More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0043 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_0043  CBS domain-containing protein  100 
 
 
391 aa  774    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0313302  hitchhiker  0.00000000114145 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0028  CBS domain containing protein  70.91 
 
 
377 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.490023  normal  0.0271352 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0016  transporter-associated region  70.88 
 
 
383 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.305218 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0441  hemolysin  60.28 
 
 
345 aa  392  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.327012  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0755  CBS domain-containing protein  55.41 
 
 
373 aa  358  8e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2069  CBS domain-containing protein  56.03 
 
 
374 aa  350  3e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00161693  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2157  CBS domain-containing protein  59.58 
 
 
342 aa  350  4e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.151926  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3922  transporter-associated region  57.78 
 
 
353 aa  341  1e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0471  CBS  48.1 
 
 
420 aa  296  4e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.603908 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1246  magnesium and cobalt efflux protein CorC  48.42 
 
 
340 aa  296  6e-79  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.96607  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0024  CBS:transporter-associated  50.91 
 
 
374 aa  288  2e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0449  CBS domain containing protein  47.46 
 
 
381 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0636  CBS domain-containing protein  46.99 
 
 
377 aa  286  4e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.693928 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0232  CBS domain containing protein  46.18 
 
 
373 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.1637  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0239  HlyC/CorC family transporters  50.16 
 
 
375 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0017  ctransporter-associated region  50 
 
 
375 aa  281  1e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0674373 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0593  HlyC/CorC family transporter  49.36 
 
 
376 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3179  CBS domain-containing protein  44.41 
 
 
389 aa  279  6e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0353609  normal  0.0370442 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3402  CBS domain containing protein  50 
 
 
384 aa  275  7e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.224461  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2894  CBS domain containing protein  48.76 
 
 
357 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.594512 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0049  transporter  49.08 
 
 
386 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3531  CBS domain containing protein  47.69 
 
 
382 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.307837  normal  0.3242 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3207  CBS domain-containing protein  47.69 
 
 
382 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.403327  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1813  CBS domain-containing protein  44.57 
 
 
324 aa  266  7e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.345805  normal  0.271676 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1058  CBS domain-containing protein  45.51 
 
 
344 aa  259  5.0000000000000005e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.279471  normal  0.884616 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3620  CBS domain-containing protein  44.51 
 
 
319 aa  248  2e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3875  hypothetical protein  37.88 
 
 
314 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.266058  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3597  CorC/Hlyc family protein  39.29 
 
 
315 aa  187  3e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0738043  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3773  CBS domain-containing protein  37.95 
 
 
318 aa  187  3e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.163853  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3282  CBS domain-containing protein  39.29 
 
 
315 aa  187  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.847272 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0067  CBS domain containing protein  35.69 
 
 
324 aa  187  4e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0388003 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1014  CBS domain containing protein  37.23 
 
 
302 aa  186  7e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0266413  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0191  CBS domain-containing protein  40.59 
 
 
300 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0704  CBS  41.85 
 
 
312 aa  182  1e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.345067 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3036  CBS domain-containing protein  42.86 
 
 
296 aa  181  2e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0024  CBS domain-containing protein  39.75 
 
 
304 aa  179  4.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.307011  normal  0.720082 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2391  CBS domain-containing protein  40.14 
 
 
322 aa  176  5e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1356  CBS domain-containing protein  39.7 
 
 
289 aa  166  5e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0204179  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0979  CBS  39.49 
 
 
313 aa  164  3e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.980181  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1066  protein of unknown function DUF21  34.56 
 
 
426 aa  157  2e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.905964  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1394  hypothetical protein  32.49 
 
 
292 aa  157  3e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2111  CBS domain containing protein  35.23 
 
 
421 aa  155  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.241811  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1936  CBS domain containing protein  32.29 
 
 
371 aa  154  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1602  hypothetical protein  31.86 
 
 
292 aa  154  4e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2036  CBS domain-containing protein  30.12 
 
 
296 aa  150  3e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004214  magnesium and cobalt efflux protein CorC  32.91 
 
 
299 aa  149  6e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.990364  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0710  CBS domain-containing protein  30.46 
 
 
292 aa  146  8.000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.592544  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3694  CBS domain-containing protein  39.42 
 
 
310 aa  145  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.548204  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3474  CBS domain-containing protein  31.95 
 
