More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0067 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0067  CBS domain containing protein  100 
 
 
324 aa  634    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0388003 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1356  CBS domain-containing protein  68.89 
 
 
289 aa  316  3e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0204179  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3773  CBS domain-containing protein  47 
 
 
318 aa  243  3e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.163853  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3620  CBS domain-containing protein  44.48 
 
 
319 aa  232  8.000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2894  CBS domain containing protein  39.71 
 
 
357 aa  205  8e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.594512 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3875  hypothetical protein  46.75 
 
 
314 aa  202  5e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.266058  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3282  CBS domain-containing protein  45.19 
 
 
315 aa  196  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.847272 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3597  CorC/Hlyc family protein  45.19 
 
 
315 aa  197  3e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0738043  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1813  CBS domain-containing protein  43.85 
 
 
324 aa  195  8.000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.345805  normal  0.271676 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2391  CBS domain-containing protein  40.86 
 
 
322 aa  189  4e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2158  CBS domain-containing protein  43.31 
 
 
314 aa  189  4e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.583239  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1014  CBS domain containing protein  45 
 
 
302 aa  187  1e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0266413  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0024  CBS domain-containing protein  45.61 
 
 
304 aa  183  3e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.307011  normal  0.720082 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0191  CBS domain-containing protein  43.78 
 
 
300 aa  182  9.000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2069  CBS domain-containing protein  37.86 
 
 
374 aa  181  1e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00161693  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2157  CBS domain-containing protein  37.86 
 
 
342 aa  180  2e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.151926  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2368  CBS:transporter-associated region  38.32 
 
 
284 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0755  CBS domain-containing protein  37.82 
 
 
373 aa  179  8e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3036  CBS domain-containing protein  45.06 
 
 
296 aa  178  9e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1058  CBS domain-containing protein  38.32 
 
 
344 aa  178  1e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.279471  normal  0.884616 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0704  CBS  43.97 
 
 
312 aa  176  3e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.345067 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0449  CBS domain containing protein  38.35 
 
 
381 aa  176  6e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0441  hemolysin  39.52 
 
 
345 aa  173  2.9999999999999996e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.327012  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0232  CBS domain containing protein  37.32 
 
 
373 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.1637  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3694  CBS domain-containing protein  46.85 
 
 
310 aa  172  9e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.548204  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3207  CBS domain-containing protein  36.1 
 
 
382 aa  171  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.403327  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3531  CBS domain containing protein  36.1 
 
 
382 aa  171  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.307837  normal  0.3242 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0043  CBS domain-containing protein  33.85 
 
 
391 aa  170  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0313302  hitchhiker  0.00000000114145 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1246  magnesium and cobalt efflux protein CorC  36.47 
 
 
340 aa  169  5e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.96607  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3922  transporter-associated region  38.46 
 
 
353 aa  169  7e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0239  HlyC/CorC family transporters  37.74 
 
 
375 aa  169  8e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0636  CBS domain-containing protein  36.36 
 
 
377 aa  168  9e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.693928 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3402  CBS domain containing protein  35.76 
 
 
384 aa  168  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.224461  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1807  CBS  38.49 
 
 
298 aa  168  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.223069  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2036  CBS domain-containing protein  38.04 
 
 
296 aa  168  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2925  hypothetical protein  37.86 
 
 
465 aa  167  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.221134  normal  0.412302 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0593  HlyC/CorC family transporter  37.35 
 
 
376 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3260  CBS domain containing protein  35.34 
 
 
287 aa  165  8e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0017  ctransporter-associated region  34.49 
 
 
375 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0674373 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1000  CBS domain containing protein  35.34 
 
 
287 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0370099  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2111  CBS domain containing protein  40.41 
 
 
421 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.241811  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0979  CBS  38.68 
 
 
313 aa  162  6e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.980181  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2282  CBS domain-containing protein  40.61 
 
 
250 aa  162  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2733  CBS domain containing protein  36.75 
 
 
284 aa  161  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.377385  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0024  CBS:transporter-associated  37.07 
 
 
374 aa  161  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1005  CBS domain-containing protein  38.1 
 
 
291 aa  160  3e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0718327 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1936  CBS domain containing protein  37.76 
 
 
371 aa  160  4e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1001  CBS domain-containing protein  38.1 
 
 
291 aa  160  4e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.243259  normal  0.0641056 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1066  CBS domain-containing protein  38.1 
 
 
291 aa  160  4e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.354605  normal  0.0599682 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0011  CBS/transport-associated domain-containing protein  34.36 
 
