More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0024 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_0024  CBS:transporter-associated  100 
 
 
374 aa  739  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0017  ctransporter-associated region  88.74 
 
 
375 aa  649  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0674373 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0449  CBS domain containing protein  76.4 
 
 
381 aa  528  1e-149  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0471  CBS  67.82 
 
 
420 aa  518  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.603908 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0239  HlyC/CorC family transporters  76.5 
 
 
375 aa  511  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0593  HlyC/CorC family transporter  77.43 
 
 
376 aa  513  1e-144  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0049  transporter  78.06 
 
 
386 aa  494  1e-138  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1813  CBS domain-containing protein  53.8 
 
 
324 aa  285  7e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.345805  normal  0.271676 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0636  CBS domain-containing protein  49.07 
 
 
377 aa  276  3e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.693928 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2894  CBS domain containing protein  51.41 
 
 
357 aa  276  5e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.594512 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0232  CBS domain containing protein  49.69 
 
 
373 aa  276  5e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.1637  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3179  CBS domain-containing protein  46.73 
 
 
389 aa  270  4e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0353609  normal  0.0370442 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3207  CBS domain-containing protein  47.35 
 
 
382 aa  269  5e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.403327  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3531  CBS domain containing protein  47.35 
 
 
382 aa  269  5e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.307837  normal  0.3242 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3402  CBS domain containing protein  46.75 
 
 
384 aa  267  2e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.224461  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3620  CBS domain-containing protein  49.83 
 
 
319 aa  264  1e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0043  CBS domain-containing protein  50.62 
 
 
391 aa  264  2e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0313302  hitchhiker  1.14145e-09 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1058  CBS domain-containing protein  47.48 
 
 
344 aa  259  4e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.279471  normal  0.884616 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0755  CBS domain-containing protein  45.36 
 
 
373 aa  258  1e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0441  hemolysin  48.84 
 
 
345 aa  252  8e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.327012  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3922  transporter-associated region  49.39 
 
 
353 aa  251  1e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2069  CBS domain-containing protein  51.22 
 
 
374 aa  249  4e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00161693  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0016  transporter-associated region  49.21 
 
 
383 aa  249  7e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.305218 
 
 
-
 
NC_004310  BR2157  CBS domain-containing protein  51.22 
 
 
342 aa  248  1e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.151926  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0028  CBS domain containing protein  45.95 
 
 
377 aa  248  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.490023  normal  0.0271352 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1246  magnesium and cobalt efflux protein CorC  43.4 
 
 
340 aa  234  2e-60  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.96607  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3036  CBS domain-containing protein  46.46 
 
 
296 aa  195  9e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0024  CBS domain-containing protein  39.06 
 
 
304 aa  190  3e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.307011  normal  0.720082 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2391  CBS domain-containing protein  39.93 
 
 
322 aa  185  1e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0704  CBS  43.01 
 
 
312 aa  183  4e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.345067 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3773  CBS domain-containing protein  38 
 
 
318 aa  180  3e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.163853  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0191  CBS domain-containing protein  41.96 
 
 
300 aa  176  5e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1356  CBS domain-containing protein  41.34 
 
 
289 aa  175  1e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0204179  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2158  CBS domain-containing protein  39.08 
 
 
314 aa  174  2e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.583239  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3875  hypothetical protein  38.46 
 
 
314 aa  172  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.266058  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3282  CBS domain-containing protein  38.24 
 
 
315 aa  169  5e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.847272 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3597  CorC/Hlyc family protein  38.24 
 
 
315 aa  169  5e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0738043  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1014  CBS domain containing protein  36.49 
 
 
302 aa  169  6e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0266413  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0067  CBS domain containing protein  37.07 
 
 
324 aa  160  3e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0388003 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0979  CBS  37.83 
 
 
313 aa  157  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.980181  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3694  CBS domain-containing protein  42.39 
 
 
310 aa  153  5e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.548204  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1507  hypothetical protein  33.46 
 
 
430 aa  145  1e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0240  Mg2+/Co2+ transporter  35.52 
 
 
291 aa  143  6e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2111  CBS domain containing protein  37.25 
 
 
421 aa  141  1e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.241811  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1867  CBS domain containing protein  31.56 
 
 
285 aa  141  2e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00545793 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0060  CBS domain pair protein  33.08 
 
 
259 aa  141  2e-32  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1181  CBS domain containing protein  34.51 
 
 
299 aa  141  2e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0031  hemolysin  31.29 
 
 
295 aa  140  4e-32  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.551744  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004214  magnesium and cobalt efflux protein CorC  33.21 
 
 
299 aa  140  4e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.990364  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0553  CBS domain containing protein  33.33 
 