 
291 aa  144  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.42  hitchhiker  0.00607831 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3260  CBS domain containing protein  30.72 
 
 
287 aa  145  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1000  CBS domain containing protein  30.72 
 
 
287 aa  144  4e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0370099  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1330  CBS domain-containing protein  29.54 
 
 
275 aa  144  4e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.964649  normal  0.0685098 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1807  CBS  28.92 
 
 
298 aa  142  7e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.223069  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0553  CBS domain containing protein  30.41 
 
 
273 aa  142  8e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000116003 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0015  CBS domain containing protein  32.85 
 
 
434 aa  142  9e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0846  CBS domain-containing protein  37.35 
 
 
439 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2368  CBS:transporter-associated region  30.77 
 
 
284 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2858  CBS domain-containing protein  31.74 
 
 
291 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3699  CBS domain-containing protein  32.52 
 
 
291 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246978  hitchhiker  0.00355907 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1001  CBS domain-containing protein  31.44 
 
 
291 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.243259  normal  0.0641056 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1066  CBS domain-containing protein  31.44 
 
 
291 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.354605  normal  0.0599682 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1784  CBS domain-containing protein  31.08 
 
 
284 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000339521  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1005  CBS domain-containing protein  31.14 
 
 
291 aa  140  3e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0718327 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3140  CBS domain-containing protein  32.08 
 
 
293 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.328358  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3442  CBS domain-containing protein  31.34 
 
 
291 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000638255 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3306  CBS domain-containing protein  31.34 
 
 
291 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3264  CBS domain-containing protein  31.34 
 
 
291 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1103  CBS domain containing protein  31.34 
 
 
291 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000107663 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2578  magnesium and cobalt efflux protein CorC  31.46 
 
 
292 aa  139  7e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0721434 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0890  CBS domain-containing protein  30.33 
 
 
291 aa  139  7.999999999999999e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.192583  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0599  magnesium and cobalt efflux protein, putative  31.45 
 
 
291 aa  139  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0751  CBS domain containing protein  31.45 
 
 
291 aa  139  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000558025 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1178  magnesium and cobalt efflux protein CorC  31.75 
 
 
291 aa  137  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1507  hypothetical protein  28.96 
 
 
430 aa  138  2e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2209  CBS domain-containing protein  30.17 
 
 
286 aa  138  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1181  CBS domain containing protein  31.4 
 
 
299 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3684  hemolysin-like protein  28.79 
 
 
293 aa  137  4e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.335201  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1456  magnesium and cobalt efflux protein CorC  32.48 
 
 
284 aa  137  5e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00173357  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0011  CBS/transport-associated domain-containing protein  29.9 
 
 
295 aa  136  5e-31  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0240  Mg2+/Co2+ transporter  32.74 
 
 
291 aa  136  6.0000000000000005e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0812  CBS:transporter associated  30.06 
 
 
292 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1867  CBS domain containing protein  30.91 
 
 
285 aa  136  7.000000000000001e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00545793 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12560  putative membrane CBS domain protein  29.79 
 
 
420 aa  135  9e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0060  CBS domain pair protein  30.11 
 
 
259 aa  135  9.999999999999999e-31  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1243  hemolysin C  28.92 
 
 
258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.419025  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2703  hypothetical protein  31.89 
 
 
285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.313937  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5985  gliding motility-associated protein GldE  31.58 
 
 
453 aa  134  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.897613 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2733  CBS domain containing protein  31.87 
 
 
284 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.377385  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2926  CBS domain-containing protein  30.53 
 
 
291 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00659921 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2282  CBS domain-containing protein  31.39 
 
 
250 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0031  hemolysin  31.52 
 
 
295 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.551744  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2870  hypothetical protein  29.93 
 
 
433 aa  133  5e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.221651  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0738  CBS domain-containing protein  30.94 
 
 
435 aa  133  5e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1235  putative Mg2+ and co2+ transporter CorC  30.34 
 
 
285 aa  132  7.999999999999999e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1326  protein of unknown function DUF21  30.61 
 
 
425 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00045717  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3451  CBS domain-containing protein  31.36 
 
 
464 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.553184  normal  0.0782726 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1125  hypothetical protein  32.07 
 
 
279 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1262  hypothetical protein  32.01 
 
 
533 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12300  hypothetical protein  32.07 
 
 
279 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3830  CBS domain-containing protein  31.01 
 
 
464 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0304655 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>