More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0239 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0593  HlyC/CorC family transporter  91.22 
 
 		 376 aa  653    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0239  HlyC/CorC family transporters  100 
 
 		 375 aa  748    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0449  CBS domain containing protein  84.45 
 
 		 381 aa  626  1e-178  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0471  CBS  69.86 
 
 		 420 aa  545  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.603908 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0024  CBS:transporter-associated  76.5 
 
 		 374 aa  528  1e-149  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0017  ctransporter-associated region  72.34 
 
 		 375 aa  520  1e-146  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0674373 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0049  transporter  78.1 
 
 		 386 aa  493  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1813  CBS domain-containing protein  56.8 
 
 		 324 aa  305  7e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.345805  normal  0.271676 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0636  CBS domain-containing protein  48.45 
 
 		 377 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.693928 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2894  CBS domain containing protein  49.53 
 
 		 357 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.594512 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3179  CBS domain-containing protein  46.69 
 
 		 389 aa  270  2e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0353609  normal  0.0370442 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0232  CBS domain containing protein  48.44 
 
 		 373 aa  270  4e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.1637  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3402  CBS domain containing protein  47.22 
 
 		 384 aa  269  7e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.224461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3531  CBS domain containing protein  46.75 
 
 		 382 aa  262  8e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.307837  normal  0.3242 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3207  CBS domain-containing protein  46.75 
 
 		 382 aa  262  8e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.403327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0043  CBS domain-containing protein  47.78 
 
 		 391 aa  261  2e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0313302  hitchhiker  0.00000000114145 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3620  CBS domain-containing protein  47.65 
 
 		 319 aa  260  3e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0016  transporter-associated region  48.55 
 
 		 383 aa  256  5e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.305218 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0028  CBS domain containing protein  44.44 
 
 		 377 aa  255  8e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.490023  normal  0.0271352 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0441  hemolysin  49.5 
 
 		 345 aa  255  9e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.327012  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1058  CBS domain-containing protein  47.33 
 
 		 344 aa  251  1e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.279471  normal  0.884616 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3922  transporter-associated region  50.84 
 
 		 353 aa  251  1e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0755  CBS domain-containing protein  45.65 
 
 		 373 aa  249  6e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2069  CBS domain-containing protein  47.56 
 
 		 374 aa  240  2e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00161693  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2157  CBS domain-containing protein  45.93 
 
 		 342 aa  239  5.999999999999999e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.151926  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1246  magnesium and cobalt efflux protein CorC  43.29 
 
 		 340 aa  238  1e-61  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.96607  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0024  CBS domain-containing protein  40.74 
 
 		 304 aa  203  5e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.307011  normal  0.720082 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3036  CBS domain-containing protein  47.37 
 
 		 296 aa  194  2e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2391  CBS domain-containing protein  40 
 
 		 322 aa  192  8e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3773  CBS domain-containing protein  40.66 
 
 		 318 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.163853  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0191  CBS domain-containing protein  38.01 
 
 		 300 aa  183  5.0000000000000004e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0704  CBS  42.69 
 
 		 312 aa  180  4e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.345067 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2158  CBS domain-containing protein  40.23 
 
 		 314 aa  178  1e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.583239  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1356  CBS domain-containing protein  40.55 
 
 		 289 aa  176  8e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0204179  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3597  CorC/Hlyc family protein  39.43 
 
 		 315 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0738043  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3875  hypothetical protein  37.23 
 
 		 314 aa  171  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.266058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3282  CBS domain-containing protein  39.18 
 
 		 315 aa  170  4e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.847272 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0067  CBS domain containing protein  37.74 
 
 		 324 aa  168  1e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0388003 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1014  CBS domain containing protein  40.08 
 
 		 302 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0266413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0979  CBS  37.79 
 
 		 313 aa  151  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.980181  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3694  CBS domain-containing protein  41.56 
 
 		 310 aa  151  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.548204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2578  magnesium and cobalt efflux protein CorC  35.57 
 
 		 292 aa  151  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0721434 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0240  Mg2+/Co2+ transporter  34.5 
 
 		 291 aa  150  4e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1507  hypothetical protein  33.2 
 
 		 430 aa  149  7e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0060  CBS domain pair protein  32.69 
 
 		 259 aa  147  3e-34  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2858  CBS domain-containing protein  34.67 
 
 		 291 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1867  CBS domain containing protein  30.9 
 
 		 285 aa  144  2e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545793 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2111  CBS domain containing protein  36.03 
 
