More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3867 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_3867  histidine kinase  100 
 
 
434 aa  837    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.265271  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2301  Histidine kinase  46.99 
 
 
412 aa  260  4e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1255  histidine kinase  44.5 
 
 
463 aa  247  3e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3934  histidine kinase  41.79 
 
 
442 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0211  histidine kinase  39.3 
 
 
463 aa  213  7e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0199  histidine kinase  43.66 
 
 
452 aa  212  7.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3907  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.77 
 
 
428 aa  212  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0949  histidine kinase  50.65 
 
 
416 aa  209  5e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09220  signal transduction histidine kinase  36.18 
 
 
492 aa  209  7e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.253701 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2507  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.81 
 
 
405 aa  209  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401085  normal  0.727575 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0354  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.65 
 
 
438 aa  209  1e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2700  histidine kinase  41.04 
 
 
429 aa  203  4e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000394923  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2340  histidine kinase  44.03 
 
 
388 aa  198  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0329  signal transduction histidine kinase  44.53 
 
 
435 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.982298  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4728  histidine kinase  36.14 
 
 
429 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0424  histidine kinase  34.55 
 
 
438 aa  197  3e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.680525  hitchhiker  0.00719111 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1961  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.59 
 
 
444 aa  194  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000367534  hitchhiker  0.000000631341 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5647  histidine kinase  35.17 
 
 
433 aa  194  4e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.559873  normal  0.146404 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0386  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 
418 aa  192  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6198  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.87 
 
 
415 aa  191  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.129005  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2132  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.64 
 
 
433 aa  189  8e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.569038  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4415  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.48 
 
 
386 aa  187  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0384972 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2525  histidine kinase  35.84 
 
 
434 aa  187  4e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0362104  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3200  Signal transduction histidine kinase-like protein  40.84 
 
 
395 aa  186  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2757  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  38.04 
 
 
433 aa  186  1.0000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.128423  normal  0.0502627 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6138  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.08 
 
 
403 aa  185  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278868  normal  0.229544 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2091  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.07 
 
 
466 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0635  histidine kinase  38.64 
 
 
430 aa  182  8.000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.181904 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4456  histidine kinase  36.49 
 
 
410 aa  181  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2298  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.98 
 
 
432 aa  181  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.317439  normal  0.783172 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1360  histidine kinase  51.13 
 
 
476 aa  181  2e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.388977 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3908  putative signal transduction histidine kinase  36.39 
 
 
435 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3982  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.39 
 
 
435 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.335335  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4385  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.64 
 
 
445 aa  181  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3923  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.39 
 
 
435 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534106  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2281  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.25 
 
 
445 aa  181  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.67096  normal  0.255683 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4726  histidine kinase  37.29 
 
 
405 aa  180  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0308  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.45 
 
 
405 aa  179  7e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.130128 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3491  putative signal transduction histidine kinase  48.13 
 
 
624 aa  179  7e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4050  Histidine kinase  47.6 
 
 
374 aa  178  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.313821  hitchhiker  0.00550271 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3718  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.55 
 
 
586 aa  177  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118329  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4606  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.72 
 
 
417 aa  176  6e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0890367  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2249  histidine kinase  46.64 
 
 
420 aa  175  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.795375  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0531  histidine kinase  46.18 
 
 
429 aa  175  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.005431  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4660  histidine kinase  45.5 
 
 
402 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3546  histidine kinase  45.45 
 
 
489 aa  173  5.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.871685 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9331  Signal transduction histidine kinase-like protein  46.33 
 
 
508 aa  172  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.542521 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0609  histidine kinase  35.92 
 
 
442 aa  172  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54142 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0971  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.01 
 
 
417 aa  171  3e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2433  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.89 
 
 
461 aa  168  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.189775  normal  0.142881 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2927  histidine kinase  35.35 
 
