More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_6033 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_6033  single-stranded DNA-binding protein  100 
 
 		 170 aa  337  5e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.68434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0875  single-stranded DNA-binding protein  90.06 
 
 		 170 aa  280  7.000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10053  single-stranded DNA-binding protein  84.8 
 
 		 164 aa  267  5e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000020035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5745  single-stranded DNA-binding protein  87.21 
 
 		 172 aa  266  8.999999999999999e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.26474 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5369  single-stranded DNA-binding protein  87.21 
 
 		 172 aa  266  8.999999999999999e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5458  single-stranded DNA-binding protein  87.21 
 
 		 172 aa  266  8.999999999999999e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.268311  normal  0.0145668 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39400  single-strand binding protein  77.06 
 
 		 156 aa  250  8.000000000000001e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4739  single-strand binding protein  77.46 
 
 		 173 aa  246  9e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5368  single-strand binding protein  79.41 
 
 		 165 aa  246  1e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4168  single-strand binding protein  76.84 
 
 		 177 aa  246  1e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7040  single-strand binding protein  80 
 
 		 168 aa  232  1.0000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5067  single-strand binding protein  74.71 
 
 		 159 aa  229  1e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.385678  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37800  single-strand binding protein  69.19 
 
 		 166 aa  214  4e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172031  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4180  single-strand binding protein  67.2 
 
 		 182 aa  213  9e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2524  single-strand binding protein  59.7 
 
 		 188 aa  213  9.999999999999999e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0336  single-strand binding protein  83.61 
 
 		 219 aa  212  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.676311 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5067  single-strand binding protein  69.14 
 
 		 167 aa  212  1.9999999999999998e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148425 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3699  single-strand binding protein  68.75 
 
 		 175 aa  212  1.9999999999999998e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4638  single-strand binding protein  65.52 
 
 		 300 aa  211  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2132  single-strand binding protein  63.91 
 
 		 153 aa  211  2.9999999999999995e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4338  single-strand binding protein  79.51 
 
 		 198 aa  211  4.9999999999999996e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4521  single-stranded DNA-binding protein  62.83 
 
 		 186 aa  209  1e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4119  single-strand binding protein  63.02 
 
 		 192 aa  208  2e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2821  single-strand binding protein  70.18 
 
 		 166 aa  207  6e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000844466  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3890  single-strand binding protein  80.33 
 
 		 193 aa  206  9e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0415536 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3354  single-strand binding protein  60.32 
 
 		 189 aa  205  2e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4555  single-strand binding protein  65.54 
 
 		 169 aa  204  4e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184905  normal  0.802331 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7311  single-stranded DNA-binding protein  80.33 
 
 		 193 aa  204  4e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0328118 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0128  single-strand binding protein  63.22 
 
 		 163 aa  204  6e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0299723 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4948  single-strand binding protein  67.24 
 
 		 170 aa  203  7e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3560  single-strand binding protein  66.23 
 
 		 171 aa  202  2e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.861693 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4663  single-strand binding protein  60.31 
 
 		 188 aa  201  4e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31770  single-strand binding protein  63.04 
 
 		 178 aa  196  2.0000000000000003e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26580  single-strand binding protein  74.59 
 
 		 189 aa  195  2.0000000000000003e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.195402 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23250  single stranded DNA-binding protein  74.59 
 
 		 200 aa  194  5.000000000000001e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4843  single-strand binding protein  75.41 
 
 		 195 aa  193  8.000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9356  single-stranded DNA-binding protein  73.77 
 
 		 191 aa  191  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.819513 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5049  single-strand binding protein  76.36 
 
 		 171 aa  186  9e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3094  single-stranded DNA-binding protein  62.09 
 
 		 182 aa  184  7e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0250576  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4232  single-strand binding protein  68.55 
 
 		 179 aa  175  3e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000994037  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1218  single-stranded DNA-binding protein  58.7 
 
 		 218 aa  174  5e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0928  single-strand binding protein  52.35 
 
 		 167 aa  171  2.9999999999999996e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0309  single-strand binding family protein  46.11 
 
 		 193 aa  171  3.9999999999999995e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0940185 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1177  single-stranded DNA-binding protein  56.25 
 
 		 179 aa  164  5.9999999999999996e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9002  single-strand binding protein  48.54 
 
 		 148 aa  149  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.850142  normal  0.715469 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4401  single-strand binding protein  62.6 
 
 		 201 aa  149  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000415912  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1145  single-stranded DNA-binding protein  49.18 
 
 		 225 aa  129  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00600272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5321  single-stranded DNA-binding protein  46.72 
 
 		 305 aa  124  5e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.074261 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1620  single-strand binding protein  48.76 
 
 		 179 aa  123  1e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.777207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0044  single-strand binding protein  48.03 
 
