More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0449 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0449  CBS domain containing protein  100 
 
 		 381 aa  757    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0239  HlyC/CorC family transporters  84.45 
 
 		 375 aa  611  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0593  HlyC/CorC family transporter  84.76 
 
 		 376 aa  608  1e-173  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0471  CBS  69.43 
 
 		 420 aa  552  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.603908 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0024  CBS:transporter-associated  76.4 
 
 		 374 aa  528  1e-149  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0017  ctransporter-associated region  71.5 
 
 		 375 aa  514  1e-144  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0674373 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0049  transporter  77.78 
 
 		 386 aa  488  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1813  CBS domain-containing protein  54.92 
 
 		 324 aa  304  2.0000000000000002e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.345805  normal  0.271676 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0636  CBS domain-containing protein  48.27 
 
 		 377 aa  277  2e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.693928 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0232  CBS domain containing protein  50.47 
 
 		 373 aa  275  7e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.1637  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2894  CBS domain containing protein  50.48 
 
 		 357 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.594512 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3179  CBS domain-containing protein  47.03 
 
 		 389 aa  271  2e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0353609  normal  0.0370442 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3402  CBS domain containing protein  47.84 
 
 		 384 aa  268  1e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.224461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3531  CBS domain containing protein  47.99 
 
 		 382 aa  265  8.999999999999999e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.307837  normal  0.3242 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3207  CBS domain-containing protein  47.99 
 
 		 382 aa  265  8.999999999999999e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.403327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1058  CBS domain-containing protein  49.51 
 
 		 344 aa  262  6e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.279471  normal  0.884616 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0043  CBS domain-containing protein  48.73 
 
 		 391 aa  261  1e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0313302  hitchhiker  0.00000000114145 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0016  transporter-associated region  47.45 
 
 		 383 aa  257  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.305218 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3620  CBS domain-containing protein  47.12 
 
 		 319 aa  256  5e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0755  CBS domain-containing protein  43.7 
 
 		 373 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0028  CBS domain containing protein  44.51 
 
 		 377 aa  251  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.490023  normal  0.0271352 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3922  transporter-associated region  50.84 
 
 		 353 aa  251  1e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0441  hemolysin  48.51 
 
 		 345 aa  251  2e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.327012  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2069  CBS domain-containing protein  46.82 
 
 		 374 aa  247  2e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00161693  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2157  CBS domain-containing protein  46.82 
 
 		 342 aa  246  4.9999999999999997e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.151926  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1246  magnesium and cobalt efflux protein CorC  41.56 
 
 		 340 aa  229  8e-59  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.96607  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3036  CBS domain-containing protein  47.47 
 
 		 296 aa  204  2e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0024  CBS domain-containing protein  40.47 
 
 		 304 aa  200  3e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.307011  normal  0.720082 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2391  CBS domain-containing protein  41.12 
 
 		 322 aa  199  6e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3773  CBS domain-containing protein  37.15 
 
 		 318 aa  193  5e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.163853  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0704  CBS  44.27 
 
 		 312 aa  189  7e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.345067 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0191  CBS domain-containing protein  43.65 
 
 		 300 aa  188  1e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2158  CBS domain-containing protein  41.06 
 
 		 314 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.583239  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3875  hypothetical protein  38.95 
 
 		 314 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.266058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3597  CorC/Hlyc family protein  39.93 
 
 		 315 aa  179  7e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0738043  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3282  CBS domain-containing protein  39.93 
 
 		 315 aa  179  8e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.847272 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1014  CBS domain containing protein  40.91 
 
 		 302 aa  179  1e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0266413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1356  CBS domain-containing protein  40.94 
 
 		 289 aa  179  1e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0204179  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0067  CBS domain containing protein  38.13 
 
 		 324 aa  169  6e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0388003 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3694  CBS domain-containing protein  43.21 
 
 		 310 aa  161  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.548204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1507  hypothetical protein  33.85 
 
 		 430 aa  155  1e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0015  CBS domain containing protein  35.08 
 
 		 434 aa  155  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0979  CBS  37.26 
 
 		 313 aa  153  4e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.980181  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1867  CBS domain containing protein  30.49 
 
 		 285 aa  153  5.9999999999999996e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545793 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0060  CBS domain pair protein  32.97 
 
 		 259 aa  150  3e-35  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2578  magnesium and cobalt efflux protein CorC  36.58 
 
 		 292 aa  150  4e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0721434 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12560  putative membrane CBS domain protein  34.63 
 
 		 420 aa  149  6e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2858  CBS domain-containing protein  34.65 
 
