171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5021 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_5021  PfkB domain protein  100 
 
 		 311 aa  597  1e-170  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1940  PfkB  36.21 
 
 		 294 aa  201  9.999999999999999e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123547  normal  0.0238447 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0022  PfkB domain protein  37.72 
 
 		 291 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0020  PfkB domain protein  37.37 
 
 		 291 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1546  PfkB domain protein  37.02 
 
 		 285 aa  195  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.418317 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1986  PfkB  38.62 
 
 		 286 aa  193  3e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.842187 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1913  PfkB domain-containing protein  36.21 
 
 		 288 aa  192  8e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2097  PfkB domain protein  46.77 
 
 		 296 aa  146  3e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0568706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38340  sugar kinase, ribokinase  42.59 
 
 		 288 aa  145  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6930  PfkB domain protein  46.49 
 
 		 313 aa  141  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0378  PfkB domain protein  41.33 
 
 		 301 aa  128  1.0000000000000001e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3555  PfkB domain protein  43.87 
 
 		 284 aa  128  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1248  PfkB domain protein  37.42 
 
 		 310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000612898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3386  ribokinase-like domain-containing protein  35.71 
 
 		 298 aa  110  3e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1314  PfkB domain protein  41.89 
 
 		 301 aa  108  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0587994  hitchhiker  0.00301376 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5931  hypothetical protein  40.46 
 
 		 453 aa  98.2  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.090162  decreased coverage  0.00187432 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2838  putative sugar kinase  27.18 
 
 		 299 aa  92.8  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3654  PfkB  26.12 
 
 		 300 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.349862 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1648  PfkB  26.85 
 
 		 297 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.46421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1805  PfkB  25.68 
 
 		 318 aa  89  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.512756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4302  PfkB domain protein  26.12 
 
 		 297 aa  85.5  9e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0970  carbohydrate kinase  31.89 
 
 		 314 aa  78.6  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2817  PfkB domain protein  32.95 
 
 		 295 aa  75.9  0.0000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.575722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0671  PfkB  29.09 
 
 		 309 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1019  PfkB domain protein  31.23 
 
 		 284 aa  71.2  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.485278 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0692  carbohydrate kinase  30.3 
 
 		 304 aa  70.1  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.19709  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2483  PfkB domain protein  29.37 
 
 		 302 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1736  PfkB domain protein  27.84 
 
 		 304 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0090  PfkB  27.64 
 
 		 309 aa  67.4  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.125237 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0616  PfkB domain protein  29.08 
 
 		 312 aa  66.6  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.246916  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0799  ribokinase-like domain-containing protein  33.47 
 
 		 310 aa  65.1  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2838  ribokinase  31.51 
 
 		 314 aa  63.2  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760591  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0460  PfkB  26.39 
 
 		 308 aa  62  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.413409  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2334  PfkB domain protein  29.21 
 
 		 314 aa  60.5  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0161012  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4851  PfkB  30.32 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.733485  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5471  PfkB domain protein  29.31 
 
 		 324 aa  59.3  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.784292 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0980  ribokinase-like domain-containing protein  29.55 
 
 		 300 aa  59.3  0.00000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.167032 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4348  kinase, PfkB family  30.27 
 
 		 298 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4302  kinase PfkB family  30.27 
 
 		 298 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4413  PfkB family kinase  30.27 
 
 		 298 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4257  kinase, PfkB family  30.27 
 
 		 298 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4235  kinase, PfkB family  30.27 
 
 		 298 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.907464  normal  0.927219 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  26.61 
 
 		 308 aa  57.8  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03768  predicted sugar kinase  29.93 
 
 		 298 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4103  PfkB domain protein  29.93 
 
 		 298 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3738  carbohydrate kinase  28.57 
 
 		 315 aa  57.4  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0822309  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5330  kinase, PfkB family  29.93 
 
 		 298 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.574224 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3470  ribokinase  28.57 
 
 		 315 aa  57.4  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.973567  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03717  hypothetical protein  29.93 
 
