More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_20011 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1127  50S ribosomal protein L23  100 
 
 		 103 aa  207  4e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20011  50S ribosomal protein L23  100 
 
 		 103 aa  207  4e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.822236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1957  50S ribosomal protein L23  83 
 
 		 100 aa  174  2e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16761  50S ribosomal protein L23  83.51 
 
 		 97 aa  174  3e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0374  50S ribosomal protein L23  82 
 
 		 100 aa  173  9e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23041  50S ribosomal protein L23  81 
 
 		 100 aa  170  6.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17381  50S ribosomal protein L23  77 
 
 		 100 aa  166  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17631  50S ribosomal protein L23  76 
 
 		 100 aa  164  5e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1648  50S ribosomal protein L23  75 
 
 		 100 aa  163  6.9999999999999995e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17471  50S ribosomal protein L23  74 
 
 		 100 aa  161  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.576191  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2230  50S ribosomal protein L23  70.33 
 
 		 100 aa  139  9.999999999999999e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.36925 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1294  50S ribosomal protein L23  64.52 
 
 		 105 aa  133  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000921122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0250  50S ribosomal protein L23  54.84 
 
 		 100 aa  114  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0247  50S ribosomal protein L23  54.84 
 
 		 100 aa  114  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.925224  normal  0.80387 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3010  50S ribosomal protein L23  53.54 
 
 		 101 aa  113  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00732369 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3705  50S ribosomal protein L23  52.04 
 
 		 110 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2561  Ribosomal protein L25/L23  49.51 
 
 		 104 aa  104  3e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.263671  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0693  50S ribosomal protein L23  48.54 
 
 		 104 aa  102  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.001904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1865  50S ribosomal protein L23  55.95 
 
 		 95 aa  101  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0212066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2709  Ribosomal protein L25/L23  50.55 
 
 		 95 aa  92.8  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000605336  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0717  Ribosomal protein L25/L23  53.26 
 
 		 99 aa  90.9  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1183  50S ribosomal protein L23  53.49 
 
 		 94 aa  90.5  7e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2400  50S ribosomal protein L23  47.37 
 
 		 97 aa  89  2e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000652343  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3022  50S ribosomal protein L23  51.72 
 
 		 94 aa  89  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.395888  hitchhiker  0.00706162 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2458  50S ribosomal protein L23  51.72 
 
 		 96 aa  88.6  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0767433 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1935  50S ribosomal protein L23  53.33 
 
 		 97 aa  87.8  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2331  50S ribosomal protein L23  49.43 
 
 		 95 aa  87.8  4e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000250147  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2020  50S ribosomal protein L23  53.33 
 
 		 97 aa  87.8  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4024  50S ribosomal protein L23  52.33 
 
 		 94 aa  87.4  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.707217  hitchhiker  0.0000264859 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1522  Ribosomal protein L25/L23  51.72 
 
 		 94 aa  87  7e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.800617  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2167  Ribosomal protein L25/L23  48.31 
 
 		 98 aa  86.3  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00207145  normal  0.264777 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1829  50S ribosomal protein L23  49.43 
 
 		 91 aa  85.9  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.132177  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1944  50S ribosomal protein L23  52.22 
 
 		 97 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2712  50S ribosomal protein L23  50.57 
 
 		 97 aa  85.1  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2397  50S ribosomal protein L23  50.57 
 
 		 97 aa  85.1  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00942315  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3903  50S ribosomal protein L23  46.24 
 
 		 101 aa  85.1  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0060  50S ribosomal protein L23  48.96 
 
 		 98 aa  84.3  6e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.735142  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0325  Ribosomal protein L25/L23  46.67 
 
 		 97 aa  84  6e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000179883  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2316  50S ribosomal protein L23  47.13 
 
 		 91 aa  83.6  8e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000264247  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2275  50S ribosomal protein L23  47.13 
 
 		 91 aa  83.6  8e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000227953  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1913  50S ribosomal protein L23  51.11 
 
 		 97 aa  83.6  9e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.263974 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1182  Ribosomal protein L25/L23  49.43 
 
 		 98 aa  83.2  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000210962  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1572  Ribosomal protein L25/L23  53.93 
 
 		 97 aa  83.6  0.000000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000483803  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2855  50S ribosomal protein L23  52.22 
 
 		 94 aa  82  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0878449  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1842  50S ribosomal protein L23  50.56 
 
 		 97 aa  82  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00948056  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0849  50S ribosomal protein L23P  45.74 
 
 		 99 aa  82  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000828313  decreased coverage  0.0000112275 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0628  50S ribosomal protein L23  48.89 
 
 		 94 aa  82  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000116587  hitchhiker  0.000000000000956309 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2968  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 111 aa  81.6  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.307651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0293  50S ribosomal protein L23  43.01 
 
 		 98 aa  81.6  0.000000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.2871700000000001e-28 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0198  50S ribosomal protein L23  45.05 
 
 		 95 aa  81.3  0.000000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00352738  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1905  50S ribosomal protein L23  47.92 
 