 
273 aa  140  5e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000116003 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2870  hypothetical protein  34.06 
 
 
433 aa  139  8e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.221651  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1394  hypothetical protein  33.99 
 
 
292 aa  139  1e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0015  CBS domain containing protein  37.11 
 
 
434 aa  138  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1602  hypothetical protein  33.6 
 
 
292 aa  137  4e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3260  CBS domain containing protein  30.23 
 
 
287 aa  137  4e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0011  CBS/transport-associated domain-containing protein  28.98 
 
 
295 aa  136  5e-31  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2578  magnesium and cobalt efflux protein CorC  33.67 
 
 
292 aa  136  6e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0721434 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4588  hypothetical protein  34.5 
 
 
427 aa  136  6e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0268669  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1000  CBS domain containing protein  30.23 
 
 
287 aa  135  9e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0370099  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3474  CBS domain-containing protein  34.23 
 
 
291 aa  135  1e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.42  hitchhiker  0.00607831 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1066  protein of unknown function DUF21  32.68 
 
 
426 aa  135  1e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.905964  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0846  CBS domain-containing protein  35.85 
 
 
439 aa  134  2e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1002  hypothetical protein  33.91 
 
 
443 aa  135  2e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12560  putative membrane CBS domain protein  32.1 
 
 
420 aa  134  3e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1468  CBS domain containing protein  33.07 
 
 
447 aa  134  4e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0356908  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3699  CBS domain-containing protein  33.46 
 
 
291 aa  133  6e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246978  hitchhiker  0.00355907 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2926  CBS domain-containing protein  31.68 
 
 
291 aa  133  6e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00659921 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2136  CBS domain containing protein  33.24 
 
 
311 aa  132  8e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0496158  normal  0.0714936 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2708  CBS domain-containing protein  34.07 
 
 
432 aa  132  8e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.642417 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0738  CBS domain-containing protein  32.82 
 
 
435 aa  132  8e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0926  protein of unknown function DUF21  32.56 
 
 
441 aa  132  1e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1005  CBS domain-containing protein  32.44 
 
 
291 aa  132  1e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0718327 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1807  CBS  29.91 
 
 
298 aa  132  1e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.223069  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1066  CBS domain-containing protein  32.44 
 
 
291 aa  131  2e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.354605  normal  0.0599682 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1001  CBS domain-containing protein  32.44 
 
 
291 aa  131  2e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.243259  normal  0.0641056 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2858  CBS domain-containing protein  32.11 
 
 
291 aa  131  2e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3442  CBS domain-containing protein  32.78 
 
 
291 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000638255 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3264  CBS domain-containing protein  32.78 
 
 
291 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3306  CBS domain-containing protein  32.78 
 
 
291 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1103  CBS domain containing protein  32.78 
 
 
291 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  1.07663e-09 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1784  CBS domain-containing protein  33.07 
 
 
284 aa  130  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  3.39521e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0394  protein of unknown function DUF21  30.22 
 
 
414 aa  130  3e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0591737  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2368  CBS:transporter-associated region  29.97 
 
 
284 aa  130  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1178  magnesium and cobalt efflux protein CorC  32.78 
 
 
291 aa  130  3e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1578  CBS domain containing protein  36.93 
 
 
537 aa  130  3e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110465  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0978  protein involved in gliding motility GldE  31.91 
 
 
431 aa  130  4e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4395  hypothetical protein  33.06 
 
 
439 aa  130  4e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0154532  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3140  CBS domain-containing protein  31.68 
 
 
293 aa  130  4e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.328358  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1936  CBS domain containing protein  32.3 
 
 
371 aa  130  5e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3830  CBS domain-containing protein  34.45 
 
 
432 aa  130  5e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0853  CBS domain-containing protein  34.06 
 
 
444 aa  129  8e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215802  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3157  CBS domain containing protein  34.36 
 
 
490 aa  129  8e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00650526  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0868  CBS domain containing protein  34.91 
 
 
279 aa  129  9e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1330  CBS domain-containing protein  32.43 
 
 
275 aa  129  9e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.964649  normal  0.0685098 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1262  hypothetical protein  32.13 
 
 
533 aa  129  1e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0272  CBS domain-containing protein  32.17 
 
 
419 aa  129  1e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2611  protein of unknown function DUF21  31.82 
 
 
445 aa  128  1e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0890  CBS domain-containing protein  34.12 
 
 
291 aa  129  1e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.192583  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0710  CBS domain-containing protein  32.31 
 
 
292 aa  128  1e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.592544  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0036  putative transporter  28.96 
 
 
421 aa  127  2e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>