More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0636 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0636  CBS domain-containing protein  100 
 
 
377 aa  733    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.693928 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3402  CBS domain containing protein  73.33 
 
 
384 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.224461  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3207  CBS domain-containing protein  72.3 
 
 
382 aa  477  1e-133  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.403327  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3531  CBS domain containing protein  72.3 
 
 
382 aa  477  1e-133  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.307837  normal  0.3242 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0232  CBS domain containing protein  67.75 
 
 
373 aa  464  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.1637  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3179  CBS domain-containing protein  64.19 
 
 
389 aa  448  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0353609  normal  0.0370442 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2894  CBS domain containing protein  57.37 
 
 
357 aa  306  3e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.594512 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1058  CBS domain-containing protein  53.31 
 
 
344 aa  301  9e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.279471  normal  0.884616 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0449  CBS domain containing protein  48.27 
 
 
381 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0017  ctransporter-associated region  49.7 
 
 
375 aa  281  1e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0674373 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0593  HlyC/CorC family transporter  50.77 
 
 
376 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0471  CBS  47.08 
 
 
420 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.603908 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0024  CBS:transporter-associated  49.69 
 
 
374 aa  281  2e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0239  HlyC/CorC family transporters  49.07 
 
 
375 aa  279  6e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0049  transporter  48.62 
 
 
386 aa  272  7e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0043  CBS domain-containing protein  46.24 
 
 
391 aa  267  2e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0313302  hitchhiker  0.00000000114145 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1813  CBS domain-containing protein  47.8 
 
 
324 aa  260  4e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.345805  normal  0.271676 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0028  CBS domain containing protein  47.71 
 
 
377 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.490023  normal  0.0271352 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0016  transporter-associated region  50.16 
 
 
383 aa  259  8e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.305218 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0441  hemolysin  49.53 
 
 
345 aa  258  8e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.327012  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3620  CBS domain-containing protein  45.51 
 
 
319 aa  249  6e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0755  CBS domain-containing protein  43.75 
 
 
373 aa  248  1e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3922  transporter-associated region  45.29 
 
 
353 aa  248  2e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2069  CBS domain-containing protein  43.07 
 
 
374 aa  234  2.0000000000000002e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00161693  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1246  magnesium and cobalt efflux protein CorC  41.38 
 
 
340 aa  232  7.000000000000001e-60  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.96607  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2157  CBS domain-containing protein  46.1 
 
 
342 aa  232  1e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.151926  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0191  CBS domain-containing protein  42.86 
 
 
300 aa  203  5e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1014  CBS domain containing protein  41.59 
 
 
302 aa  195  1e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0266413  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3875  hypothetical protein  40.13 
 
 
314 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.266058  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0024  CBS domain-containing protein  41.39 
 
 
304 aa  183  5.0000000000000004e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.307011  normal  0.720082 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3036  CBS domain-containing protein  46.52 
 
 
296 aa  182  7e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1356  CBS domain-containing protein  38.44 
 
 
289 aa  182  8.000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0204179  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3597  CorC/Hlyc family protein  40.78 
 
 
315 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0738043  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3282  CBS domain-containing protein  40.18 
 
 
315 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.847272 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0704  CBS  43.4 
 
 
312 aa  179  8e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.345067 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3773  CBS domain-containing protein  38.44 
 
 
318 aa  178  2e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.163853  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0067  CBS domain containing protein  37.24 
 
 
324 aa  167  2.9999999999999998e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0388003 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2391  CBS domain-containing protein  35.28 
 
 
322 aa  166  5e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0979  CBS  37.78 
 
 
313 aa  163  5.0000000000000005e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.980181  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2158  CBS domain-containing protein  37.02 
 
 
314 aa  160  3e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.583239  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3694  CBS domain-containing protein  42.96 
 
 
310 aa  154  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.548204  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0240  Mg2+/Co2+ transporter  34.38 
 
 
291 aa  153  4e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0710  CBS domain-containing protein  29.66 
 
 
292 aa  151  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.592544  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1602  hypothetical protein  31.37 
 
 
292 aa  150  3e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2858  CBS domain-containing protein  32.12 
 
 
291 aa  150  4e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1394  hypothetical protein  31.37 
 
 
292 aa  149  6e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2368  CBS:transporter-associated region  33.67 
 
 
284 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3306  CBS domain-containing protein  32.22 
 
 
291 aa  146  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3442  CBS domain-containing protein  32.22 
 
