160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3142 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3142  amidohydrolase  100 
 
 		 359 aa  707    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000508689  normal  0.129698 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5929  amidohydrolase  58.19 
 
 		 356 aa  379  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117607  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12929  hypothetical protein  56.9 
 
 		 370 aa  352  8e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0687  normal  0.519945 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1940  amidohydrolase  55.31 
 
 		 368 aa  339  5e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.864175 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1960  amidohydrolase  55.31 
 
 		 368 aa  338  5.9999999999999996e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2006  amidohydrolase  55.31 
 
 		 368 aa  338  5.9999999999999996e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0811412  normal  0.722686 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09720  Pro-Hyp dipeptidase  57.1 
 
 		 354 aa  337  9.999999999999999e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.885607 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4181  amidohydrolase  56.42 
 
 		 362 aa  325  6e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2182  amidohydrolase  52.84 
 
 		 360 aa  324  1e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.322343  normal  0.931322 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1612  amidohydrolase  54.66 
 
 		 358 aa  320  3e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0569822  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4010  amidohydrolase  53.87 
 
 		 361 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3262  amidohydrolase  48.88 
 
 		 361 aa  304  1.0000000000000001e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11020  amidohydrolase, imidazolonepropionase  52.37 
 
 		 366 aa  298  8e-80  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.161229  normal  0.0546284 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2082  amidohydrolase  53.01 
 
 		 357 aa  294  1e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1281  amidohydrolase  52.35 
 
 		 364 aa  288  9e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2226  amidohydrolase  49.85 
 
 		 360 aa  286  4e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000139869 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1562  amidohydrolase 3  48.91 
 
 		 362 aa  285  5.999999999999999e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.345787  normal  0.0640888 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23760  amidohydrolase, imidazolonepropionase  48.78 
 
 		 378 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.318525 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3462  amidohydrolase 3  50.83 
 
 		 365 aa  283  3.0000000000000004e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1397  amidohydrolase  51.18 
 
 		 359 aa  274  2.0000000000000002e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.503845  decreased coverage  0.00549847 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2486  amidohydrolase  47.87 
 
 		 360 aa  272  7e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.445092  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1469  amidohydrolase  51.82 
 
 		 362 aa  264  2e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.145414 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1166  amidohydrolase  49.54 
 
 		 373 aa  254  1.0000000000000001e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1191  amidohydrolase  47.63 
 
 		 359 aa  252  7e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.251504  normal  0.0810275 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09960  amidohydrolase, imidazolonepropionase  48.92 
 
 		 388 aa  250  3e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0916327  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1302  amidohydrolase  47.63 
 
 		 359 aa  248  1e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0984  amidohydrolase  45.22 
 
 		 358 aa  235  7e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000713577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2244  amidohydrolase  44.14 
 
 		 367 aa  232  8.000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.244187  normal  0.209508 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2609  amidohydrolase  27.96 
 
 		 396 aa  107  5e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1219  amidohydrolase  28.8 
 
 		 390 aa  104  3e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.82253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  26.09 
 
 		 407 aa  91.7  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2941  amidohydrolase  28.4 
 
 		 390 aa  90.9  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.270763  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  27.3 
 
 		 434 aa  84.7  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  29.17 
 
 		 433 aa  84  0.000000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18800  amidohydrolase, imidazolonepropionase  31.25 
 
 		 416 aa  83.2  0.000000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0282711  normal  0.197659 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  23.84 
 
 		 400 aa  81.6  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  25.56 
 
 		 407 aa  80.9  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  26.74 
 
 		 433 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4565  amidohydrolase  26.06 
 
 		 423 aa  77.8  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.244661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  26.8 
 
 		 445 aa  77  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0479  amidohydrolase  26.05 
 
 		 401 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  26.48 
 
 		 426 aa  76.6  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  24.07 
 
 		 413 aa  75.9  0.0000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  25.41 
 
 		 440 aa  74.7  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  26.5 
 
 		 433 aa  75.1  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  33.33 
 
 		 426 aa  73.9  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2515  amidohydrolase  26.91 
 
