More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1014 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_1014  CBS domain containing protein  100 
 
 
302 aa  605  9.999999999999999e-173  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0266413  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3875  hypothetical protein  60.96 
 
 
314 aa  330  2e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.266058  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3597  CorC/Hlyc family protein  61.39 
 
 
315 aa  325  8.000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0738043  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3282  CBS domain-containing protein  61.39 
 
 
315 aa  324  9e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.847272 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0704  CBS  60.47 
 
 
312 aa  319  3.9999999999999996e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.345067 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0191  CBS domain-containing protein  58.11 
 
 
300 aa  310  2e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3694  CBS domain-containing protein  67.54 
 
 
310 aa  282  4.0000000000000003e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.548204  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3620  CBS domain-containing protein  47.08 
 
 
319 aa  221  9.999999999999999e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2894  CBS domain containing protein  39.29 
 
 
357 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.594512 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0232  CBS domain containing protein  43.36 
 
 
373 aa  212  7.999999999999999e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.1637  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0636  CBS domain-containing protein  41.02 
 
 
377 aa  210  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.693928 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3207  CBS domain-containing protein  43.87 
 
 
382 aa  206  3e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.403327  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3531  CBS domain containing protein  43.87 
 
 
382 aa  206  3e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.307837  normal  0.3242 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3402  CBS domain containing protein  43.59 
 
 
384 aa  203  3e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.224461  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3036  CBS domain-containing protein  50.2 
 
 
296 aa  203  3e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3179  CBS domain-containing protein  40.7 
 
 
389 aa  202  4e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0353609  normal  0.0370442 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0067  CBS domain containing protein  42.44 
 
 
324 aa  199  6e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0388003 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1813  CBS domain-containing protein  45.08 
 
 
324 aa  197  1.0000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.345805  normal  0.271676 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0441  hemolysin  44.31 
 
 
345 aa  197  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.327012  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0449  CBS domain containing protein  41.63 
 
 
381 aa  192  5e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1058  CBS domain-containing protein  41.47 
 
 
344 aa  190  2.9999999999999997e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.279471  normal  0.884616 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3773  CBS domain-containing protein  48.75 
 
 
318 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.163853  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0017  ctransporter-associated region  38.51 
 
 
375 aa  188  8e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0674373 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0024  CBS domain-containing protein  47.71 
 
 
304 aa  186  3e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.307011  normal  0.720082 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0049  transporter  42.4 
 
 
386 aa  186  4e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1356  CBS domain-containing protein  45.91 
 
 
289 aa  186  4e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0204179  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0593  HlyC/CorC family transporter  40.86 
 
 
376 aa  183  3e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0024  CBS:transporter-associated  37.42 
 
 
374 aa  183  3e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0239  HlyC/CorC family transporters  40.8 
 
 
375 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0043  CBS domain-containing protein  37.13 
 
 
391 aa  181  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0313302  hitchhiker  0.00000000114145 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3922  transporter-associated region  44.32 
 
 
353 aa  179  4.999999999999999e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0755  CBS domain-containing protein  40.47 
 
 
373 aa  176  4e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0028  CBS domain containing protein  39.11 
 
 
377 aa  176  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.490023  normal  0.0271352 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2069  CBS domain-containing protein  36.56 
 
 
374 aa  175  7e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00161693  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2157  CBS domain-containing protein  40.39 
 
 
342 aa  173  2.9999999999999996e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.151926  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1178  magnesium and cobalt efflux protein CorC  43.04 
 
 
291 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1005  CBS domain-containing protein  42.74 
 
 
291 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0718327 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1001  CBS domain-containing protein  42.74 
 
 
291 aa  172  5e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.243259  normal  0.0641056 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1066  CBS domain-containing protein  42.74 
 
 
291 aa  172  5e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.354605  normal  0.0599682 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0016  transporter-associated region  38.32 
 
 
383 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.305218 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2858  CBS domain-containing protein  42.55 
 
 
291 aa  168  1e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2391  CBS domain-containing protein  42.22 
 
 
322 aa  167  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1246  magnesium and cobalt efflux protein CorC  39.52 
 
 
340 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.96607  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1103  CBS domain containing protein  42.13 
 
 
291 aa  166  4e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000107663 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3442  CBS domain-containing protein  42.13 
 
 
291 aa  166  4e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000638255 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2158  CBS domain-containing protein  43.16 
 
 
314 aa  166  4e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.583239  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3306  CBS domain-containing protein  42.13 
 
 
291 aa  166  4e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3264  CBS domain-containing protein  42.13 
 
