More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2239 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_2274  protease domain-containing protein  42.91 
 
 
1115 aa  700    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0667485  unclonable  0.00000000204116 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3034  hypothetical protein  57.88 
 
 
1099 aa  1204    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.487731  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1513  protease domain-containing protein  42.46 
 
 
1116 aa  689    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0327061 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2239  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  100 
 
 
1099 aa  2184    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00131913  normal  0.475839 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1394  hypothetical protein  36.17 
 
 
1109 aa  473  1e-132  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.47721 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3335  serine protease  37.22 
 
 
983 aa  414  1e-114  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05530  cell wall-binding protein  37.77 
 
 
1312 aa  358  2.9999999999999997e-97  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0876125  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0781  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.29 
 
 
1283 aa  355  2e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.223596  hitchhiker  0.00753256 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2616  hypothetical protein  36.21 
 
 
1406 aa  355  4e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0177484  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0825  protease domain-containing protein  37.09 
 
 
1258 aa  351  4e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.184637  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3768  protease domain-containing protein  34.99 
 
 
1265 aa  342  2e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000500867  hitchhiker  0.00925065 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5216  serine protease  37.68 
 
 
971 aa  339  9.999999999999999e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.415091  normal  0.502606 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0832  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.36 
 
 
1292 aa  339  1.9999999999999998e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0819  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.22 
 
 
1286 aa  335  3e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000454384 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1035  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.61 
 
 
1474 aa  327  6e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.310715  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0744  serine protease  34.08 
 
 
1725 aa  326  2e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0229  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.75 
 
 
1312 aa  325  3e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.83599  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2960  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.01 
 
 
1659 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.929351  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3909  serine protease  35.11 
 
 
1042 aa  317  9e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.634  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0935  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.21 
 
 
1199 aa  311  4e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.755252  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4539  serine protease  32.75 
 
 
1634 aa  308  3e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0502  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.29 
 
 
1648 aa  306  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3175  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.89 
 
 
1649 aa  303  1e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3529  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.8 
 
 
1648 aa  302  2e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0501  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.8 
 
 
1648 aa  302  3e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1343  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.08 
 
 
1000 aa  301  3e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3152  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.53 
 
 
1645 aa  295  4e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0548  protease domain-containing protein  35.19 
 
 
1006 aa  295  4e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3302  serine protease  32.75 
 
 
1287 aa  293  1e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0682  2-alkenal reductase  37.11 
 
 
1109 aa  292  2e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02600  subtilase family protease/peptidase inhibitor I9  35.84 
 
 
994 aa  290  9e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.816435  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1690  protease domain-containing protein  33.07 
 
 
1300 aa  287  8e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.983324  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1915  serine protease  32.37 
 
 
1300 aa  286  2.0000000000000002e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2959  protease domain-containing protein  33.55 
 
 
1298 aa  283  1e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.161686 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0822  cell wall anchor domain-containing protein  31.79 
 
 
1705 aa  283  1e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.658117  decreased coverage  0.00000160097 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3201  cell wall anchor domain-containing protein  31.79 
 
 
1705 aa  283  1e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.151365 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2834  protease domain-containing protein  33.29 
 
 
1298 aa  283  2e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2816  protease domain-containing protein  33.25 
 
 
1298 aa  281  5e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.738271  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1542  protease-associated PA domain protein  33.29 
 
 
1298 aa  281  7e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.689219  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3430  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.43 
 
 
1649 aa  278  4e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.433791  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1500  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.06 
 
 
1293 aa  275  3e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3545  hypothetical protein  32.54 
 
 
1639 aa  273  1e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01952  serine protease, subtilase family protein  27.9 
 
 
1321 aa  273  2e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0544  protease domain-containing protein  34.72 
 
 
1045 aa  273  2e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3304  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.03 
 
 
1706 aa  273  2e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.876918  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2696  serine protease  32.69 
 
 
1739 aa  272  2.9999999999999997e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0555  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.11 
 
 
1399 aa  268  5.999999999999999e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0581373 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3301  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.45 
 
