110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3176 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4917  hypothetical protein  64.52 
 
 		 508 aa  649    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.150474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5006  hypothetical protein  64.52 
 
 		 508 aa  649    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1291  hypothetical protein  70.15 
 
 		 582 aa  758    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.322843  normal  0.107817 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2144  hypothetical protein  72.31 
 
 		 593 aa  812    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2714  hypothetical protein  74.03 
 
 		 601 aa  809    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.707807  normal  0.117401 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3176  hypothetical protein  100 
 
 		 601 aa  1201    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0436761  normal  0.0313411 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5188  hypothetical protein  74.83 
 
 		 586 aa  831    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0262711 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5546  hypothetical protein  72.52 
 
 		 571 aa  783    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.419973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1272  HNH endonuclease  72.43 
 
 		 532 aa  757    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.250117 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3935  hypothetical protein  66.45 
 
 		 514 aa  398  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0910355 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3920  hypothetical protein  66.13 
 
 		 508 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.319111  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3994  hypothetical protein  66.13 
 
 		 508 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00383359  normal  0.960587 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12134  hypothetical protein  44.65 
 
 		 550 aa  360  3e-98  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000034137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5299  hypothetical protein  66.77 
 
 		 516 aa  354  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0159919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0612  hypothetical protein  69.93 
 
 		 491 aa  353  5.9999999999999994e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0621  hypothetical protein  66.77 
 
 		 491 aa  353  7e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0634  hypothetical protein  66.77 
 
 		 491 aa  353  7e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.706524 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2855  hypothetical protein  39.76 
 
 		 581 aa  327  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2899  hypothetical protein  39.76 
 
 		 581 aa  327  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.613632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2886  hypothetical protein  38.69 
 
 		 578 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.816212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4252  hypothetical protein  38.72 
 
 		 578 aa  308  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698404  normal  0.0628419 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1040  hypothetical protein  38.01 
 
 		 593 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.35797  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1056  hypothetical protein  38.01 
 
 		 593 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.240254 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5065  hypothetical protein  66.52 
 
 		 506 aa  293  8e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2756  HNH nuclease  36.02 
 
 		 550 aa  284  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.546417 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0426  hypothetical protein  37.48 
 
 		 539 aa  282  1e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0327015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4099  hypothetical protein  36.96 
 
 		 517 aa  276  8e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.165873  normal  0.595439 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1180  hypothetical protein  36.91 
 
 		 519 aa  271  2e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.209528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0179  hypothetical protein  36.89 
 
 		 524 aa  270  4e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3422  hypothetical protein  36.88 
 
 		 620 aa  265  2e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.023087  normal  0.778813 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5774  HNH endonuclease  38.59 
 
 		 516 aa  220  7e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.300125  normal  0.0760433 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13810  hypothetical protein  58.01 
 
 		 519 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.200987  normal  0.109205 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4927  hypothetical protein  47.14 
 
 		 546 aa  183  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.929076 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0728  hypothetical protein  47.5 
 
 		 535 aa  176  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0834953 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3047  hypothetical protein  48 
 
 		 480 aa  169  9e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3106  hypothetical protein  48 
 
 		 480 aa  169  9e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3063  hypothetical protein  48 
 
 		 480 aa  169  9e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0277279  normal  0.257272 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10526  13E12 repeat-containing protein  53.85 
 
 		 488 aa  168  2e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10341  13E12 repeat-containing protein  53.85 
 
 		 511 aa  168  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0314  hypothetical protein  52.76 
 
 		 512 aa  159  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.189609 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3778  hypothetical protein  50 
 
 		 473 aa  150  5e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499553 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10397  13E12 repeat-containing protein  47.37 
 
 		 441 aa  150  5e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4022  hypothetical protein  35.06 
 
 		 578 aa  150  9e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4097  hypothetical protein  35.06 
 
 		 578 aa  150  9e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.481016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3596  hypothetical protein  45.66 
 
 		 464 aa  139  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.736213  normal  0.654311 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1057  hypothetical protein  55.34 
 
 		 567 aa  124  4e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0946  hypothetical protein  55.34 
 
 		 484 aa  124  5e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4350  hypothetical protein  25.75 
 
 		 579 aa  124  5e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000306151  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1741  hypothetical protein  30.64 
 
 		 475 aa  98.6  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3819  HNH endonuclease  51.61 
 
 		 620 aa  90.9  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.125126  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2570  HNH endonuclease  47.92 
 
