74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1354 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4183  HNH endonuclease  87.16 
 
 		 434 aa  656    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3219  HNH endonuclease  90.77 
 
 		 427 aa  682    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.125237  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1354  hypothetical protein  100 
 
 		 496 aa  980    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3087  hypothetical protein  29.9 
 
 		 461 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2026  hypothetical protein  30.15 
 
 		 455 aa  98.6  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3573  hypothetical protein  28.3 
 
 		 563 aa  82.8  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3499  HNH endonuclease  57.14 
 
 		 117 aa  75.9  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2756  HNH nuclease  27.93 
 
 		 550 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.546417 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10526  13E12 repeat-containing protein  30.31 
 
 		 488 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10341  13E12 repeat-containing protein  30.31 
 
 		 511 aa  62  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4047  HNH endonuclease  28.99 
 
 		 516 aa  57  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0910573  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4252  hypothetical protein  49.02 
 
 		 578 aa  54.7  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698404  normal  0.0628419 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2855  hypothetical protein  49.02 
 
 		 581 aa  54.7  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2899  hypothetical protein  49.02 
 
 		 581 aa  54.7  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.613632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2886  hypothetical protein  49.02 
 
 		 578 aa  54.3  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.816212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4022  hypothetical protein  49.02 
 
 		 578 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1040  hypothetical protein  49.02 
 
 		 593 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.35797  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1056  hypothetical protein  49.02 
 
 		 593 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.240254 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3063  hypothetical protein  49.02 
 
 		 480 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0277279  normal  0.257272 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4097  hypothetical protein  49.02 
 
 		 578 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.481016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4927  hypothetical protein  25.89 
 
 		 546 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.929076 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10397  13E12 repeat-containing protein  50.98 
 
 		 441 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0800  HNH nuclease  51.02 
 
 		 510 aa  50.8  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0807  HNH endonuclease  45.61 
 
 		 566 aa  50.8  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3935  hypothetical protein  47.06 
 
 		 514 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0910355 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3994  hypothetical protein  47.06 
 
 		 508 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00383359  normal  0.960587 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12134  hypothetical protein  49.02 
 
 		 550 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000034137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13810  hypothetical protein  47.06 
 
 		 519 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.200987  normal  0.109205 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3920  hypothetical protein  47.06 
 
 		 508 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.319111  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5006  hypothetical protein  49.02 
 
 		 508 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4917  hypothetical protein  49.02 
 
 		 508 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.150474  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1708  HNH endonuclease  43.55 
 
 		 519 aa  48.5  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0664589  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3778  hypothetical protein  26.16 
 
 		 473 aa  48.1  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499553 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31580  HNH endonuclease  45.45 
 
 		 551 aa  47.8  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.967931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1272  HNH endonuclease  45.1 
 
 		 532 aa  48.1  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.250117 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3596  hypothetical protein  45.24 
 
 		 464 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.736213  normal  0.654311 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0611  HNH endonuclease  45.24 
 
 		 432 aa  47.8  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0062  hypothetical protein  41.07 
 
 		 572 aa  47.8  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.161525  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30520  HNH endonuclease  35.29 
 
 		 499 aa  47.4  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.696325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0266  hypothetical protein  41.07 
 
 		 602 aa  47.4  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0612  hypothetical protein  47.06 
 
 		 491 aa  47.4  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0634  hypothetical protein  47.06 
 
 		 491 aa  47  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.706524 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0621  hypothetical protein  47.06 
 
 		 491 aa  47  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5299  hypothetical protein  47.06 
 
 		 516 aa  47  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0159919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1666  hypothetical protein  41.07 
 
 		 557 aa  47  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02320  HNH endonuclease  43.18 
 
 		 605 aa  46.2  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09680  HNH endonuclease  45.45 
 
 		 584 aa  46.6  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.616841  normal  0.523409 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16190  HNH endonuclease  40.91 
 
 		 558 aa  46.2  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.46252 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23990  hypothetical protein  43.18 
 
 		 535 aa  46.6  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28260  HNH endonuclease  40.91 
 
 		 580 aa  46.2  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37420  HNH endonuclease  43.18 
 
 		 580 aa  46.6  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0493526  normal  0.38203 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1057  hypothetical protein  29.17 
 
 		 567 aa  46.6  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6925  HNH endonuclease  57.14 
 
 		 426 aa  46.2  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.629252 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1671  HNH endonuclease  39.02 
 
 		 567 aa  46.6  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0946  hypothetical protein  28.95 
 
 		 484 aa  46.6  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06130  HNH endonuclease  40 
 
 		 561 aa  45.4  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3830  hypothetical protein  25.63 
 
 		 512 aa  45.8  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0246359  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5065  hypothetical protein  23.77 
 
 		 506 aa  45.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35950  HNH endonuclease  45.45 
 
 		 628 aa  45.1  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391714  normal  0.627541 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5096  HNH nuclease  45.24 
 
 		 442 aa  45.4  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0370  HNH nuclease  42.86 
 
 		 556 aa  44.7  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2144  hypothetical protein  45.1 
 
 		 593 aa  44.7  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2714  hypothetical protein  45.1 
 
 		 601 aa  44.7  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.707807  normal  0.117401 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19140  hypothetical protein  43.18 
 
 		 530 aa  44.7  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.846076  normal  0.184811 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5546  hypothetical protein  45.1 
 
 		 571 aa  44.3  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.419973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1291  hypothetical protein  43.14 
 
 		 582 aa  44.3  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.322843  normal  0.107817 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5188  hypothetical protein  45.1 
 
 		 586 aa  44.3  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0262711 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3627  HNH endonuclease  49.02 
 
 		 743 aa  44.3  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0415546 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3082  HNH endonuclease  49.02 
 
 		 709 aa  44.3  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31690  hypothetical protein  40 
 
 		 577 aa  44.3  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2570  HNH endonuclease  37.78 
 
 		 637 aa  43.9  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.729569 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0426  hypothetical protein  37.5 
 
 		 539 aa  43.9  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0327015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2222  HNH endonuclease  43.14 
 
 		 485 aa  44.3  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3176  hypothetical protein  43.14 
 
 		 601 aa  43.5  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0436761  normal  0.0313411 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>