 
1669 aa  265  4e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0728  protease domain-containing protein  32.62 
 
 
1035 aa  261  4e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0807  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.25 
 
 
1705 aa  261  6e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0151  serine protease  29.15 
 
 
1638 aa  255  3e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0579  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.8 
 
 
1638 aa  252  2e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0635  serine protease  31.2 
 
 
1683 aa  249  2e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3374  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.31 
 
 
1638 aa  245  3e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2849  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.48 
 
 
1160 aa  196  3e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00446023  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0669  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.53 
 
 
728 aa  179  3e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5031  subtilase domain-containing protein  28.26 
 
 
1407 aa  159  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5011  minor extracellular protease VPR  28.26 
 
 
1407 aa  159  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5001  hypothetical protein  28.38 
 
 
1407 aa  159  3e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4623  subtilisin-like serine protease  28.55 
 
 
1406 aa  157  8e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05540  cell wall-binding protein  38.77 
 
 
962 aa  157  1e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4101  minor extracellular protease  26.03 
 
 
917 aa  155  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4488  minor extracellular protease VpR  26.42 
 
 
917 aa  152  3e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4203  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.61 
 
 
915 aa  152  4e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4090  minor extracellular protease  25.72 
 
 
917 aa  147  9e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.957358  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4475  minor extracellular protease VpR  25.54 
 
 
917 aa  147  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4436  minor extracellular protease VpR  25.72 
 
 
917 aa  147  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0761  minor extracellular protease VpR  25.85 
 
 
917 aa  147  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00881527  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4252  minor extracellular protease VpR  25.6 
 
 
917 aa  144  6e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4584  minor extracellular protease VpR  25.6 
 
 
917 aa  144  6e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4437  minor extracellular protease VpR  26.12 
 
 
917 aa  143  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0084  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  28.31 
 
 
860 aa  119  5e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000306364  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2222  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.14 
 
 
891 aa  118  6.9999999999999995e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2370  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.5 
 
 
1124 aa  113  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1721  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.76 
 
 
1323 aa  105  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00699469  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1747  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.11 
 
 
1565 aa  104  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0213398  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0393  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.21 
 
 
660 aa  101  7e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.13824 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0468  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  26.96 
 
 
860 aa  100  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2308  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.6 
 
 
1776 aa  95.1  7e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0731  hypothetical protein  29.79 
 
 
235 aa  94.4  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3050  protease-associated PA  25.14 
 
 
1220 aa  92.8  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000558142  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3564  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.41 
 
 
1060 aa  92.4  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8183  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  42.11 
 
 
1239 aa  92  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.574663  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3800  serine protease  26.06 
 
 
1215 aa  90.5  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0846  subtilisin-like serine protease  26.74 
 
 
1618 aa  90.1  2e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4894  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  43.2 
 
 
1324 aa  85.9  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.570577  normal  0.462175 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3585  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.48 
 
 
1212 aa  85.9  0.000000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.591718  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0217  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  26.63 
 
 
883 aa  85.9  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.161537  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6015  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.99 
 
 
1092 aa  85.9  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3517  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.33 
 
 
1212 aa  84.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.183545 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25130  subtilase family protease  27.35 
 
 
1221 aa  84.3  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0968  cell wall-associated serine proteinase, lactocepin precursor  23.92 
 
 
1570 aa  84  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23940  subtilisin-like serine protease  26.11 
 
 
1809 aa  84  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0898  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.69 
 
 
1234 aa  84  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0732529  normal  0.544536 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4203  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  45.45 
 
 
1333 aa  83.2  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5318  hitchhiker  0.00171277 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1123  cell wall-associated serine proteinase  24.05 
 
 
1570 aa  83.6  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.677567  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3708  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.63 
 
 
1212 aa  82.8  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.342982  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2053  serine protease  23.71 
 
 
1570 aa  82.4  0.00000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.322612  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4312  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.79 
 
 
1253 aa  82  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.338305 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0416  protease, putative  24.72 
 
 
1233 aa  81.6  0.00000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.504082  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>