53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0034 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0034  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  100 
 
 		 172 aa  339  1e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.510186  normal  0.239177 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8118  hypothetical protein  73.78 
 
 		 173 aa  233  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.564267  normal  0.663077 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4145  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  72.02 
 
 		 173 aa  227  7e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.704606  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0591  hypothetical protein  73.72 
 
 		 180 aa  203  8e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2850  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  63.47 
 
 		 171 aa  203  1e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0762235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02510  hypothetical protein  63.58 
 
 		 181 aa  199  9.999999999999999e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0689687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6768  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  66.47 
 
 		 184 aa  191  4e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.560351  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1840  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  62.28 
 
 		 182 aa  188  2.9999999999999997e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0451372  normal  0.219108 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4342  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  62.35 
 
 		 184 aa  184  7e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.519353 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1697  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  60 
 
 		 177 aa  183  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.158156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1719  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  60 
 
 		 177 aa  179  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.325285  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1765  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  60 
 
 		 177 aa  179  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.561232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8692  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  63.35 
 
 		 180 aa  171  5e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0872  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  70.29 
 
 		 231 aa  167  5e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.497961  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4973  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  65.44 
 
 		 183 aa  167  8e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3610  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  56.55 
 
 		 180 aa  166  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02710  hypothetical protein  55.62 
 
 		 180 aa  159  1e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0577764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1617  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  56.71 
 
 		 186 aa  157  7e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.834143 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2044  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  50.84 
 
 		 190 aa  155  3e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2291  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  52.33 
 
 		 189 aa  139  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.911119 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21350  hypothetical protein  46.82 
 
 		 210 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0855056  normal  0.358987 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1438  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  49.71 
 
 		 188 aa  135  3.0000000000000003e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.78222  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34850  putative tRNA synthase  51.13 
 
 		 180 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00137081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4449  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  43.88 
 
 		 179 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000475231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0770  hypothetical protein  43.88 
 
 		 179 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3668  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  46.49 
 
 		 127 aa  91.7  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.189269 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2562  ybaK/ebsC protein  30.65 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0161  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  37.37 
 
 		 163 aa  50.8  0.000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00528766 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1766  hypothetical protein  27.74 
 
 		 158 aa  50.4  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.547358  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2689  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  34.16 
 
 		 154 aa  50.1  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1201  ybaK/ebsC protein  40 
 
 		 155 aa  48.9  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00297582  hitchhiker  0.00069795 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1005  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  26.85 
 
 		 158 aa  47.8  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2120  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  32.98 
 
 		 156 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2119  ybaK/ebsC protein  31.15 
 
 		 157 aa  44.7  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.443897  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2094  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  42.11 
 
 		 174 aa  44.7  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.266304  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4590  hypothetical protein  26.15 
 
 		 156 aa  43.9  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.938781  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0355  ebsC protein, putative  22.78 
 
 		 168 aa  43.9  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09630  ybaK/ebsC protein  25.24 
 
 		 161 aa  43.5  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.443287  hitchhiker  0.00251062 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0967  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  29.41 
 
 		 161 aa  43.5  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0057885  normal  0.753698 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1376  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  25 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0940  ybaK/ebsC protein  25.89 
 
 		 169 aa  42.7  0.003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4879  ybaK/ebsC protein  32.2 
 
 		 162 aa  42.4  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.262878  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2987  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  47.83 
 
 		 171 aa  42  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2700  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  34.62 
 
 		 165 aa  41.6  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.102685 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1755  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  37.7 
 
 		 156 aa  41.2  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1328  hypothetical protein  34.25 
 
 		 158 aa  41.6  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0917031  normal  0.183333 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0896  ybaK/ebsC protein  28.4 
 
 		 158 aa  41.2  0.007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000040826  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0737  ybaK/ebsC protein  26.23 
 
 		 160 aa  41.2  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0721  ybaK/ebsC protein  26.23 
 
 		 160 aa  41.2  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3402  YbaK/prolyl-tRNA synthetase-like protein  30.93 
 
 		 162 aa  40.8  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.702018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1956  ybaK/ebsC protein  34.55 
 
 		 164 aa  40.8  0.008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.145688  hitchhiker  0.00991863 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0795  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  38.75 
 
 		 156 aa  40.8  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.630497  hitchhiker  0.00199357 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1653  putative ybaK-like protein  30 
 
 		 155 aa  40.8  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>