.416302  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4208  hypothetical protein  46.63 
 
 		 215 aa  168  6e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0398  hypothetical protein  46.35 
 
 		 209 aa  168  6e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.178289 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03480  hypothetical protein  43.88 
 
 		 211 aa  166  2e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.44503 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000952  membrane protein  44.1 
 
 		 202 aa  164  8e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.876518  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0865  putative ABC transporter permease  47.15 
 
 		 202 aa  164  9e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0213  hypothetical protein  42.93 
 
 		 233 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0630  hypothetical protein  41.09 
 
 		 257 aa  162  5.0000000000000005e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0937  protein of unknown function DUF161  41.98 
 
 		 235 aa  160  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.255406 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0627  hypothetical protein  40.59 
 
 		 217 aa  159  2e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0612  hypothetical protein  43.15 
 
 		 215 aa  158  6e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06994  hypothetical protein  44.1 
 
 		 202 aa  157  7e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4225  hypothetical protein  43.94 
 
 		 203 aa  155  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2652  hypothetical protein  38.61 
 
 		 217 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0050  protein of unknown function DUF161  47.42 
 
 		 212 aa  152  2.9999999999999998e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.404169  normal  0.436132 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01207  hypothetical protein  46.15 
 
 		 200 aa  150  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1637  hypothetical protein  42.65 
 
 		 208 aa  149  3e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000053211 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3339  hypothetical protein  45.31 
 
 		 211 aa  149  4e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0159798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4349  protein of unknown function DUF161  46.39 
 
 		 202 aa  149  4e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.565468  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01995  hypothetical protein  40.09 
 
 		 238 aa  148  5e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004231  membrane protein  45.64 
 
 		 205 aa  146  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000240279  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0231  protein of unknown function DUF161  39.59 
 
 		 210 aa  145  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0464  hypothetical protein  44.33 
 
 		 198 aa  141  8e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0156  hypothetical protein  42.13 
 
 		 211 aa  140  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.583878 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0201  protein of unknown function DUF161  40.62 
 
 		 210 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.186223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4648  protein of unknown function DUF161  39.18 
 
 		 237 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.422653 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2100  hypothetical protein  40.51 
 
 		 200 aa  138  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.250211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0447  hypothetical protein  40.51 
 
 		 200 aa  137  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2368  hypothetical protein  40.1 
 
 		 204 aa  137  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.421658 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0592  hypothetical protein  38.58 
 
 		 214 aa  136  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0421  hypothetical protein  38.86 
 
 		 202 aa  133  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.489606  normal  0.0351705 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3416  protein of unknown function DUF161  70.83 
 
 		 109 aa  134  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0227  protein of unknown function DUF161  42.56 
 
 		 211 aa  131  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2812  protein of unknown function DUF161  42.27 
 
 		 228 aa  131  7.999999999999999e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.181151  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3489  hypothetical protein  42.27 
 
 		 228 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.113853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0198  protein of unknown function DUF161  41.03 
 
 		 211 aa  127  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4040  hypothetical protein  39.06 
 
 		 201 aa  127  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3836  hypothetical protein  43.52 
 
 		 237 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.108091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1841  hypothetical protein  42.49 
 
 		 237 aa  125  4.0000000000000003e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.185131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00597  hypothetical protein  36.98 
 
 		 234 aa  123  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4357  protein of unknown function DUF161  41.36 
 
 		 209 aa  124  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247325  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0018  protein of unknown function DUF161  37.82 
 
 		 215 aa  121  8e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0284  hypothetical protein  38.92 
 
 		 217 aa  121  9e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.276593 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0642  hypothetical protein  36.92 
 
 		 204 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4626  hypothetical protein  40.31 
 
 		 239 aa  117  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.784951  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0017  protein of unknown function DUF161  36.79 
 
 		 215 aa  114  7.999999999999999e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.438672  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3383  hypothetical protein  34.78 
 
 		 200 aa  82.4  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.708574  normal  0.273555 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3276  hypothetical protein  39.23 
 
 		 229 aa  81.3  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.253906  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1662  Protein of unknown function DUF2179  30.51 
 
 		 292 aa  72  0.000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.242914  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2675  hypothetical protein  28.83 
 
 		 285 aa  65.5  0.0000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000375547  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1219  protein of unknown function DUF161  30.19 
 
 		 299 aa  65.1  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.929134  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1207  protein of unknown function DUF161  27.75 
 
 		 294 aa  65.1  0.0000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.772174  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2360  hypothetical protein  28.4 
 
 		 285 aa  63.9  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.411181  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0072  hypothetical protein  27.08 
 
 		 287 aa  64.3  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3076  hypothetical protein  28.25 
 
 		 283 aa  63.5  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000401824  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0235  hypothetical protein  33.55 
 
 		 281 aa  62.8  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0930  hypothetical protein  30.16 
 
 		 281 aa  61.2  0.000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0214742  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0707  protein of unknown function DUF161  29.68 
 
 		 296 aa  58.2  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1380  hypothetical protein  27.43 
 
 		 285 aa  57.8  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000107649  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3969  protein of unknown function DUF161  27.53 
 
 		 290 aa  57  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000285246  unclonable  0.000000000121594 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0468  Protein of unknown function DUF2179  28.1 
 
 		 287 aa  56.6  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4895  hypothetical protein  29.38 
 
 		 311 aa  56.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000776906  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0771  hypothetical protein  27.37 
 
 		 283 aa  56.6  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.103591  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1201  protein of unknown function DUF161  32.99 
 
 		 287 aa  54.7  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895465 
 
 
-
 
NC_002950  PG1953  YitT family protein  24.86 
 
 		 311 aa  54.7  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0103  protein of unknown function DUF161  29.63 
 
 		 279 aa  54.7  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0748  hypothetical protein  26.82 
 
 		 283 aa  53.5  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0644757  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1406  protein of unknown function DUF161  29.09 
 
 		 278 aa  53.9  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000114892  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3014  protein of unknown function DUF161  28.89 
 
 		 295 aa  53.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000325851  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2520  hypothetical protein  29.09 
 
 		 302 aa  52.4  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000786758  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0958  hypothetical protein  24.59 
 
 		 306 aa  52.4  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01860  hypothetical protein  24.86 
 
 		 323 aa  52.8  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.415337  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1705  hypothetical protein  23.46 
 
 		 288 aa  52.4  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0826  permease  28.85 
 
 		 322 aa  51.2  0.000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.668966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0880  hypothetical protein  30.2 
 
 		 285 aa  51.6  0.000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1067  hypothetical protein  29.53 
 
 		 333 aa  50.8  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1062  hypothetical protein  29.53 
 
 		 333 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1085  hypothetical protein  30.87 
 
 		 333 aa  50.4  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1171  hypothetical protein  29.53 
 
 		 285 aa  50.4  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0287  protein of unknown function DUF161  27.21 
 
 		 283 aa  50.1  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1245  hypothetical protein  28.86 
 
 		 285 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1282  hypothetical protein  30.2 
 
 		 285 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1322  hypothetical protein  30.2 
 
 		 285 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2353  protein of unknown function DUF161  23.46 
 
 		 191 aa  49.7  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1308  hypothetical protein  24.24 
 
 		 288 aa  49.3  0.00004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.493117  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1072  hypothetical protein  30.2 
 
 		 293 aa  49.3  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1217  hypothetical protein  35.2 
 
 		 285 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4124  hypothetical protein  34.4 
 
 		 285 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2105  hypothetical protein  24.74 
 
 		 290 aa  48.5  0.00007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.53861  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>