124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0050 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0050  Dyp-type peroxidase family protein  100 
 
 		 481 aa  980    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1778  Dyp-type peroxidase family  27.17 
 
 		 523 aa  67  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3404  Tat-translocated enzyme  29.74 
 
 		 422 aa  66.2  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.564575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1956  Tat-translocated enzyme  28.87 
 
 		 442 aa  65.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351506  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1916  Dyp-type peroxidase family  27.67 
 
 		 420 aa  65.9  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.171469 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1735  Dyp-type peroxidase family protein  28.35 
 
 		 434 aa  65.1  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.117857  normal  0.127678 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1950  Dyp-type peroxidase family protein  27.02 
 
 		 451 aa  64.7  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.309476 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2599  Tat-translocated enzyme  34.34 
 
 		 447 aa  63.9  0.000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3598  dyp-type peroxidase family protein  30.72 
 
 		 440 aa  63.5  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3369  twin-arginine translocation pathway signal:Tat-translocated enzyme:Dyp-type peroxidase  30.72 
 
 		 440 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0100762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2354  Dyp-type peroxidase  27.05 
 
 		 402 aa  63.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3347  Dyp-type peroxidase family  25.28 
 
 		 420 aa  62.8  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1566  Dyp-type peroxidase family  26.17 
 
 		 428 aa  59.7  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2262  Dyp-type peroxidase family protein  29.41 
 
 		 434 aa  59.3  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3900  Dyp-type peroxidase family  27.27 
 
 		 435 aa  59.3  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0223253 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2042  Dyp-type peroxidase family protein  29.41 
 
 		 434 aa  59.3  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.309874  normal  0.120372 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2364  Dyp-type peroxidase family protein  28.49 
 
 		 434 aa  59.7  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0124254  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01021  hypothetical protein  30.46 
 
 		 423 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.211947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2624  Dyp-type peroxidase family  30.46 
 
 		 423 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0746302  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0190  Tat-translocated enzyme  26.05 
 
 		 430 aa  58.9  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0695897 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1134  Tat-translocated enzyme  30.46 
 
 		 423 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0503262  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1138  Tat-translocated enzyme  30.46 
 
 		 423 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.798761  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7007  Dyp-type peroxidase family protein  26.69 
 
 		 484 aa  58.9  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.54132 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2577  Dyp-type peroxidase family protein  30.46 
 
 		 423 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.898799  normal  0.0884608 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1260  Tat-translocated enzyme  30.46 
 
 		 423 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.118013  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01028  hypothetical protein  30.46 
 
 		 423 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.250617  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3857  Dyp-type peroxidase family protein  31.87 
 
 		 444 aa  58.2  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.722047  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6261  Dyp-type peroxidase family  27.88 
 
 		 416 aa  58.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.148592 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1809  Dyp-type peroxidase family  31.17 
 
 		 433 aa  57.8  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.64569 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3579  Dyp-type peroxidase family  28.44 
 
 		 401 aa  57.8  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.519759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4014  Dyp-type peroxidase family protein  25.09 
 
 		 340 aa  56.6  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.881992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3350  Dyp-type peroxidase family  26.87 
 
 		 419 aa  56.2  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0334772  normal  0.260492 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2927  Dyp-type peroxidase family protein  32.03 
 
 		 430 aa  56.6  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000039916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2104  Tat-translocated enzyme  30.06 
 
 		 423 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3312  Tat-translocated enzyme  32.9 
 
 		 444 aa  55.8  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4775  Dyp-type peroxidase family protein  26.61 
 
 		 437 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1000  Dyp-type peroxidase family protein  23.26 
 
 		 311 aa  55.5  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.212693  hitchhiker  0.00012242 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2874  Tat-translocated enzyme  29.22 
 
 		 432 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.243637  normal  0.113701 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3064  Dyp-type peroxidase family  29.46 
 
 		 479 aa  54.7  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000193803  normal  0.0168206 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3278  Dyp-type peroxidase family protein  27.62 
 
 		 413 aa  54.7  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4911  Dyp-type peroxidase family  24.02 
 
 		 441 aa  53.9  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2976  iron-dependent peroxidase-like protein  26.97 
 
 		 470 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.675029 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0847  Dyp-type peroxidase family protein  23.3 
 
 		 311 aa  53.1  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0431  Dyp-type peroxidase family protein  36.09 
 
 		 412 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00775198 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3143  peroxidase  26.97 
 
 		 470 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2894  Dyp-type peroxidase  20.67 
 
 		 312 aa  52.4  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4243  Tat-translocated enzyme  30.07 
 
 		 419 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0670  melanin biosynthesis protein TyrA, putative  22.91 
 
 		 311 aa  52  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4329  Dyp-type peroxidase family protein  30.07 
 
 		 419 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.220799 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4622  Dyp-type peroxidase family protein  30.07 
 
