192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_1058 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_1058  TrkA-N domain protein  100 
 
 
396 aa  765    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0577  TrkA-N domain protein  39.43 
 
 
395 aa  216  5e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2970  TrkA-N domain protein  40.85 
 
 
393 aa  209  7e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.489017  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2999  TrkA-N domain protein  41.05 
 
 
388 aa  208  1e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1993  TrkA-N domain protein  35.53 
 
 
399 aa  202  8e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0873902 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1529  TrkA-N domain protein  35.96 
 
 
395 aa  187  4e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.479554  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2691  voltage-gated potassium channel  29.97 
 
 
420 aa  120  6e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0127487 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3093  voltage-gated potassium channel  29.97 
 
 
420 aa  120  6e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1419  voltage-gated potassium channel  30.07 
 
 
417 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0226544  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01224  voltage-gated potassium channel  30.07 
 
 
417 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308891  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2398  TrkA-N domain protein  30.07 
 
 
417 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00329227  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2377  voltage-gated potassium channel  30.07 
 
 
417 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.408742  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01234  hypothetical protein  30.07 
 
 
417 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.302174  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1359  voltage-gated potassium channel  30.07 
 
 
417 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000079785  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1890  voltage-gated potassium channel  30.07 
 
 
402 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0139159 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1737  voltage-gated potassium channel  30.07 
 
 
402 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000607493  normal  0.0325074 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1398  voltage-gated potassium channel  30.07 
 
 
417 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.488594  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0391  voltage-gated potassium channel  33.47 
 
 
416 aa  102  8e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.131379  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2922  voltage-gated potassium channel  31.15 
 
 
408 aa  101  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2537  voltage-gated potassium channel  31.15 
 
 
438 aa  100  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.863959  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3716  voltage-gated potassium channel  29.25 
 
 
391 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.947773 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1715  voltage-gated potassium channel  29.78 
 
 
391 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3219  voltage-gated potassium channel  29.8 
 
 
391 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.630222 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1141  voltage-gated potassium channel  24.76 
 
 
391 aa  83.6  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.378703  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3564  voltage-gated potassium channel  24.76 
 
 
391 aa  83.6  0.000000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00301941  normal  0.450959 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1087  voltage-gated potassium channel  24.76 
 
 
391 aa  83.6  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4068  voltage-gated potassium channel  29.8 
 
 
391 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4298  voltage-gated potassium channel  29.8 
 
 
391 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  28.22 
 
 
335 aa  82  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  27.72 
 
 
335 aa  80.1  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0361  TrkA-N domain protein  30 
 
 
356 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00100  potassium channel protein  26.61 
 
 
335 aa  79.3  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0368  TrkA-N domain protein  29.67 
 
 
356 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4160  TrkA domain-containing protein  28.07 
 
 
351 aa  77.4  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3127  K+ transport systems, NAD-binding component  29.29 
 
 
337 aa  75.9  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0063  TrkA family potassium uptake protein  29.08 
 
 
351 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  30.89 
 
 
347 aa  75.9  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  28.14 
 
 
337 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  30.3 
 
 
332 aa  74.7  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  26.73 
 
 
335 aa  74.3  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  27.64 
 
 
330 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2971  TrkA domain-containing protein  27.78 
 
 
350 aa  73.6  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  27.64 
 
 
330 aa  73.6  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5153  TrkA-N domain protein  28.11 
 
 
355 aa  72.8  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000053583 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0451  TrkA domain-containing protein  26.19 
 
 
336 aa  72.8  0.00000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.278158  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  27.64 
 
 
330 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  27.64 
 
 
334 aa  72  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  27.64 
 
 
334 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3731  hypothetical protein  28.23 
 
 
338 aa  71.6  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000159336  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2095  TrkA family potassium uptake protein  31.28 
 
 
346 aa  71.6  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188907  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  31.66 
 
 
346 aa  72  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3113  potassium channel protein  26.64 
 
 
347 aa  71.2  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.144823  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  30.04 
 