 		 291 aa  149  6e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1103  CBS domain containing protein  34.08 
 
 		 291 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000107663 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3442  CBS domain-containing protein  34.08 
 
 		 291 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000638255 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3264  CBS domain-containing protein  34.08 
 
 		 291 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3306  CBS domain-containing protein  34.08 
 
 		 291 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0710  CBS domain-containing protein  33.66 
 
 		 292 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.592544  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3474  CBS domain-containing protein  34.52 
 
 		 291 aa  147  3e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.42  hitchhiker  0.00607831 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3699  CBS domain-containing protein  35.45 
 
 		 291 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246978  hitchhiker  0.00355907 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2926  CBS domain-containing protein  33.86 
 
 		 291 aa  146  5e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00659921 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0240  Mg2+/Co2+ transporter  35.29 
 
 		 291 aa  146  5e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1181  CBS domain containing protein  34.51 
 
 		 299 aa  146  7.0000000000000006e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1178  magnesium and cobalt efflux protein CorC  34.9 
 
 		 291 aa  145  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2111  CBS domain containing protein  37.65 
 
 		 421 aa  144  3e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.241811  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1000  CBS domain containing protein  30.77 
 
 		 287 aa  144  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0370099  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1005  CBS domain-containing protein  34.34 
 
 		 291 aa  144  3e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0718327 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1001  CBS domain-containing protein  34.34 
 
 		 291 aa  143  5e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.243259  normal  0.0641056 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1066  CBS domain-containing protein  34.34 
 
 		 291 aa  143  5e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.354605  normal  0.0599682 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0812  CBS:transporter associated  33.33 
 
 		 292 aa  143  6e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2870  hypothetical protein  31.54 
 
 		 433 aa  143  6e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.221651  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1807  CBS  33.09 
 
 		 298 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.223069  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0031  hemolysin  31.05 
 
 		 295 aa  142  9.999999999999999e-33  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.551744  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3260  CBS domain containing protein  30.45 
 
 		 287 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0926  protein of unknown function DUF21  33.33 
 
 		 441 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3140  CBS domain-containing protein  34.01 
 
 		 293 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.328358  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1125  hypothetical protein  32.89 
 
 		 279 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12300  hypothetical protein  32.89 
 
 		 279 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0655  CBS domain containing protein  32.81 
 
 		 273 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1394  hypothetical protein  32.43 
 
 		 292 aa  140  3e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1936  CBS domain containing protein  34.23 
 
 		 371 aa  140  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1066  protein of unknown function DUF21  31.94 
 
 		 426 aa  140  3e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.905964  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1578  CBS domain containing protein  38.75 
 
 		 537 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110465  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0011  CBS/transport-associated domain-containing protein  28.57 
 
 		 295 aa  140  4.999999999999999e-32  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0553  CBS domain containing protein  33.59 
 
 		 273 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000116003 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1602  hypothetical protein  32.09 
 
 		 292 aa  138  1e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004214  magnesium and cobalt efflux protein CorC  31 
 
 		 299 aa  138  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.990364  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1784  CBS domain-containing protein  33.46 
 
 		 284 aa  138  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000339521  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0082  hypothetical protein  33.47 
 
 		 455 aa  137  2e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000179952  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2741  transporter-associated region  33.11 
 
 		 281 aa  137  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.835583  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2368  CBS:transporter-associated region  30.71 
 
 		 284 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0890  CBS domain-containing protein  33.85 
 
 		 291 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.192583  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1243  hemolysin C  32.96 
 
 		 258 aa  137  4e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.419025  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3830  CBS domain-containing protein  37.66 
 
 		 464 aa  137  4e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2611  protein of unknown function DUF21  34.55 
 
 		 445 aa  136  5e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2136  CBS domain containing protein  31.81 
 
 		 311 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0496158  normal  0.0714936 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0082  hypothetical protein  33.06 
 
 		 455 aa  135  8e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000182254  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0738  CBS domain-containing protein  33.59 
 
 		 435 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1262  hypothetical protein  35.41 
 
 		 533 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0419  CBS domain containing protein  34.77 
 
 		 309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.622 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09040  CBS domain-containing transporter  31.35 
 
 		 280 aa  135  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.157725  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3277  protein of unknown function DUF21  29.89 
 
 		 437 aa  133  5e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000233033  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3451  CBS domain-containing protein  37.23 
 
 		 464 aa  133  5e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.553184  normal  0.0782726 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0528  hypothetical protein  32.54 
 
 		 298 aa  133  6e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0687971  normal  0.0248188 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1349  CBS domain containing protein  33.22 
 
 		 293 aa  133  6e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.038929  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>