 
295 aa  158  1e-37  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0049  transporter  37.07 
 
 
386 aa  158  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3839  hypothetical protein  39.74 
 
 
425 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0812  CBS:transporter associated  36.51 
 
 
292 aa  157  3e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3306  CBS domain-containing protein  37.7 
 
 
291 aa  156  4e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3442  CBS domain-containing protein  37.7 
 
 
291 aa  156  4e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000638255 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1103  CBS domain containing protein  37.7 
 
 
291 aa  156  4e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000107663 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3264  CBS domain-containing protein  37.7 
 
 
291 aa  156  4e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2926  CBS domain-containing protein  35.37 
 
 
291 aa  156  6e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00659921 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1784  CBS domain-containing protein  39.47 
 
 
284 aa  155  6e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000339521  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004214  magnesium and cobalt efflux protein CorC  36.73 
 
 
299 aa  156  6e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.990364  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2578  magnesium and cobalt efflux protein CorC  35.22 
 
 
292 aa  155  7e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0721434 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1330  CBS domain-containing protein  37.8 
 
 
275 aa  155  8e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.964649  normal  0.0685098 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0031  hemolysin  35.09 
 
 
295 aa  155  9e-37  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.551744  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0553  CBS domain containing protein  39.75 
 
 
273 aa  154  1e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000116003 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2858  CBS domain-containing protein  37.3 
 
 
291 aa  154  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1178  magnesium and cobalt efflux protein CorC  37.2 
 
 
291 aa  154  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3179  CBS domain-containing protein  33.98 
 
 
389 aa  154  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0353609  normal  0.0370442 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1671  CBS domain containing protein  32.4 
 
 
273 aa  153  2.9999999999999998e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000152049  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3952  CBS domain-containing protein  38.05 
 
 
423 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.173559 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1235  putative Mg2+ and co2+ transporter CorC  37.39 
 
 
285 aa  153  5e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3699  CBS domain-containing protein  35.37 
 
 
291 aa  152  5e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246978  hitchhiker  0.00355907 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3782  CBS domain-containing protein  38.78 
 
 
279 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.964712  normal  0.253 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0016  transporter-associated region  31.83 
 
 
383 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.305218 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0028  CBS domain containing protein  33.33 
 
 
377 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.490023  normal  0.0271352 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2560  protein of unknown function DUF21  37.65 
 
 
420 aa  151  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000312392 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1507  hypothetical protein  33.75 
 
 
430 aa  152  1e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0408  CBS domain-containing protein  39.42 
 
 
298 aa  151  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.658484  normal  0.141642 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3474  CBS domain-containing protein  34.92 
 
 
291 aa  151  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.42  hitchhiker  0.00607831 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0738  CBS domain-containing protein  37.82 
 
 
435 aa  151  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0710  CBS domain-containing protein  35.46 
 
 
292 aa  150  3e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.592544  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4395  hypothetical protein  40.53 
 
 
439 aa  150  4e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0154532  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3197  hypothetical protein  37.14 
 
 
479 aa  149  4e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.241932  normal  0.866715 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4953  transporter-associated region  37.55 
 
 
279 aa  150  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.387365 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2212  CBS domain-containing protein  35.68 
 
 
417 aa  150  4e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000293587  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0890  CBS domain-containing protein  39.33 
 
 
291 aa  149  5e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.192583  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0616  protein of unknown function DUF21  32.82 
 
 
422 aa  149  5e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000839014  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1660  CBS domain containing protein  41.89 
 
 
461 aa  149  7e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1125  hypothetical protein  36.88 
 
 
279 aa  149  7e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2870  hypothetical protein  34.41 
 
 
433 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.221651  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3140  CBS domain-containing protein  37.82 
 
 
293 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.328358  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2136  CBS domain containing protein  34.33 
 
 
311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0496158  normal  0.0714936 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0631  CBS domain-containing protein  37.96 
 
 
279 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00687954  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12300  hypothetical protein  36.5 
 
 
279 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4807  metal ion transporter, putative  37.75 
 
 
280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4348  CBS:transporter-associated region  38.15 
 
 
280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3333  transporter-associated region  39 
 
 
311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.240989 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0826  CBS domain-containing protein  37.09 
 
 
374 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.709 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1349  CBS domain containing protein  39.36 
 
 
293 aa  147  3e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.038929  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1184  CBS domain-containing protein  37.25 
 
 
292 aa  147  3e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0632091 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0655  CBS domain containing protein  36.33 
 
 
273 aa  147  3e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>