 
350 aa  71.2  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  27.31 
 
 
330 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1520  TrkA domain-containing protein  22.67 
 
 
324 aa  70.5  0.00000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.639077  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2680  TrkA domain-containing protein  26.29 
 
 
397 aa  70.5  0.00000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000721375  normal  0.421945 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  30.2 
 
 
371 aa  69.3  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  27.14 
 
 
330 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0419  TrkA-N domain protein  29.03 
 
 
313 aa  68.2  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0117  TrkA-N domain protein  29.02 
 
 
345 aa  68.6  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3794  TrkA-N domain protein  29.44 
 
 
350 aa  67  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.434274  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3877  TrkA-N domain protein  29.44 
 
 
350 aa  66.6  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.705897 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1634  TrkA domain-containing protein  26.56 
 
 
339 aa  66.6  0.0000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.853014  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  26.54 
 
 
350 aa  66.2  0.0000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1120  TrkA-N domain protein  27.23 
 
 
335 aa  65.1  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000439413  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2888  TrkA-N  28.22 
 
 
357 aa  64.7  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1045  TrkA domain-containing protein  30.57 
 
 
350 aa  65.1  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000596347  hitchhiker  0.00364441 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3680  TrkA domain-containing protein  28.16 
 
 
509 aa  65.1  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3347  TrkA-N  23.38 
 
 
352 aa  64.3  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.220422  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1196  TrkA-N domain protein  28.28 
 
 
569 aa  64.7  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3004  TrkA-N domain-containing protein  24.55 
 
 
354 aa  64.7  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5545  TrkA-N domain protein  31.63 
 
 
341 aa  62  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.789205 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08671  VIC family potassium channel protein  24.58 
 
 
351 aa  61.2  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0453  Ion transport 2 domain protein  27.78 
 
 
347 aa  61.2  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06531  putative potassium channel, VIC family protein  30 
 
 
359 aa  61.2  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0527  TrkA domain-containing protein  26.36 
 
 
564 aa  60.8  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.630061  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  25.36 
 
 
325 aa  60.5  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2743  TrkA domain-containing protein  27.63 
 
 
333 aa  60.1  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4403  TrkA domain-containing protein  29.2 
 
 
341 aa  60.1  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.602366  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  24.14 
 
 
341 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2854  TrkA-N domain protein  26.39 
 
 
331 aa  59.3  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1744  VIC family potassium channel protein  29.23 
 
 
352 aa  58.9  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1456  Ion transport 2 domain protein  26 
 
 
405 aa  58.9  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0715  VIC family potassium channel protein  25.49 
 
 
351 aa  58.2  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.4714  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3909  TrkA domain-containing protein  26.47 
 
 
355 aa  58.2  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0877338 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07711  VIC family potassium channel protein  25.49 
 
 
351 aa  58.2  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  25.74 
 
 
332 aa  57.4  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0720  TrkA-N  27.18 
 
 
355 aa  57  0.0000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07731  VIC family potassium channel protein  25.49 
 
 
351 aa  56.6  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0396  TrkA domain-containing protein  28.77 
 
 
457 aa  56.6  0.0000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2518  TrkA-N domain protein  27.71 
 
 
362 aa  56.2  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1364  TrkA domain-containing protein  28.57 
 
 
369 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1332  TrkA-N:Ion transport protein  26.32 
 
 
517 aa  55.1  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.478947  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14401  K+ transport system, NAD-binding component  28.22 
 
 
352 aa  54.7  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000716154 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1293  TrkA domain-containing protein  28.1 
 
 
326 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0270  putative potassium channel protein  28.1 
 
 
326 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.435171  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0542  TrkA domain-containing protein  28.1 
 
 
326 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1025  putative potassium channel protein  28.1 
 
 
326 aa  54.7  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2540  TrkA domain-containing protein  28.1 
 
 
369 aa  54.3  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0305515  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1162  TrkA-like protein  29.76 
 
 
386 aa  54.3  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.30388 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>