 
291 aa  146  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000638255 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1103  CBS domain containing protein  32.22 
 
 
291 aa  146  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000107663 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3264  CBS domain-containing protein  32.22 
 
 
291 aa  146  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1178  magnesium and cobalt efflux protein CorC  31.8 
 
 
291 aa  144  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1005  CBS domain-containing protein  31.31 
 
 
291 aa  144  4e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0718327 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3140  CBS domain-containing protein  31.6 
 
 
293 aa  143  5e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.328358  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1001  CBS domain-containing protein  31.61 
 
 
291 aa  143  6e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.243259  normal  0.0641056 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1066  CBS domain-containing protein  31.61 
 
 
291 aa  143  6e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.354605  normal  0.0599682 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0553  CBS domain containing protein  31.52 
 
 
273 aa  142  7e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000116003 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2578  magnesium and cobalt efflux protein CorC  30.58 
 
 
292 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0721434 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1125  hypothetical protein  31.04 
 
 
279 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12300  hypothetical protein  31.04 
 
 
279 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0812  CBS:transporter associated  29.34 
 
 
292 aa  140  3e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2926  CBS domain-containing protein  30.61 
 
 
291 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00659921 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004214  magnesium and cobalt efflux protein CorC  29.97 
 
 
299 aa  139  6e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.990364  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1867  CBS domain containing protein  32.86 
 
 
285 aa  138  1e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00545793 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1784  CBS domain-containing protein  31.6 
 
 
284 aa  138  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000339521  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2111  CBS domain containing protein  34.16 
 
 
421 aa  138  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.241811  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4147  protein of unknown function DUF21  33.78 
 
 
463 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.263369 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4107  protein of unknown function DUF21  33.78 
 
 
463 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3699  CBS domain-containing protein  30.3 
 
 
291 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246978  hitchhiker  0.00355907 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1807  CBS  30.68 
 
 
298 aa  136  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.223069  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1066  protein of unknown function DUF21  29.07 
 
 
426 aa  136  7.000000000000001e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.905964  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3474  CBS domain-containing protein  30.3 
 
 
291 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.42  hitchhiker  0.00607831 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1000  CBS domain containing protein  31.79 
 
 
287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0370099  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3839  hypothetical protein  32.9 
 
 
425 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2741  transporter-associated region  29.13 
 
 
281 aa  134  3e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.835583  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1456  magnesium and cobalt efflux protein CorC  31 
 
 
284 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00173357  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0738  CBS domain-containing protein  32.39 
 
 
435 aa  132  7.999999999999999e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0655  CBS domain containing protein  32.14 
 
 
273 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2733  CBS domain containing protein  31.71 
 
 
284 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.377385  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1181  CBS domain containing protein  31.4 
 
 
299 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1330  CBS domain-containing protein  29.69 
 
 
275 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.964649  normal  0.0685098 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4807  metal ion transporter, putative  30.84 
 
 
280 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3260  CBS domain containing protein  31.13 
 
 
287 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1936  CBS domain containing protein  32.23 
 
 
371 aa  130  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4348  CBS:transporter-associated region  30.24 
 
 
280 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1468  CBS domain containing protein  33.22 
 
 
447 aa  129  7.000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0356908  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3245  protein of unknown function DUF21  36.36 
 
 
442 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0319126  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3782  CBS domain-containing protein  30.47 
 
 
279 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.964712  normal  0.253 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0631  CBS domain-containing protein  30.45 
 
 
279 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00687954  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0751  CBS domain containing protein  31.15 
 
 
291 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000558025 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0599  magnesium and cobalt efflux protein, putative  31.15 
 
 
291 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0015  CBS domain containing protein  33.81 
 
 
434 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2282  CBS domain-containing protein  30.39 
 
 
250 aa  127  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4395  hypothetical protein  32.65 
 
 
439 aa  127  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0154532  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12392  transmembrane protein  31.25 
 
 
435 aa  127  3e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2361  hypothetical protein  29.79 
 
 
432 aa  127  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00115702  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4953  transporter-associated region  30.15 
 
 
279 aa  127  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.387365 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2136  CBS domain containing protein  30.66 
 
 
311 aa  127  3e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0496158  normal  0.0714936 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0036  putative transporter  29.79 
 
 
421 aa  127  3e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0060  CBS domain pair protein  28.67 
 
 
259 aa  127  3e-28  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>