More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0471 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0471  CBS  100 
 
 		 420 aa  838    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.603908 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0449  CBS domain containing protein  69.43 
 
 		 381 aa  554  1e-157  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0593  HlyC/CorC family transporter  75.2 
 
 		 376 aa  548  1e-155  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0239  HlyC/CorC family transporters  74.6 
 
 		 375 aa  536  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0024  CBS:transporter-associated  68.32 
 
 		 374 aa  523  1e-147  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0017  ctransporter-associated region  65.95 
 
 		 375 aa  515  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0674373 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0049  transporter  70.3 
 
 		 386 aa  495  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3179  CBS domain-containing protein  47.54 
 
 		 389 aa  290  3e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0353609  normal  0.0370442 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0232  CBS domain containing protein  48.22 
 
 		 373 aa  288  2e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.1637  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1813  CBS domain-containing protein  50.15 
 
 		 324 aa  288  2e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.345805  normal  0.271676 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2894  CBS domain containing protein  48.94 
 
 		 357 aa  282  6.000000000000001e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.594512 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0636  CBS domain-containing protein  48.8 
 
 		 377 aa  283  6.000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.693928 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3402  CBS domain containing protein  46.87 
 
 		 384 aa  276  4e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.224461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0043  CBS domain-containing protein  48.33 
 
 		 391 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0313302  hitchhiker  0.00000000114145 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3207  CBS domain-containing protein  47.15 
 
 		 382 aa  274  3e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.403327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3531  CBS domain containing protein  47.15 
 
 		 382 aa  274  3e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.307837  normal  0.3242 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0016  transporter-associated region  48.55 
 
 		 383 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.305218 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0028  CBS domain containing protein  47.04 
 
 		 377 aa  262  6.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.490023  normal  0.0271352 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1058  CBS domain-containing protein  46.79 
 
 		 344 aa  260  4e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.279471  normal  0.884616 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0441  hemolysin  43.84 
 
 		 345 aa  257  2e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.327012  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0755  CBS domain-containing protein  44.79 
 
 		 373 aa  249  5e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3620  CBS domain-containing protein  42.07 
 
 		 319 aa  242  1e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3922  transporter-associated region  44.74 
 
 		 353 aa  241  2e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2069  CBS domain-containing protein  44.79 
 
 		 374 aa  238  2e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00161693  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2157  CBS domain-containing protein  44.79 
 
 		 342 aa  236  5.0000000000000005e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.151926  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1246  magnesium and cobalt efflux protein CorC  42.06 
 
 		 340 aa  234  3e-60  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.96607  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0024  CBS domain-containing protein  37.59 
 
 		 304 aa  187  4e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.307011  normal  0.720082 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3036  CBS domain-containing protein  41.87 
 
 		 296 aa  187  4e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2391  CBS domain-containing protein  35.99 
 
 		 322 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1014  CBS domain containing protein  34.44 
 
 		 302 aa  170  4e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0266413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1356  CBS domain-containing protein  37.85 
 
 		 289 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0204179  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0191  CBS domain-containing protein  53.64 
 
 		 300 aa  154  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0704  CBS  53.29 
 
 		 312 aa  150  3e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.345067 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3875  hypothetical protein  48.3 
 
 		 314 aa  145  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.266058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3694  CBS domain-containing protein  37.68 
 
 		 310 aa  145  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.548204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3773  CBS domain-containing protein  51.08 
 
 		 318 aa  144  4e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.163853  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0979  CBS  34.3 
 
 		 313 aa  142  8e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.980181  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1507  hypothetical protein  30.82 
 
 		 430 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0240  Mg2+/Co2+ transporter  31.27 
 
 		 291 aa  139  8.999999999999999e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1181  CBS domain containing protein  31.03 
 
 		 299 aa  138  2e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3597  CorC/Hlyc family protein  46.94 
 
 		 315 aa  137  4e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0738043  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0060  CBS domain pair protein  29.69 
 
 		 259 aa  137  4e-31  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3282  CBS domain-containing protein  46.94 
 
 		 315 aa  137  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.847272 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2858  CBS domain-containing protein  33.53 
 
 		 291 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1936  CBS domain containing protein  31.72 
 
 		 371 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2111  CBS domain containing protein  32.86 
 
 		 421 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.241811  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3474  CBS domain-containing protein  33.83 
 
 		 291 aa  133  5e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.42  hitchhiker  0.00607831 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2158  CBS domain-containing protein  50.35 
 
 		 314 aa  132  7.999999999999999e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.583239  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0031  hemolysin  41.22 
 
