More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3674 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_3674  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 246 aa  486  1e-136  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.027909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5309  two component transcriptional regulator  97.56 
 
 		 246 aa  454  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.383621  normal  0.611504 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5700  two component transcriptional regulator  97.56 
 
 		 246 aa  454  1e-127  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.663569  normal  0.593468 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1439  two component transcriptional regulator  74.3 
 
 		 265 aa  363  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.293954  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1457  two component transcriptional regulator  74.3 
 
 		 265 aa  363  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.701993 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1834  two component transcriptional regulator  72.69 
 
 		 251 aa  356  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.131317  normal  0.194802 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4566  two component transcriptional regulator  74.49 
 
 		 248 aa  355  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.611556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2905  two component transcriptional regulator  73.14 
 
 		 263 aa  354  8.999999999999999e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2949  two component transcriptional regulator  73.14 
 
 		 263 aa  354  8.999999999999999e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.271765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2935  two component transcriptional regulator  73.14 
 
 		 263 aa  353  1e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.193911 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0893  two component transcriptional regulator  72.69 
 
 		 251 aa  353  1e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3887  two component transcriptional regulator  72.18 
 
 		 251 aa  350  1e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.243105 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2838  two component transcriptional regulator  72.18 
 
 		 251 aa  350  1e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.692986  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4523  two component transcriptional regulator  73.77 
 
 		 251 aa  346  2e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0312  response regulator receiver  63.56 
 
 		 233 aa  302  4.0000000000000003e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0102436  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3782  response regulator receiver  63.79 
 
 		 297 aa  296  3e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3537  two component transcriptional regulator, winged helix family  60.83 
 
 		 237 aa  288  5.0000000000000004e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.555413 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3070  two component transcriptional regulator  63.2 
 
 		 230 aa  274  1.0000000000000001e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000463151 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4233  response regulator receiver  58.02 
 
 		 244 aa  273  2.0000000000000002e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0093  two component transcriptional regulator, winged helix family  61.9 
 
 		 232 aa  273  2.0000000000000002e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2604  response regulator receiver  58.02 
 
 		 244 aa  273  2.0000000000000002e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88392  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0624  two component transcriptional regulator  62.61 
 
 		 240 aa  268  5e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3676  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.65 
 
 		 243 aa  265  2.9999999999999995e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18360  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  56.54 
 
 		 239 aa  251  8.000000000000001e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2782  two component transcriptional regulator  54.55 
 
 		 231 aa  250  1e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.92379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04920  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  56.96 
 
 		 222 aa  246  2e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.43 
 
 		 231 aa  228  9e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2050  response regulator receiver  49.15 
 
 		 250 aa  221  6e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0353  two component transcriptional regulator  52.17 
 
 		 230 aa  221  9e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.683455 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2924  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.22 
 
 		 265 aa  216  2.9999999999999998e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.22 
 
 		 235 aa  215  5.9999999999999996e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0646165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2566  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.61 
 
 		 229 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000356007  hitchhiker  0.00345607 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2496  response regulator receiver  48.72 
 
 		 225 aa  207  1e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.491467  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1316  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.32 
 
 		 232 aa  206  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4602  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.39 
 
 		 226 aa  207  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1058  DNA-binding response regulator  47.39 
 
 		 227 aa  206  3e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000187393  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1546  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.28 
 
 		 237 aa  206  3e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000115937  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2939  response regulator receiver  52.36 
 
 		 232 aa  205  7e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4043  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.07 
 
 		 225 aa  204  8e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.728877  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  42.67 
 
 		 235 aa  203  2e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  42.67 
 
 		 235 aa  202  4e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  42.67 
 
 		 235 aa  202  4e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  42.67 
 
 		 235 aa  201  6e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  42.67 
 
 		 235 aa  201  6e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  42.67 
 
 		 235 aa  201  6e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  42.67 
 
 		 235 aa  201  6e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  42.67 
 
 		 235 aa  201  6e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  42.67 
 
 		 235 aa  201  6e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  42.67 
 
 		 235 aa  201  6e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  42.24 
 
 		 235 aa  201  7e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0114  two component transcriptional regulator  53.51 
 
