33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3087 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2026  hypothetical protein  90.67 
 
 		 455 aa  816    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3087  hypothetical protein  100 
 
 		 461 aa  934    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3573  hypothetical protein  31.87 
 
 		 563 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4183  HNH endonuclease  30.82 
 
 		 434 aa  139  7.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3219  HNH endonuclease  30.6 
 
 		 427 aa  133  5e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.125237  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1354  hypothetical protein  30.26 
 
 		 496 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1671  HNH endonuclease  27.68 
 
 		 567 aa  71.6  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6862  HNH endonuclease  28.12 
 
 		 443 aa  69.7  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.215288  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6925  HNH endonuclease  26.12 
 
 		 426 aa  67.4  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.629252 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0807  HNH endonuclease  25.85 
 
 		 566 aa  65.1  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0800  HNH nuclease  26.32 
 
 		 510 aa  64.3  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1057  hypothetical protein  25.95 
 
 		 567 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4258  HNH endonuclease  27.34 
 
 		 443 aa  63.2  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137511  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3063  hypothetical protein  26.67 
 
 		 480 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0277279  normal  0.257272 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3047  hypothetical protein  25.6 
 
 		 480 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0370  HNH nuclease  26.67 
 
 		 556 aa  61.6  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3106  hypothetical protein  25.6 
 
 		 480 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0946  hypothetical protein  25.95 
 
 		 484 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1626  HNH endonuclease  29.63 
 
 		 620 aa  58.9  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000294245 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3499  HNH endonuclease  37.37 
 
 		 117 aa  58.2  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0324  HNH endonuclease  27.82 
 
 		 585 aa  57.8  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3427  HNH endonuclease  28.99 
 
 		 566 aa  55.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4047  HNH endonuclease  24.87 
 
 		 516 aa  53.9  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0910573  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0794  HNH nuclease  28.15 
 
 		 568 aa  53.1  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0239  HNH nuclease  23.35 
 
 		 508 aa  51.6  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0148  HNH endonuclease  31.3 
 
 		 748 aa  49.7  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.350878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0584  HNH nuclease  26.19 
 
 		 507 aa  48.5  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0801451 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3830  hypothetical protein  24.54 
 
 		 512 aa  47.8  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0246359  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3609  HNH nuclease  30.56 
 
 		 222 aa  47.4  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2756  HNH nuclease  42.03 
 
 		 550 aa  47  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.546417 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3616  HNH endonuclease  37.7 
 
 		 131 aa  47  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.289369  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2220  HNH endonuclease  33.71 
 
 		 535 aa  45.1  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.176223  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31580  HNH endonuclease  27.93 
 
 		 551 aa  43.1  0.01  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.967931  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>