 		 295 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.551744  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0553  CBS domain containing protein  29.32 
 
 		 273 aa  131  3e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000116003 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1867  CBS domain containing protein  29.5 
 
 		 285 aa  131  3e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545793 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3306  CBS domain-containing protein  33.53 
 
 		 291 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1103  CBS domain containing protein  33.53 
 
 		 291 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000107663 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3699  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 291 aa  130  3e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246978  hitchhiker  0.00355907 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3264  CBS domain-containing protein  33.53 
 
 		 291 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3442  CBS domain-containing protein  33.53 
 
 		 291 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000638255 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1178  magnesium and cobalt efflux protein CorC  34.04 
 
 		 291 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2926  CBS domain-containing protein  31.98 
 
 		 291 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00659921 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1005  CBS domain-containing protein  32.93 
 
 		 291 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0718327 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1001  CBS domain-containing protein  32.93 
 
 		 291 aa  130  6e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.243259  normal  0.0641056 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1066  CBS domain-containing protein  32.93 
 
 		 291 aa  130  6e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.354605  normal  0.0599682 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0710  CBS domain-containing protein  30.86 
 
 		 292 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.592544  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1807  CBS  29.52 
 
 		 298 aa  127  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.223069  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40783  predicted protein  28.76 
 
 		 663 aa  127  3e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.26017  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0011  CBS/transport-associated domain-containing protein  38.82 
 
 		 295 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1578  CBS domain containing protein  32.97 
 
 		 537 aa  126  6e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110465  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4395  hypothetical protein  30.25 
 
 		 439 aa  125  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0154532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0394  protein of unknown function DUF21  27.39 
 
 		 414 aa  124  2e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0591737  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2870  hypothetical protein  29.89 
 
 		 433 aa  125  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.221651  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3237  protein of unknown function DUF21  30.38 
 
 		 448 aa  125  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.422703  normal  0.0333054 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3451  CBS domain-containing protein  31.53 
 
 		 464 aa  124  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.553184  normal  0.0782726 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3140  CBS domain-containing protein  31.72 
 
 		 293 aa  123  6e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.328358  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0926  protein of unknown function DUF21  30.24 
 
 		 441 aa  122  8e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0015  CBS domain containing protein  30.64 
 
 		 434 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0082  hypothetical protein  29.6 
 
 		 455 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000179952  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0846  CBS domain-containing protein  32.43 
 
 		 439 aa  121  3e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0067  CBS domain containing protein  42.18 
 
 		 324 aa  120  3e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0388003 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0082  hypothetical protein  30.11 
 
 		 455 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000182254  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2136  CBS domain containing protein  28.57 
 
 		 311 aa  119  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0496158  normal  0.0714936 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1827  hypothetical protein  26.82 
 
 		 448 aa  118  1.9999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1153  hypothetical protein  31 
 
 		 447 aa  117  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000974304  normal  0.0417904 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2578  magnesium and cobalt efflux protein CorC  42.01 
 
 		 292 aa  117  3e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0721434 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1330  CBS domain-containing protein  30.77 
 
 		 275 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.964649  normal  0.0685098 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0655  CBS domain containing protein  31.47 
 
 		 273 aa  116  6.9999999999999995e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1498  magnesium and cobalt efflux protein  26.95 
 
 		 283 aa  115  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004214  magnesium and cobalt efflux protein CorC  40.94 
 
 		 299 aa  115  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.990364  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2703  hypothetical protein  39.02 
 
 		 285 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.313937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0890  CBS domain-containing protein  35.12 
 
 		 291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.192583  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12392  transmembrane protein  31.99 
 
 		 435 aa  114  3e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2040  hypothetical protein  29.62 
 
 		 418 aa  114  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.923068  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2235  CBS domain containing protein  30.48 
 
 		 439 aa  114  5e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0679  putative magnesium and cobalt efflux protein corC  26.65 
 
 		 279 aa  114  5e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1456  magnesium and cobalt efflux protein CorC  29.52 
 
 		 284 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00173357  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3260  CBS domain containing protein  40 
 
 		 287 aa  112  9e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2733  CBS domain containing protein  30.69 
 
 		 284 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.377385  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1000  CBS domain containing protein  40 
 
 		 287 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0370099  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1394  hypothetical protein  40.69 
 
 		 292 aa  111  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2708  CBS domain-containing protein  30.24 
 
 		 432 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.642417 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0450  CBS transporter-associated protein  30.64 
 
 		 295 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00559232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1326  protein of unknown function DUF21  29.18 
 
 		 425 aa  111  3e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00045717  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>