More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3179 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3179  CBS domain-containing protein  100 
 
 		 389 aa  758    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0353609  normal  0.0370442 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0232  CBS domain containing protein  87.66 
 
 		 373 aa  649    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.1637  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3402  CBS domain containing protein  64.6 
 
 		 384 aa  450  1e-125  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.224461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0636  CBS domain-containing protein  63.12 
 
 		 377 aa  444  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.693928 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3207  CBS domain-containing protein  65.01 
 
 		 382 aa  434  1e-120  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.403327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3531  CBS domain containing protein  65.01 
 
 		 382 aa  434  1e-120  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.307837  normal  0.3242 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2894  CBS domain containing protein  52.48 
 
 		 357 aa  308  9e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.594512 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0471  CBS  48.82 
 
 		 420 aa  285  9e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.603908 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1058  CBS domain-containing protein  46.74 
 
 		 344 aa  283  4.0000000000000003e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.279471  normal  0.884616 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0017  ctransporter-associated region  48.51 
 
 		 375 aa  275  8e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0674373 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0049  transporter  46.61 
 
 		 386 aa  272  7e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0449  CBS domain containing protein  47.03 
 
 		 381 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0239  HlyC/CorC family transporters  46.29 
 
 		 375 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0593  HlyC/CorC family transporter  46.59 
 
 		 376 aa  270  4e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0024  CBS:transporter-associated  46.73 
 
 		 374 aa  270  4e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0016  transporter-associated region  50.46 
 
 		 383 aa  261  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.305218 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0043  CBS domain-containing protein  45.11 
 
 		 391 aa  259  6e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0313302  hitchhiker  0.00000000114145 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0028  CBS domain containing protein  50.15 
 
 		 377 aa  259  6e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.490023  normal  0.0271352 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0441  hemolysin  48.89 
 
 		 345 aa  257  2e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.327012  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3922  transporter-associated region  47.08 
 
 		 353 aa  256  7e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1813  CBS domain-containing protein  46.49 
 
 		 324 aa  255  1.0000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.345805  normal  0.271676 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0755  CBS domain-containing protein  45.35 
 
 		 373 aa  245  8e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1246  magnesium and cobalt efflux protein CorC  42.99 
 
 		 340 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.96607  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2069  CBS domain-containing protein  45.62 
 
 		 374 aa  237  3e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00161693  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2157  CBS domain-containing protein  45.32 
 
 		 342 aa  235  1.0000000000000001e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.151926  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3620  CBS domain-containing protein  42.54 
 
 		 319 aa  223  3e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0704  CBS  42.86 
 
 		 312 aa  206  8e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.345067 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3597  CorC/Hlyc family protein  37.79 
 
 		 315 aa  196  7e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0738043  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3282  CBS domain-containing protein  37.53 
 
 		 315 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.847272 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1014  CBS domain containing protein  39.94 
 
 		 302 aa  186  5e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0266413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3036  CBS domain-containing protein  41.18 
 
 		 296 aa  184  3e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2391  CBS domain-containing protein  36.23 
 
 		 322 aa  181  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0024  CBS domain-containing protein  40.57 
 
 		 304 aa  177  3e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.307011  normal  0.720082 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0979  CBS  39.47 
 
 		 313 aa  170  3e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.980181  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3694  CBS domain-containing protein  42.45 
 
 		 310 aa  165  1.0000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.548204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3875  hypothetical protein  36.68 
 
 		 314 aa  160  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.266058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1356  CBS domain-containing protein  36.06 
 
 		 289 aa  158  2e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0204179  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0191  CBS domain-containing protein  54.88 
 
 		 300 aa  158  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3773  CBS domain-containing protein  35.74 
 
 		 318 aa  157  3e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.163853  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0067  CBS domain containing protein  34.08 
 
 		 324 aa  155  1e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0388003 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0240  Mg2+/Co2+ transporter  32.73 
 
 		 291 aa  145  1e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0553  CBS domain containing protein  30.56 
 
 		 273 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000116003 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0710  CBS domain-containing protein  27.46 
 
 		 292 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.592544  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2368  CBS:transporter-associated region  29.19 
 
 		 284 aa  140  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3782  CBS domain-containing protein  30.41 
 
 		 279 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.964712  normal  0.253 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2158  CBS domain-containing protein  34.68 
 
 		 314 aa  139  1e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.583239  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2111  CBS domain containing protein  34.01 
 
 		 421 aa  139  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.241811  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3699  CBS domain-containing protein  29.59 
 