 		 637 aa  90.9  7e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.729569 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3627  HNH endonuclease  41.22 
 
 		 743 aa  90.5  8e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0415546 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0148  HNH endonuclease  50.6 
 
 		 748 aa  88.6  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.350878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00460  HNH endonuclease  50 
 
 		 565 aa  86.3  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.711457 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3082  HNH endonuclease  46.24 
 
 		 709 aa  85.1  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4696  hypothetical protein  46 
 
 		 635 aa  83.6  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2220  HNH endonuclease  44.23 
 
 		 535 aa  80.9  0.00000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.176223  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0740  hypothetical protein  28.43 
 
 		 618 aa  80.1  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02410  HNH endonuclease  47.87 
 
 		 198 aa  76.3  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3785  HNH endonuclease  41.27 
 
 		 498 aa  75.9  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0713491  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1671  HNH endonuclease  39.13 
 
 		 567 aa  70.1  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1708  HNH endonuclease  25.66 
 
 		 519 aa  70.1  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0664589  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02590  HNH endonuclease  43.62 
 
 		 169 aa  69.3  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4183  HNH endonuclease  28.1 
 
 		 434 aa  68.9  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0807  HNH endonuclease  38.05 
 
 		 566 aa  68.2  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4258  HNH endonuclease  41.3 
 
 		 443 aa  67.8  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137511  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35950  HNH endonuclease  40.59 
 
 		 628 aa  66.6  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391714  normal  0.627541 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6862  HNH endonuclease  40.22 
 
 		 443 aa  66.2  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.215288  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6925  HNH endonuclease  35.87 
 
 		 426 aa  65.9  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.629252 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1476  HNH endonuclease  30.77 
 
 		 586 aa  65.9  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0266278  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10401  13E12 repeat-containing protein  44.68 
 
 		 122 aa  65.5  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19140  hypothetical protein  37.1 
 
 		 530 aa  65.5  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.846076  normal  0.184811 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3191  HNH endonuclease  36.75 
 
 		 602 aa  63.5  0.000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4047  HNH endonuclease  41.57 
 
 		 516 aa  63.2  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0910573  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3701  hypothetical protein  47.69 
 
 		 129 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.739575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0277  HNH endonuclease  41.3 
 
 		 714 aa  62  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3219  HNH endonuclease  37.08 
 
 		 427 aa  61.2  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.125237  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0800  HNH nuclease  32.23 
 
 		 510 aa  60.5  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3886  hypothetical protein  29.81 
 
 		 554 aa  59.7  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00540166  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02320  HNH endonuclease  41.11 
 
 		 605 aa  59.7  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31580  HNH endonuclease  43.66 
 
 		 551 aa  58.5  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.967931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2721  hypothetical protein  35.05 
 
 		 553 aa  57.4  0.0000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30520  HNH endonuclease  40.79 
 
 		 499 aa  57  0.0000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.696325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28260  HNH endonuclease  45.61 
 
 		 580 aa  56.2  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3499  HNH endonuclease  44.44 
 
 		 117 aa  55.8  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09680  HNH endonuclease  47.37 
 
 		 584 aa  55.8  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.616841  normal  0.523409 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16190  HNH endonuclease  45.61 
 
 		 558 aa  56.2  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.46252 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23990  hypothetical protein  47.37 
 
 		 535 aa  56.2  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37420  HNH endonuclease  47.37 
 
 		 580 aa  56.2  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0493526  normal  0.38203 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2416  HNH endonuclease  40 
 
 		 603 aa  52.4  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0000498536  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3830  hypothetical protein  36.36 
 
 		 512 aa  51.2  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0246359  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1626  HNH endonuclease  33.72 
 
 		 620 aa  50.1  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000294245 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3427  HNH endonuclease  34.83 
 
 		 566 aa  50.1  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3616  HNH endonuclease  44 
 
 		 131 aa  49.3  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.289369  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0324  HNH endonuclease  32.56 
 
 		 585 aa  48.5  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3573  hypothetical protein  41.89 
 
 		 563 aa  48.1  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2222  HNH endonuclease  40.54 
 
 		 485 aa  47.4  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0370  HNH nuclease  33.61 
 
 		 556 aa  47.4  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2758  hypothetical protein  36.78 
 
 		 441 aa  45.8  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.284489  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  32.5 
 
 		 1888 aa  45.8  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>