 		 298 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.953641  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4406  PfkB family kinase  29.93 
 
 		 298 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1124  ribokinase  26.09 
 
 		 403 aa  57.4  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4268  PfkB family kinase  29.93 
 
 		 298 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4029  carbohydrate kinase, PfkB  34.56 
 
 		 299 aa  55.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0358  ribokinase-like domain-containing protein  30.98 
 
 		 306 aa  55.1  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2764  PfkB domain protein  31.67 
 
 		 289 aa  55.1  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.11778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4103  PfkB family kinase  28.95 
 
 		 298 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4140  ribokinase-like domain-containing protein  28.95 
 
 		 298 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.682006  normal  0.581205 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  26.53 
 
 		 308 aa  54.3  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4218  ribokinase  27.64 
 
 		 309 aa  53.5  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.980767 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5201  PfkB domain protein  26.6 
 
 		 326 aa  53.5  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal  0.135366 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4168  ribokinase  27.64 
 
 		 309 aa  53.5  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4277  ribokinase  27.64 
 
 		 309 aa  53.5  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.136431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  26.53 
 
 		 308 aa  53.9  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4097  ribokinase  27.64 
 
 		 309 aa  53.9  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  26.53 
 
 		 308 aa  53.9  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03638  ribokinase  25.91 
 
 		 309 aa  53.5  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00223583  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  30 
 
 		 303 aa  53.5  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3407  ribokinase  25.36 
 
 		 424 aa  53.1  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4112  ribokinase  27.64 
 
 		 309 aa  53.1  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3968  ribokinase  26.94 
 
 		 309 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112559  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4268  ribokinase  26.94 
 
 		 309 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00050994  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03583  hypothetical protein  25.91 
 
 		 309 aa  53.5  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00147711  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5220  PfkB domain protein  31.62 
 
 		 313 aa  53.1  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.946183  normal  0.655823 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4242  ribokinase  26.94 
 
 		 309 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00710658 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4167  ribokinase  26.94 
 
 		 309 aa  53.1  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.895072  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0113  PfkB domain protein  27.37 
 
 		 290 aa  53.1  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.245631  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4120  ribokinase  26.94 
 
 		 314 aa  53.1  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.444588  normal  0.199768 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5188  ribokinase  26.94 
 
 		 314 aa  53.1  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.034479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0749  ribokinase  25.51 
 
 		 306 aa  52.8  0.000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000720941  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  28.03 
 
 		 305 aa  52.4  0.000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4215  ribokinase  26.53 
 
 		 309 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2451  ribokinase  27.27 
 
 		 344 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.909418  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36053  predicted protein  30.99 
 
 		 393 aa  52.4  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.630596  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0869  ribokinase-like domain-containing protein  21.27 
 
 		 290 aa  52  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  29.17 
 
 		 310 aa  52  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2283  ribokinase  27.12 
 
 		 310 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.269259 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5483  PfkB domain protein  29.03 
 
 		 313 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.235286 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2615  PfkB domain protein  26.26 
 
 		 305 aa  51.2  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  25.91 
 
 		 306 aa  50.8  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1976  putative ribokinase  28.57 
 
 		 305 aa  50.4  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.191043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4349  kinase, PfkB family  28.62 
 
 		 298 aa  50.8  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4122  PfkB  23.97 
 
 		 320 aa  50.1  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1084  PfkB family DNA-binding protein/kinase  22.59 
 
 		 404 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4591  ribokinase  28.88 
 
 		 295 aa  50.4  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  24.57 
 
 		 304 aa  50.1  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  27.18 
 
 		 305 aa  49.7  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2455  PfkB domain-containing protein  32.03 
 
 		 282 aa  49.7  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.287722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4200  ribokinase  31.88 
 
 		 326 aa  49.7  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  23.33 
 
 		 306 aa  49.3  0.00009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2239  ribokinase-like domain-containing protein  26.29 
 
 		 306 aa  48.9  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>