More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0302 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1935  aspartyl-tRNA synthetase  59.63 
 
 
592 aa  741  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0176325  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0691  aspartyl-tRNA synthetase  62.63 
 
 
600 aa  760  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.832914  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0675  aspartyl-tRNA synthetase  62.63 
 
 
600 aa  761  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2038  aspartyl-tRNA synthetase  60.48 
 
 
592 aa  748  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.323108  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2326  aspartyl-tRNA synthetase  62.63 
 
 
600 aa  760  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1070  aspartyl-tRNA synthetase  59.46 
 
 
599 aa  716  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.171076  normal  0.17773 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01727  aspartyl-tRNA synthetase  59.97 
 
 
586 aa  737  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2903  aspartyl-tRNA synthetase  55.74 
 
 
593 aa  674  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  4.05553e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1346  aspartyl-tRNA synthetase  55.29 
 
 
590 aa  682  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0494228  hitchhiker  0.00190768 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2055  aspartyl-tRNA synthetase  55.29 
 
 
590 aa  682  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2406  aspartyl-tRNA synthetase  62.63 
 
 
600 aa  760  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2434  aspartyl-tRNA synthetase  56.63 
 
 
590 aa  687  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0126074  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1622  aspartyl-tRNA synthetase  55.24 
 
 
598 aa  662  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  2.05655e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1892  aspartyl-tRNA synthetase  60.57 
 
 
599 aa  753  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00404218  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3132  aspartyl-tRNA synthetase  55.1 
 
 
583 aa  647  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2060  aspartyl-tRNA synthetase  55.29 
 
 
590 aa  682  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0198036 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0757  aspartyl-tRNA synthetase  54.87 
 
 
600 aa  660  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000505912  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2079  aspartyl-tRNA synthetase  60.31 
 
 
592 aa  737  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.725699  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2115  aspartyl-tRNA synthetase  55.29 
 
 
590 aa  682  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00789525 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2226  aspartyl-tRNA synthetase  66.89 
 
 
617 aa  827  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.544329  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0057  aspartyl-tRNA synthetase  62.07 
 
 
596 aa  754  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  2.41419e-07  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1326  aspartyl-tRNA synthetase  58.29 
 
 
604 aa  694  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2329  aspartyl-tRNA synthetase  56.3 
 
 
594 aa  666  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  2.45437e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1170  aspartyl-tRNA synthetase  60.8 
 
 
599 aa  756  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2040  aspartyl-tRNA synthetase  60.31 
 
 
592 aa  746  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00291501  hitchhiker  1.15872e-07 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1953  aspartyl-tRNA synthetase  60.24 
 
 
591 aa  748  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.154117  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0942  aspartyl-tRNA synthetase  55.03 
 
 
607 aa  637  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0078454  hitchhiker  0.00866297 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1222  aspartyl-tRNA synthetase  55.46 
 
 
590 aa  684  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.241157  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3302  aspartyl-tRNA synthetase  55.71 
 
 
613 aa  671  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.69725 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2725  aspartyl-tRNA synthetase  62.29 
 
 
600 aa  756  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0872752  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1843  aspartyl-tRNA synthetase  59.8 
 
 
591 aa  738  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.986528  normal  0.35056 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2602  aspartyl-tRNA synthetase  55.63 
 
 
590 aa  682  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.445839  normal  0.911145 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2752  aspartyl-tRNA synthetase  62.63 
 
 
600 aa  760  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0874  aspartyl-tRNA synthetase  60.5 
 
 
603 aa  721  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.104539  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0787  aspartyl-tRNA synthetase  60.77 
 
 
605 aa  739  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.574625  normal  0.685476 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3637  aspartyl-tRNA synthetase  60 
 
 
604 aa  718  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0028  aspartyl-tRNA synthetase  54.16 
 
 
610 aa  647  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.607813  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1707  aspartyl-tRNA synthetase  67.28 
 
 
599 aa  830  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  4.68378e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1886  aspartyl-tRNA synthetase  56.71 
 
 
591 aa  684  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0699  aspartyl-tRNA synthetase  58.77 
 
 
592 aa  714  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0056  aspartyl-tRNA synthetase  62.07 
 
 
596 aa  754  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.524796  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1268  aspartyl-tRNA synthetase  64.08 
 
 
591 aa  773  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.132766  normal  0.965215 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2426  aspartyl-tRNA synthetase  56.63 
 
 
598 aa  690  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0626295  normal  0.119978 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2781  aspartyl-tRNA synthetase  56.13 
 
 
593 aa  680  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.332179  normal  0.0858323 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2030  aspartyl-tRNA synthetase  59.11 
 
 
595 aa  727  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.019591  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1320  aspartyl-tRNA synthetase  55.63 
 
 
590 aa  682  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2096  aspartyl-tRNA synthetase  55.63 
 
 
590 aa  682  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.356263  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1959  aspartyl-tRNA synthetase  55.46 
 
 
590 aa  679  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.9398  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01597  aspartyl-tRNA synthetase  57.31 
 
 
592 aa  686  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4002  aspartyl-tRNA synthetase  62.94 
 