 		 98 aa  81.6  0.000000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0184535  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2125  50S ribosomal protein L23  49.44 
 
 		 98 aa  81.3  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.966187  normal  0.432558 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0340  50S ribosomal protein L23  46 
 
 		 104 aa  80.9  0.000000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00586276  hitchhiker  0.000885961 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2644  50S ribosomal protein L23  47.13 
 
 		 96 aa  80.5  0.000000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.302905  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2738  ribosomal protein L25/L23  48.84 
 
 		 96 aa  80.1  0.000000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.217238  normal  0.259663 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0217  50S ribosomal protein L23  47.13 
 
 		 95 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000142731  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0424  50S ribosomal protein L23  46.59 
 
 		 95 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000240996  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01190  Ribosomal protein L25/L23  45.45 
 
 		 96 aa  80.1  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0110234  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2164  50S ribosomal protein L23  47.19 
 
 		 98 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.561642 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1481  50S ribosomal protein L23  43.01 
 
 		 98 aa  80.1  0.00000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000124124  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2442  50S ribosomal protein L23  47.19 
 
 		 98 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.369477  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1743  50S ribosomal protein L23  47.73 
 
 		 96 aa  79.7  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000745247  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0275  50S ribosomal protein L23  45.45 
 
 		 104 aa  79.3  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000000521502  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5126  Ribosomal protein L25/L23  45.98 
 
 		 96 aa  79  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4505  Ribosomal protein L25/L23  50 
 
 		 100 aa  79.3  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0280  50S ribosomal protein L23  45.45 
 
 		 104 aa  79.3  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00123621  hitchhiker  0.00000000748159 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20850  LSU ribosomal protein L23P  49.43 
 
 		 107 aa  78.6  0.00000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0227  ribosomal protein L25/L23  45.98 
 
 		 95 aa  78.6  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29720  LSU ribosomal protein L23P  46.94 
 
 		 101 aa  78.6  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.363975 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2220  50S ribosomal protein L23  46.07 
 
 		 98 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1676  50S ribosomal protein L23  49.44 
 
 		 97 aa  78.6  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.62104  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1334  50S ribosomal protein L23  49.44 
 
 		 97 aa  78.2  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.212671  normal  0.17449 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1432  50S ribosomal protein L23  49.44 
 
 		 97 aa  78.2  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11483  normal  0.0319487 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0109  50S ribosomal protein L23  46.59 
 
 		 95 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2153  50S ribosomal protein L23P  50.57 
 
 		 95 aa  77.8  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0455845  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0694  50S ribosomal protein L23  39.13 
 
 		 94 aa  77.4  0.00000000000006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0499  50S ribosomal protein L23  48.81 
 
 		 97 aa  77  0.00000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.173851  hitchhiker  0.00000000336824 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2816  50S ribosomal protein L23  48.45 
 
 		 102 aa  77  0.00000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.947427  normal  0.439693 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0329  50S ribosomal protein L23  48.81 
 
 		 97 aa  77  0.00000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl125  50S ribosomal protein L23  42.39 
 
 		 94 aa  77  0.00000000000009  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000058644  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1351  50S ribosomal protein L23  47.25 
 
 		 104 aa  77  0.00000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.144858 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0856  50S ribosomal protein L23  46.24 
 
 		 98 aa  76.6  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.483725  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2322  50S ribosomal protein L23  46.74 
 
 		 98 aa  76.3  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00000334931  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf441  50S ribosomal protein L23  46.39 
 
 		 181 aa  76.3  0.0000000000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1557  ribosomal protein L25/L23  48.28 
 
 		 97 aa  76.6  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.271789  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2905  50S ribosomal protein L23  48.72 
 
 		 117 aa  76.3  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000254231  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1944  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 113 aa  75.9  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3665  ribosomal protein L25/L23  44.94 
 
 		 99 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000149169  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1910  50S ribosomal protein L23  47.19 
 
 		 98 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000483337  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0113  50S ribosomal protein L23  46.59 
 
 		 95 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000241418  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0988  50S ribosomal protein L23  48.31 
 
 		 97 aa  76.3  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.137365  normal  0.02544 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3141  Ribosomal protein L25/L23  50 
 
 		 103 aa  75.5  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.457141  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0564  Ribosomal protein L25/L23  44.32 
 
 		 100 aa  75.1  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2686  50S ribosomal protein L23  45.74 
 
 		 104 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0258195  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0288  Ribosomal protein L25/L23  43.68 
 
 		 94 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0208072  normal  0.0234601 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0393  50S ribosomal protein L23  43.43 
 
 		 104 aa  75.1  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000842978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1194  50S ribosomal protein L23  47.19 
 
 		 97 aa  74.7  0.0000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.79866  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0351  50S ribosomal protein L23  46.07 
 
 		 98 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.368334  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1231  50S ribosomal protein L23  47.19 
 
 		 97 aa  74.7  0.0000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.244915  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0578  Ribosomal protein L25/L23  52.81 
 
 		 102 aa  74.7  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>