 		 229 aa  201  8e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.994086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6310  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.19 
 
 		 261 aa  200  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.534044  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2207  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.41 
 
 		 244 aa  201  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  44.73 
 
 		 239 aa  200  1.9999999999999998e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0978  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.12 
 
 		 254 aa  200  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0385223 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04710  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.64 
 
 		 237 aa  199  3e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1367  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.55 
 
 		 230 aa  198  6e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000177207  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  44.35 
 
 		 226 aa  198  6e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1155  two component transcriptional regulator  44.87 
 
 		 231 aa  198  7.999999999999999e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000430064  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0867  two component transcriptional regulator  46.03 
 
 		 250 aa  197  9e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  46.58 
 
 		 229 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0700  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.12 
 
 		 226 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0805  two component transcriptional regulator  48.25 
 
 		 229 aa  197  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0766  two component transcriptional regulator  44.07 
 
 		 231 aa  196  3e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.585906  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  46.49 
 
 		 228 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4046  response regulator receiver  45.22 
 
 		 225 aa  195  5.000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1765  two component transcriptional regulator  48.5 
 
 		 225 aa  195  6e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0997  response regulator receiver  45.02 
 
 		 228 aa  194  7e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2867  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.6 
 
 		 233 aa  194  1e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1673  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.55 
 
 		 233 aa  194  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09340  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  46.98 
 
 		 223 aa  193  2e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.217912  normal  0.763127 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1827  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.15 
 
 		 227 aa  193  2e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4285  two component transcriptional regulator, winged helix family  45 
 
 		 238 aa  193  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.83647  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2712  two component transcriptional regulator  47.01 
 
 		 224 aa  192  3e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00552555  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1349  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.74 
 
 		 237 aa  192  4e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.421984 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00330  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  44.77 
 
 		 240 aa  192  4e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00972196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8215  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.69 
 
 		 226 aa  192  5e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_926  two-component system, OmpR family, response regulator  45.18 
 
 		 227 aa  192  5e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00200634  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0088  two component transcriptional regulator  44.78 
 
 		 228 aa  191  8e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2534  DNA-binding response regulator YycF  43.67 
 
 		 233 aa  191  9e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  45.22 
 
 		 229 aa  191  9e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4929  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.02 
 
 		 226 aa  191  9e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0719  DNA-binding response regulator  40.68 
 
 		 236 aa  191  1e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0951718  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0854  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.12 
 
 		 248 aa  191  1e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0313558 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4322  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.22 
 
 		 231 aa  191  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0132  response regulator receiver protein  47.6 
 
 		 231 aa  191  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0961  response regulator receiver protein  45.65 
 
 		 229 aa  191  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1954  two component transcriptional regulator  42.98 
 
 		 229 aa  191  1e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000155813  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0850  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.91 
 
 		 226 aa  191  1e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.61 
 
 		 236 aa  190  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1176  two component transcriptional regulator  47.37 
 
 		 229 aa  190  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.149936 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4663  two component transcriptional regulator  46.98 
 
 		 232 aa  190  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  45.69 
 
 		 230 aa  190  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0937  two component transcriptional regulator  44.78 
 
 		 227 aa  190  2e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.834094  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0404  two component transcriptional regulator  46.12 
 
 		 227 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00316128 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0258  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.21 
 
 		 236 aa  189  2.9999999999999997e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.606292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0378  two component transcriptional regulator  45.15 
 
 		 234 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3538  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.17 
 
 		 237 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0906  response regulator  36.91 
 
 		 240 aa  189  4e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0082  two component transcriptional regulator  44.3 
 
 		 228 aa  189  4e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>