31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3573 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3573  hypothetical protein  100 
 
 		 563 aa  1122    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3087  hypothetical protein  32.17 
 
 		 461 aa  151  3e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2026  hypothetical protein  30.85 
 
 		 455 aa  139  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4183  HNH endonuclease  29.21 
 
 		 434 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3219  HNH endonuclease  29.65 
 
 		 427 aa  113  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.125237  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1354  hypothetical protein  28.2 
 
 		 496 aa  82.8  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0148  HNH endonuclease  42.55 
 
 		 748 aa  63.2  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.350878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3106  hypothetical protein  31.03 
 
 		 480 aa  53.5  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3047  hypothetical protein  31.03 
 
 		 480 aa  53.5  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6925  HNH endonuclease  27.54 
 
 		 426 aa  52.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.629252 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3063  hypothetical protein  30.34 
 
 		 480 aa  51.6  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0277279  normal  0.257272 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3830  hypothetical protein  26.3 
 
 		 512 aa  51.6  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0246359  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2570  HNH endonuclease  38.38 
 
 		 637 aa  51.2  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.729569 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3082  HNH endonuclease  37.5 
 
 		 709 aa  50.1  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3176  hypothetical protein  41.89 
 
 		 601 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0436761  normal  0.0313411 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3819  HNH endonuclease  37.76 
 
 		 620 aa  47.8  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.125126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4258  HNH endonuclease  37.23 
 
 		 443 aa  47.4  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137511  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5546  hypothetical protein  40.54 
 
 		 571 aa  47  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.419973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1291  hypothetical protein  40.28 
 
 		 582 aa  47  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.322843  normal  0.107817 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1671  HNH endonuclease  30.5 
 
 		 567 aa  46.2  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5188  hypothetical protein  40.54 
 
 		 586 aa  45.4  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0262711 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10341  13E12 repeat-containing protein  26.32 
 
 		 511 aa  45.4  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10526  13E12 repeat-containing protein  26.32 
 
 		 488 aa  45.1  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0314  hypothetical protein  47.27 
 
 		 512 aa  44.7  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.189609 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3627  HNH endonuclease  36 
 
 		 743 aa  44.7  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0415546 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6862  HNH endonuclease  36.17 
 
 		 443 aa  44.3  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.215288  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13810  hypothetical protein  37.08 
 
 		 519 aa  43.9  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.200987  normal  0.109205 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3499  HNH endonuclease  36.21 
 
 		 117 aa  44.3  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1272  HNH endonuclease  37.84 
 
 		 532 aa  43.9  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.250117 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4047  HNH endonuclease  26.13 
 
 		 516 aa  43.5  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0910573  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2714  hypothetical protein  39.19 
 
 		 601 aa  43.5  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.707807  normal  0.117401 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>