 
591 aa  760  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0423  aspartyl-tRNA synthetase  62.48 
 
 
610 aa  764  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  9.68757e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2366  aspartyl-tRNA synthetase  59.45 
 
 
597 aa  733  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00207934  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0670  aspartyl-tRNA synthetase  55.37 
 
 
597 aa  657  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  4.45499e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1751  aspartyl-tRNA synthetase  62.65 
 
 
590 aa  766  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  1.2582e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0574  aspartyl-tRNA synthetase  62.46 
 
 
600 aa  756  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0673836  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1473  aspartyl-tRNA synthetase  49.74 
 
 
592 aa  637  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0686129  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5453  aspartyl-tRNA synthetase  60.74 
 
 
600 aa  728  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4205  aspartyl-tRNA synthetase  63.28 
 
 
591 aa  764  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.103347  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2423  aspartyl-tRNA synthetase  60.31 
 
 
592 aa  747  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  6.67018e-05  normal  0.106149 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2148  aspartyl-tRNA synthetase  56.63 
 
 
598 aa  691  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1766  aspartyl-tRNA synthetase  55.63 
 
 
590 aa  682  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.836624  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2575  aspartyl-tRNA synthetase  59.28 
 
 
595 aa  729  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  1.63507e-05  hitchhiker  0.000702641 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2752  aspartyl-tRNA synthetase  62.46 
 
 
600 aa  758  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.314882  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2035  aspartyl-tRNA synthetase  56.63 
 
 
598 aa  690  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.1996  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0656  aspartyl-tRNA synthetase  61.95 
 
 
599 aa  758  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654045  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0341  aspartyl-tRNA synthetase  61.38 
 
 
623 aa  751  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1242  aspartyl-tRNA synthetase  63.62 
 
 
591 aa  769  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.276348  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1687  aspartyl-tRNA synthetase  53.9 
 
 
588 aa  649  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  2.35097e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01552  aspartyl-tRNA synthetase  54.22 
 
 
588 aa  637  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.744907  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2196  aspartyl-tRNA synthetase  55.04 
 
 
593 aa  668  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  2.00775e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0735  aspartyl-tRNA synthetase  57.31 
 
 
591 aa  700  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  3.82007e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1292  aspartyl-tRNA synthetase  52.8 
 
 
585 aa  642  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0991  aspartyl-tRNA synthetase  60.7 
 
 
601 aa  767  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  1.25703e-08  unclonable  1.15783e-09 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1106  aspartyl-tRNA synthetase  55.63 
 
 
590 aa  682  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4013  aspartyl-tRNA synthetase  58.46 
 
 
598 aa  721  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.44023e-06 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1597  aspartyl-tRNA synthetase  60.13 
 
 
600 aa  749  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.566711 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2307  aspartyl-tRNA synthetase  60.31 
 
 
592 aa  746  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  2.41226e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2643  aspartyl-tRNA synthetase  62.46 
 
 
600 aa  758  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21858  normal  0.167975 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4545  aspartyl-tRNA synthetase  63.27 
 
 
590 aa  764  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.486893  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2187  aspartyl-tRNA synthetase  64.35 
 
 
590 aa  789  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  1.46204e-05  normal  0.319945 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1720  aspartyl-tRNA synthetase  53.9 
 
 
588 aa  649  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  2.19088e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0381  aspartyl-tRNA synthetase  62.12 
 
 
599 aa  760  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26589  normal  0.586164 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0150  aspartyl-tRNA synthetase  52.02 
 
 
602 aa  650  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00425968  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01837  aspartyl-tRNA synthetase  55.46 
 
 
590 aa  679  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0439  aspartyl-tRNA synthetase  59.7 
 
 
602 aa  739  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.142464  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0442  aspartyl-tRNA synthetase  59.7 
 
 
597 aa  749  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.967913 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0852  aspartyl-tRNA synthetase  62.63 
 
 
598 aa  759  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.591723  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0302  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 
595 aa  1209  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0234684  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4411  aspartyl-tRNA synthetase  63.11 
 
 
591 aa  760  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00200172  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1040  aspartyl-tRNA synthetase  54.19 
 
 
596 aa  655  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.0223e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6052  aspartyl-tRNA synthetase  62.46 
 
 
600 aa  757  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2184  aspartyl-tRNA synthetase  58.6 
 
 
591 aa  719  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1357  aspartyl-tRNA synthetase  55.37 
 
 
594 aa  662  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.12068e-12  unclonable  2.29944e-22 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0012  aspartyl-tRNA synthetase  54.76 
 
 
606 aa  652  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00181386  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0890  aspartyl-tRNA synthetase  60.17 
 
 
596 aa  745  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  7.08268e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1776  aspartyl-tRNA synthetase  68.25 
 
 
599 aa  834  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2839  aspartyl-tRNA synthetase  55.27 
 
 
598 aa  656  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1322  aspartyl-tRNA synthetase  55.57 
 
 
593 aa  673  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34967e-29 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1815  aspartyl-tRNA synthetase  57.31 
 
 
598 aa  701  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0603  aspartyl-tRNA synthetase  62.24 
 
 
588 aa  769  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>