 
291 aa  166  4e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3474  CBS domain-containing protein  41.28 
 
 
291 aa  166  4e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.42  hitchhiker  0.00607831 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3699  CBS domain-containing protein  40.25 
 
 
291 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246978  hitchhiker  0.00355907 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2926  CBS domain-containing protein  41.28 
 
 
291 aa  163  3e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00659921 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2578  magnesium and cobalt efflux protein CorC  40 
 
 
292 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0721434 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0812  CBS:transporter associated  38.72 
 
 
292 aa  160  3e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0710  CBS domain-containing protein  38.3 
 
 
292 aa  160  3e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.592544  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2368  CBS:transporter-associated region  36.55 
 
 
284 aa  159  7e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3140  CBS domain-containing protein  38.7 
 
 
293 aa  156  3e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.328358  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2036  CBS domain-containing protein  34.93 
 
 
296 aa  155  7e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0240  Mg2+/Co2+ transporter  40.47 
 
 
291 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1507  hypothetical protein  35.08 
 
 
430 aa  153  4e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1784  CBS domain-containing protein  38.39 
 
 
284 aa  152  5e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000339521  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0826  CBS domain-containing protein  38.84 
 
 
374 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.709 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1235  putative Mg2+ and co2+ transporter CorC  37.99 
 
 
285 aa  150  3e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2289  Mg2+/Co2+ transporter  39.57 
 
 
289 aa  149  4e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.977509  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3839  hypothetical protein  35.32 
 
 
425 aa  149  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1394  hypothetical protein  35.44 
 
 
292 aa  149  5e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1602  hypothetical protein  35.44 
 
 
292 aa  149  7e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0031  hemolysin  34.94 
 
 
295 aa  149  8e-35  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.551744  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1936  CBS domain containing protein  37.66 
 
 
371 aa  148  9e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2733  CBS domain containing protein  36.12 
 
 
284 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.377385  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2282  CBS domain-containing protein  36.75 
 
 
250 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1867  CBS domain containing protein  35.59 
 
 
285 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00545793 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0011  CBS/transport-associated domain-containing protein  35.95 
 
 
295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0890  CBS domain-containing protein  38.33 
 
 
291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.192583  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0015  CBS domain containing protein  40.18 
 
 
434 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0553  CBS domain containing protein  39.66 
 
 
273 aa  146  5e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000116003 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2111  CBS domain containing protein  36.12 
 
 
421 aa  146  5e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.241811  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0979  CBS  40.79 
 
 
313 aa  145  8.000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.980181  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1066  protein of unknown function DUF21  37.12 
 
 
426 aa  145  1e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.905964  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0471  CBS  48.39 
 
 
420 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.603908 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2870  hypothetical protein  35.74 
 
 
433 aa  144  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.221651  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1027  CBS domain-containing protein  30.38 
 
 
272 aa  144  2e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.847231  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3260  CBS domain containing protein  37.33 
 
 
287 aa  144  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3782  CBS domain-containing protein  38.46 
 
 
279 aa  144  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.964712  normal  0.253 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1000  CBS domain containing protein  37.33 
 
 
287 aa  144  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0370099  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004214  magnesium and cobalt efflux protein CorC  36.56 
 
 
299 aa  143  3e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.990364  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0738  CBS domain-containing protein  36.32 
 
 
435 aa  143  4e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2703  hypothetical protein  35.94 
 
 
285 aa  143  4e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.313937  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2209  CBS domain-containing protein  37.83 
 
 
286 aa  143  4e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2741  transporter-associated region  36.77 
 
 
281 aa  143  4e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.835583  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2560  protein of unknown function DUF21  38.36 
 
 
420 aa  142  7e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000312392 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12300  hypothetical protein  38.91 
 
 
279 aa  142  9e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1125  hypothetical protein  38.91 
 
 
279 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1153  hypothetical protein  35.38 
 
 
447 aa  140  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000974304  normal  0.0417904 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0060  CBS domain pair protein  34.08 
 
 
259 aa  139  4.999999999999999e-32  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5985  gliding motility-associated protein GldE  36.91 
 
 
453 aa  139  6e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.897613 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2136  CBS domain containing protein  37.6 
 
 
311 aa  139  6e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0496158  normal  0.0714936 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4440  CBS domain containing protein  35.62 
 
 
438 aa  139  6e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0252  protein of unknown function DUF21  37.39 
 
 
434 aa  139  6e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000514588  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1002  hypothetical protein  36.2 
 
 
443 aa  139  6e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3952  CBS domain-containing protein  33.47 
 
 
423 aa  139  7e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.173559 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>