 		 421 aa  143  5e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.241811  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1181  CBS domain containing protein  33.59 
 
 		 299 aa  143  6e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3442  CBS domain-containing protein  33.67 
 
 		 291 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000638255 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3306  CBS domain-containing protein  33.67 
 
 		 291 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3474  CBS domain-containing protein  33.67 
 
 		 291 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.42  hitchhiker  0.00607831 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1103  CBS domain containing protein  33.67 
 
 		 291 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000107663 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3264  CBS domain-containing protein  33.67 
 
 		 291 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1005  CBS domain-containing protein  33.67 
 
 		 291 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0718327 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1001  CBS domain-containing protein  33.67 
 
 		 291 aa  140  3e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.243259  normal  0.0641056 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1066  CBS domain-containing protein  33.67 
 
 		 291 aa  140  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.354605  normal  0.0599682 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0011  CBS/transport-associated domain-containing protein  28.99 
 
 		 295 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0031  hemolysin  29.93 
 
 		 295 aa  140  4.999999999999999e-32  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.551744  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12560  putative membrane CBS domain protein  33.46 
 
 		 420 aa  140  4.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1178  magnesium and cobalt efflux protein CorC  33.33 
 
 		 291 aa  139  6e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3699  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 291 aa  139  7e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246978  hitchhiker  0.00355907 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1784  CBS domain-containing protein  33.21 
 
 		 284 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000339521  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1807  CBS  33.58 
 
 		 298 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.223069  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1066  protein of unknown function DUF21  32.68 
 
 		 426 aa  139  1e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.905964  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0015  CBS domain containing protein  33.01 
 
 		 434 aa  138  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2926  CBS domain-containing protein  33 
 
 		 291 aa  138  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00659921 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0394  protein of unknown function DUF21  30.6 
 
 		 414 aa  138  2e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0591737  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0812  CBS:transporter associated  33.44 
 
 		 292 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1349  CBS domain containing protein  33.67 
 
 		 293 aa  137  3.0000000000000003e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.038929  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0853  CBS domain-containing protein  35.42 
 
 		 444 aa  137  4e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215802  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0710  CBS domain-containing protein  32 
 
 		 292 aa  137  4e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.592544  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2611  protein of unknown function DUF21  32.58 
 
 		 445 aa  136  5e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0738  CBS domain-containing protein  33.09 
 
 		 435 aa  136  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0926  protein of unknown function DUF21  30.07 
 
 		 441 aa  136  6.0000000000000005e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1000  CBS domain containing protein  30.38 
 
 		 287 aa  136  8e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0370099  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1578  CBS domain containing protein  37.5 
 
 		 537 aa  135  9e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110465  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1153  hypothetical protein  35 
 
 		 447 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000974304  normal  0.0417904 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2560  protein of unknown function DUF21  32.19 
 
 		 420 aa  135  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000312392 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3140  CBS domain-containing protein  32 
 
 		 293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.328358  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1394  hypothetical protein  33.33 
 
 		 292 aa  135  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2368  CBS:transporter-associated region  30.36 
 
 		 284 aa  134  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1125  hypothetical protein  31.99 
 
 		 279 aa  134  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12300  hypothetical protein  31.99 
 
 		 279 aa  134  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3260  CBS domain containing protein  30.53 
 
 		 287 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004214  magnesium and cobalt efflux protein CorC  31 
 
 		 299 aa  134  3.9999999999999996e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.990364  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2870  hypothetical protein  30.65 
 
 		 433 aa  133  5e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.221651  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1602  hypothetical protein  32.94 
 
 		 292 aa  133  6e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2733  CBS domain containing protein  34.88 
 
 		 284 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.377385  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1936  CBS domain containing protein  32.95 
 
 		 371 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2136  CBS domain containing protein  32.34 
 
 		 311 aa  132  9e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0496158  normal  0.0714936 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1243  hemolysin C  30.42 
 
 		 258 aa  132  9e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.419025  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0655  CBS domain containing protein  32.41 
 
 		 273 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1262  hypothetical protein  33.67 
 
 		 533 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0890  CBS domain-containing protein  32.94 
 
 		 291 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.192583  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3830  CBS domain-containing protein  37.23 
 
 		 464 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3237  protein of unknown function DUF21  32.79 
 
 		 448 aa  130  3e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.422703  normal  0.0333054 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4588  hypothetical protein  32.56 
 
 		 427 aa  130  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0268669  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4395  hypothetical protein  32.66 
 
 		 439 aa  130  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0154532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0036  putative transporter  28.11 
 
 		 421 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>