 
383 aa  167  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000936268  hitchhiker  0.0000101948 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12660  signal transduction histidine kinase  39.09 
 
 
444 aa  167  4e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.224023  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1652  Histidine kinase  52.79 
 
 
439 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.527879  normal  0.680022 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0262  putative signal transduction histidine kinase  35.58 
 
 
465 aa  162  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.186103 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3763  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.06 
 
 
375 aa  157  5.0000000000000005e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.200679  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0204  histidine kinase  44.62 
 
 
446 aa  156  6e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8723  Histidine kinase  45.63 
 
 
365 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3516  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.58 
 
 
388 aa  152  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.370817  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3104  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  53.4 
 
 
459 aa  151  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.8316  hitchhiker  0.000380562 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4333  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.74 
 
 
343 aa  150  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0375931  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35880  signal transduction histidine kinase  52.78 
 
 
454 aa  149  8e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.263807 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0319  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.96 
 
 
382 aa  147  4.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.499307  normal  0.099987 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4688  histidine kinase  39.72 
 
 
419 aa  146  6e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6699  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.13 
 
 
621 aa  145  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2758  histidine kinase  46.05 
 
 
389 aa  145  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00845914  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17590  signal transduction histidine kinase  41.67 
 
 
326 aa  144  3e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0109488  normal  0.353356 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0085  putative signal transduction histidine kinase  46.23 
 
 
587 aa  142  9e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4021  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.83 
 
 
411 aa  140  3.9999999999999997e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185539  normal  0.088504 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07210  histidine kinase  44.5 
 
 
237 aa  139  8.999999999999999e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1916  histidine kinase  36.55 
 
 
410 aa  137  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2642  histidine kinase  41.23 
 
 
426 aa  134  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.992033  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0967  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.15 
 
 
408 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.849709 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11900  signal transduction histidine kinase  34.66 
 
 
447 aa  130  4.0000000000000003e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2071  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.48 
 
 
725 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.249392  normal  0.37167 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.34 
 
 
422 aa  128  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5907  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.64 
 
 
408 aa  127  6e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.155683  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3330  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.1 
 
 
398 aa  125  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0149067  normal  0.138525 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0811  histidine kinase  44.32 
 
 
580 aa  123  7e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2540  putative signal transduction histidine kinase  40.58 
 
 
570 aa  123  8e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2641  histidine kinase  37.73 
 
 
453 aa  117  5e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0175588  hitchhiker  0.00721729 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7224  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.87 
 
 
594 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3049  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.38 
 
 
565 aa  102  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0199075  normal  0.598323 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0357  sensor histidine kinase  32.56 
 
 
459 aa  99.8  9e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1082  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.1 
 
 
401 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0248  putative signal transduction histidine kinase  34.51 
 
 
470 aa  98.6  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1055  putative signal transduction histidine kinase  35.51 
 
 
401 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.64157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1071  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.51 
 
 
401 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0301  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.35 
 
 
748 aa  98.2  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5015  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.27 
 
 
399 aa  97.1  6e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  0.324397 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3418  sensor histidine kinase  35.63 
 
 
481 aa  96.7  7e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.986219  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6491  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.56 
 
 
576 aa  96.7  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.194722  normal  0.40327 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3575  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.02 
 
 
475 aa  96.3  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2605  Histidine kinase  40.1 
 
 
650 aa  95.9  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209527  normal  0.327771 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1296  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.95 
 
 
386 aa  95.5  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4975  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.17 
 
 
326 aa  94.7  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.981811  normal  0.286418 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0554  Histidine kinase  37.17 
 
 
687 aa  94.7  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158949  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2334  sensor histidine kinase  28.85 
 
 
470 aa  92.8  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1533  histidine kinase  39.05 
 
 
451 aa  92.8  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0016197  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0153  histidine kinase  35.1 
 
 
325 aa  92  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0341  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 
725 aa  91.7  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0143238  hitchhiker  0.0051816 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>