 		 291 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246978  hitchhiker  0.00355907 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1066  protein of unknown function DUF21  28.44 
 
 		 426 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.905964  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3474  CBS domain-containing protein  29.29 
 
 		 291 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.42  hitchhiker  0.00607831 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12300  hypothetical protein  31.21 
 
 		 279 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0812  CBS:transporter associated  27.76 
 
 		 292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1125  hypothetical protein  31.21 
 
 		 279 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1936  CBS domain containing protein  31.66 
 
 		 371 aa  134  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0738  CBS domain-containing protein  33.11 
 
 		 435 aa  132  7.999999999999999e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0060  CBS domain pair protein  28.47 
 
 		 259 aa  131  2.0000000000000002e-29  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1349  CBS domain containing protein  29.39 
 
 		 293 aa  130  3e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.038929  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1456  magnesium and cobalt efflux protein CorC  29.57 
 
 		 284 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00173357  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1602  hypothetical protein  27.25 
 
 		 292 aa  129  9.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1394  hypothetical protein  27.19 
 
 		 292 aa  127  3e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12560  putative membrane CBS domain protein  29.79 
 
 		 420 aa  127  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2282  CBS domain-containing protein  29.66 
 
 		 250 aa  124  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1468  CBS domain containing protein  31.9 
 
 		 447 aa  125  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0356908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0631  CBS domain-containing protein  28.61 
 
 		 279 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00687954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2858  CBS domain-containing protein  28.78 
 
 		 291 aa  124  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0846  CBS domain-containing protein  33.67 
 
 		 439 aa  124  3e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2926  CBS domain-containing protein  28.06 
 
 		 291 aa  124  3e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00659921 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4348  CBS:transporter-associated region  27.78 
 
 		 280 aa  124  4e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1330  CBS domain-containing protein  28.53 
 
 		 275 aa  123  4e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.964649  normal  0.0685098 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2733  CBS domain containing protein  28.96 
 
 		 284 aa  123  6e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.377385  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4807  metal ion transporter, putative  28.36 
 
 		 280 aa  122  8e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4843  CBS domain-containing protein  28.61 
 
 		 279 aa  122  9e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.71601  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4789  CBS domain containing protein  28.61 
 
 		 279 aa  122  9e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0871051 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4665  CBS domain-containing protein  28.61 
 
 		 279 aa  122  9e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.389317  normal  0.838167 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4953  transporter-associated region  27.19 
 
 		 279 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.387365 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3140  CBS domain-containing protein  27.81 
 
 		 293 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.328358  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1967  CBS domain containing protein  35.59 
 
 		 443 aa  122  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000080224 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2578  magnesium and cobalt efflux protein CorC  26.9 
 
 		 292 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0721434 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1867  CBS domain containing protein  30.06 
 
 		 285 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545793 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1807  CBS  30.3 
 
 		 298 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.223069  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3830  CBS domain-containing protein  32.23 
 
 		 464 aa  121  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3442  CBS domain-containing protein  28.06 
 
 		 291 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000638255 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1103  CBS domain containing protein  28.06 
 
 		 291 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000107663 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1178  magnesium and cobalt efflux protein CorC  27.51 
 
 		 291 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3264  CBS domain-containing protein  28.06 
 
 		 291 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3306  CBS domain-containing protein  28.06 
 
 		 291 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0036  putative transporter  28.62 
 
 		 421 aa  119  7.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0015  CBS domain containing protein  30.74 
 
 		 434 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0036  transporter, putative  28.62 
 
 		 421 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1326  protein of unknown function DUF21  31 
 
 		 425 aa  119  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00045717  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0394  protein of unknown function DUF21  25.68 
 
 		 414 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0591737  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3451  CBS domain-containing protein  32.85 
 
 		 464 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.553184  normal  0.0782726 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1001  CBS domain-containing protein  27.51 
 
 		 291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.243259  normal  0.0641056 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1066  CBS domain-containing protein  27.51 
 
 		 291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.354605  normal  0.0599682 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1005  CBS domain-containing protein  27.51 
 
 		 291 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0718327 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17230  CBS domain-containing protein  30.69 
 
 		 444 aa  117  3.9999999999999997e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0117633  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0064  protein of unknown function DUF21  31.56 
 
 		 447 aa  117  5e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1181  CBS domain containing protein  30.32 
 
 		 299 aa  117  5e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3575  magnesium and cobalt efflux protein CorC  27.3 
 
 		 292 aa  116  6.9999999999999995e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3260  CBS domain containing protein  29.53 
 
 		 287 aa  116  7.999999999999999e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>