 		 148 aa  120  8e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3020  single-strand binding protein  44.44 
 
 		 174 aa  104  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.666273  normal  0.0842744 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3545  single-strand binding protein  38.27 
 
 		 164 aa  94.7  5e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3416  single-strand binding protein  38.24 
 
 		 164 aa  91.7  4e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000139016  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3556  single-strand binding protein  48.15 
 
 		 230 aa  90.1  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5624  single-stranded DNA-binding protein  47 
 
 		 169 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000012759  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5583  single-stranded DNA-binding protein  47 
 
 		 173 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12199e-16 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5326  single-stranded DNA-binding protein  47 
 
 		 173 aa  89.4  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5154  single-stranded DNA-binding protein  47 
 
 		 173 aa  89.4  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000326746  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5170  single-stranded DNA-binding protein  47 
 
 		 172 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00247541  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5722  single-stranded DNA-binding protein  47 
 
 		 172 aa  89.4  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000060973  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5661  single-stranded DNA-binding protein  47 
 
 		 173 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522021  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5600  single-stranded DNA-binding protein  47 
 
 		 170 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0046868  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1327  single-strand binding protein  39.32 
 
 		 191 aa  89  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5266  single-stranded DNA-binding protein  46 
 
 		 173 aa  88.6  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000287682  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4013  single-stranded DNA-binding protein  47 
 
 		 164 aa  88.6  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5335  single-stranded DNA-binding protein  46 
 
 		 172 aa  88.2  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000380691  hitchhiker  0.000000431686 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7360  Single-stranded DNA-binding protein-like protein  38.02 
 
 		 233 aa  88.2  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0008  single-stranded DNA-binding protein  34.83 
 
 		 172 aa  87.8  6e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000612973  hitchhiker  0.0000000000172856 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3930  single-strand binding protein  47.22 
 
 		 240 aa  87  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.241306  normal  0.0537084 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4668  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  41.12 
 
 		 118 aa  85.9  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0382232  normal  0.0214705 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1727  single-stranded DNA-binding protein  33.15 
 
 		 172 aa  84.7  5e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00349794  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0566  prophage LambdaSa1, single-strand binding protein  36.64 
 
 		 138 aa  84  9e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2502  single-stranded DNA-binding protein  33.92 
 
 		 166 aa  84  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000142179  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0008  single-strand binding protein  34.41 
 
 		 187 aa  83.2  0.000000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000109058  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1713  single-stranded DNA-binding protein  32.95 
 
 		 163 aa  83.2  0.000000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000713514  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1608  single-strand binding protein  34.71 
 
 		 151 aa  82.8  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.409638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2929  single-strand binding protein  33.53 
 
 		 156 aa  82.4  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.564764  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0341  single-stranded DNA-binding protein  39.62 
 
 		 172 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1903  single-strand binding protein  35.88 
 
 		 151 aa  82  0.000000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0129  single-strand binding protein  40 
 
 		 154 aa  80.9  0.000000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000140231  normal  0.824498 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3137  single-strand binding protein  38.94 
 
 		 114 aa  80.9  0.000000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.560759  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4935  single-strand binding protein  35.34 
 
 		 137 aa  80.9  0.000000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000213626  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0930  single-strand binding protein  38.46 
 
 		 233 aa  80.1  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  32 
 
 		 157 aa  80.1  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0020  single-strand binding protein  40 
 
 		 150 aa  79.3  0.00000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6544  single-strand binding protein  37.74 
 
 		 188 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27910  single stranded DNA-binding protein  42 
 
 		 150 aa  79  0.00000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000548397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5572  single-strand binding protein  37.74 
 
 		 184 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0438  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 157 aa  78.6  0.00000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.367584 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4106  single-stranded DNA-binding protein  39.62 
 
 		 177 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0611  single-stranded DNA-binding protein  39.62 
 
 		 179 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0353597 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2788  single-stranded DNA-binding protein  38.68 
 
 		 183 aa  77.8  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.481192 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0500  single-stranded DNA-binding protein  38.68 
 
 		 186 aa  77.8  0.00000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2163  single-stranded DNA-binding protein  38.68 
 
 		 184 aa  77.8  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2777  single-stranded DNA-binding protein  38.68 
 
 		 184 aa  77.8  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450674  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0538  single-stranded DNA-binding protein  38.68 
 
 		 182 aa  77.4  0.00000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4599  single-stranded DNA-binding protein  38.1 
 
 		 176 aa  77.4  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4512  single-stranded DNA-binding protein  38.1 
 
 		 176 aa  77.4  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4650  single-stranded DNA-binding protein  38.1 
 
 		 176 aa  77.4  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2915  single-strand binding protein  43.75 
 
 		 148 aa  77.4  0.00000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223705  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>