 		 419 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.433468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1547  Dyp-type peroxidase family protein  28.49 
 
 		 427 aa  52.4  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.844225  normal  0.133092 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2284  Dyp-type peroxidase family  30 
 
 		 399 aa  52.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.289183 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00060  Dyp-type peroxidase protein  23 
 
 		 293 aa  52  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3166  Dyp-type peroxidase  24.4 
 
 		 295 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0949  Dyp-type peroxidase family protein  21.59 
 
 		 312 aa  51.6  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5684  Dyp-type peroxidase family  25.1 
 
 		 416 aa  51.6  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.242991  normal  0.629954 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0740  melanin biosynthesis protein TyrA, putative  22.01 
 
 		 311 aa  51.2  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0864  Dyp-type peroxidase family protein  21.84 
 
 		 314 aa  51.2  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.746492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4289  Dyp-type peroxidase family  26.36 
 
 		 441 aa  51.2  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2538  collagen adhesion protein  41.79 
 
 		 729 aa  50.4  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4595  Dyp-type peroxidase family  26.62 
 
 		 356 aa  50.8  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.264848  hitchhiker  0.006941 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0639  Dyp-type peroxidase family protein  21.51 
 
 		 312 aa  50.4  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.969415  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0605  Dyp-type peroxidase family protein  20.94 
 
 		 311 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3689  Dyp-type peroxidase family protein  20.94 
 
 		 311 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4860  Dyp-type peroxidase family protein  22.75 
 
 		 323 aa  49.7  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.445339  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3813  Dyp-type peroxidase family protein  20.94 
 
 		 311 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3631  Dyp-type peroxidase family  20.94 
 
 		 306 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2785  collagen adhesion protein  42.65 
 
 		 731 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000103583 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5207  collagen adhesion protein, C-terminal  34.48 
 
 		 882 aa  49.3  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7482  Dyp-type peroxidase family  29.94 
 
 		 416 aa  49.3  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1591  Dyp-type peroxidase family  25.13 
 
 		 346 aa  49.3  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1399  Dyp-type peroxidase family protein  25.25 
 
 		 299 aa  48.5  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.55791  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2298  Dyp-type peroxidase  22.76 
 
 		 293 aa  47.8  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.427507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2590  Dyp-type peroxidase family protein  25.65 
 
 		 408 aa  47.8  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.656112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1292  Dyp-type peroxidase family protein  25.43 
 
 		 299 aa  48.1  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.465558  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5449  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  30.77 
 
 		 3486 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1662  Dyp-type peroxidase family  32.32 
 
 		 413 aa  48.1  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5039  collagen adhesion protein  34.48 
 
 		 3333 aa  47.4  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5055  collagen adhesion protein  30.77 
 
 		 3393 aa  47.8  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2782  Dyp-type peroxidase family  28.16 
 
 		 437 aa  47.8  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0473  Dyp-type peroxidase  21.27 
 
 		 307 aa  47.4  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2525  Dyp-type peroxidase family protein  28.45 
 
 		 294 aa  47.4  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.798817  normal  0.073876 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5536  collagen adhesion protein  34.48 
 
 		 3392 aa  47.4  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39250  Dyp-type peroxidase family  26.59 
 
 		 404 aa  47  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.804187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1627  Dyp-type peroxidase family protein  25.98 
 
 		 344 aa  47  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.567886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2777  hypothetical protein  27.64 
 
 		 299 aa  47.4  0.0007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00125127 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5122  Dyp-type peroxidase family protein  24.77 
 
 		 341 aa  47  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.963646  normal  0.469662 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1023  hypothetical protein  26.13 
 
 		 401 aa  46.6  0.0009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0392  Dyp-type peroxidase family protein  28.29 
 
 		 409 aa  47  0.0009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0402  Dyp-type peroxidase family protein  28.29 
 
 		 409 aa  47  0.0009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2498  twin-arginine translocation pathway signal  26.67 
 
 		 442 aa  46.2  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.486253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3343  Dyp-type peroxidase family protein  20.75 
 
 		 313 aa  46.6  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0610  Dyp-type peroxidase family protein  20.75 
 
 		 313 aa  46.6  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3513  Dyp-type peroxidase family protein  20.75 
 
 		 313 aa  46.6  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5471  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  32.18 
 
 		 3190 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194019 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3145  Dyp-type peroxidase family  29.51 
 
 		 431 aa  46.6  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.84986  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4196  peroxidase  24.82 
 
 		 469 aa  45.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.738897  hitchhiker  0.00759418 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3223  Dyp-type peroxidase family protein  20.86 
 
 		 311 aa  45.8  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5487  cell wall anchor domain-containing protein  34.48 
 
 		 3242 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4565  Dyp-type peroxidase  22.95 
 
 		 293 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>