 		 426 aa  73.2  0.000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3036  amidohydrolase  26.37 
 
 		 407 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3308  amidohydrolase  31.35 
 
 		 419 aa  73.2  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692035  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0935  amidohydrolase  26.99 
 
 		 428 aa  72.4  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.755972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  25.74 
 
 		 444 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  25.32 
 
 		 430 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  25.7 
 
 		 459 aa  70.9  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1408  amidohydrolase  29.11 
 
 		 402 aa  70.5  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.321357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5618  amidohydrolase  35.52 
 
 		 422 aa  69.7  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.313113  normal  0.102085 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0462  amidohydrolase  31.43 
 
 		 401 aa  68.9  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000842595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  27.69 
 
 		 438 aa  68.2  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0420  amidohydrolase  34.03 
 
 		 418 aa  67.8  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  25.42 
 
 		 437 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  23.82 
 
 		 426 aa  67.4  0.0000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3650  amidohydrolase  31.15 
 
 		 428 aa  67.4  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1967  amidohydrolase  24.65 
 
 		 405 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3671  amidohydrolase  27.76 
 
 		 428 aa  67  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  23.48 
 
 		 441 aa  67  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2646  amidohydrolase  26.27 
 
 		 391 aa  66.6  0.0000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2208  amidohydrolase  28.13 
 
 		 440 aa  66.6  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00166067 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0159  amidohydrolase  26.67 
 
 		 415 aa  65.5  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  29.65 
 
 		 408 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3822  amidohydrolase  29.65 
 
 		 408 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3761  amidohydrolase  29.65 
 
 		 408 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225154  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  26.48 
 
 		 432 aa  65.9  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2978  amidohydrolase  28.97 
 
 		 429 aa  65.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3237  amidohydrolase  27.39 
 
 		 404 aa  65.5  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4855  amidohydrolase  29.95 
 
 		 403 aa  65.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165345  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4125  amidohydrolase  25.35 
 
 		 409 aa  65.1  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0432  amidohydrolase  24.59 
 
 		 421 aa  64.7  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  26.45 
 
 		 428 aa  65.1  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3368  amidohydrolase  28.63 
 
 		 414 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.929128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4292  amidohydrolase  29.69 
 
 		 402 aa  63.2  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2823  amidohydrolase  27.27 
 
 		 422 aa  63.2  0.000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.750141  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2402  amidohydrolase  28.02 
 
 		 397 aa  63.2  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3715  amidohydrolase  29.68 
 
 		 417 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355417  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2093  amidohydrolase  24.09 
 
 		 431 aa  62.8  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.885062  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3788  amidohydrolase  29.68 
 
 		 417 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.463322  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4188  amidohydrolase  30.36 
 
 		 421 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  27.23 
 
 		 412 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3728  amidohydrolase  29.68 
 
 		 417 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  22.69 
 
 		 407 aa  61.6  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1549  amidohydrolase  28.29 
 
 		 413 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  26.12 
 
 		 423 aa  61.6  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  25.91 
 
 		 430 aa  62  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01184  conserved hypothetical protein  23.62 
 
 		 445 aa  61.2  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1413  amidohydrolase  27.47 
 
 		 423 aa  60.5  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1852  imidazolonepropionase related amidohydrolase  23.32 
 
 		 410 aa  60.1  0.00000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2115  amidohydrolase  27.25 
 
 		 426 aa  59.7  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  25.07 
 
 		 444 aa  59.7  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2437  amidohydrolase  26.73 
 
 		 411 aa  59.3  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3597  amidohydrolase  32.02 
 
 		 445 aa  58.9  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5427  amidohydrolase  25.67 
 
 		 432 aa  58.9  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0808338 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2354  amidohydrolase  25.98 
 
 		 420 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>