More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1265 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_1265  formyltetrahydrofolate deformylase  100 
 
 		 295 aa  596  1e-169  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.771362  normal  0.597944 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5090  formyltetrahydrofolate deformylase  97.29 
 
 		 295 aa  583  1e-166  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0903812  normal  0.160405 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12978  formyltetrahydrofolate deformylase  80.85 
 
 		 310 aa  471  1e-132  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11670  formyltetrahydrofolate deformylase  63.76 
 
 		 291 aa  377  1e-104  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1522  formyltetrahydrofolate deformylase  60.85 
 
 		 287 aa  352  2.9999999999999997e-96  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0523  formyltetrahydrofolate deformylase  58.57 
 
 		 289 aa  339  2.9999999999999998e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1488  formyltetrahydrofolate deformylase  58.25 
 
 		 296 aa  333  3e-90  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.973322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1695  formyltetrahydrofolate deformylase  58.25 
 
 		 295 aa  332  5e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0684131  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0323  formyltetrahydrofolate deformylase  57.86 
 
 		 286 aa  330  2e-89  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1951  formyltetrahydrofolate deformylase  57.04 
 
 		 286 aa  325  6e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1866  formyltetrahydrofolate deformylase  57.04 
 
 		 286 aa  325  6e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1795  formyltetrahydrofolate deformylase  57.19 
 
 		 286 aa  322  3e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2012  formyltetrahydrofolate deformylase  57.04 
 
 		 299 aa  322  5e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.436066  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2012  formyltetrahydrofolate deformylase  54.8 
 
 		 287 aa  319  3e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0750038 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1631  formyltetrahydrofolate deformylase  54.09 
 
 		 300 aa  318  5e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043119  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2543  formyltetrahydrofolate deformylase  53.12 
 
 		 300 aa  317  1e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4352  formyltetrahydrofolate deformylase  56.79 
 
 		 299 aa  309  2.9999999999999997e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.157663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2419  formyltetrahydrofolate deformylase  55.36 
 
 		 287 aa  306  3e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2122  formyltetrahydrofolate deformylase  56.03 
 
 		 297 aa  301  1e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.479975  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0414  formyltetrahydrofolate deformylase  51.77 
 
 		 294 aa  293  2e-78  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175619 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1987  formyltetrahydrofolate deformylase  50.72 
 
 		 307 aa  283  2.0000000000000002e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0375  formyltetrahydrofolate deformylase  48.57 
 
 		 283 aa  278  1e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2434  formyltetrahydrofolate deformylase  47.89 
 
 		 296 aa  276  4e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4374  formyltetrahydrofolate deformylase  49.46 
 
 		 284 aa  266  4e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4436  formyltetrahydrofolate deformylase  49.46 
 
 		 284 aa  266  4e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.180137 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0127  formyltetrahydrofolate deformylase  50.9 
 
 		 282 aa  266  4e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0012  formyltetrahydrofolate deformylase  48.75 
 
 		 284 aa  265  5.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.909291 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4234  formyltetrahydrofolate deformylase  48.03 
 
 		 284 aa  264  1e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.761125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1008  formyltetrahydrofolate deformylase  48.94 
 
 		 284 aa  264  1e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.394277  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2425  formyltetrahydrofolate deformylase  48.39 
 
 		 284 aa  264  1e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2051  formyltetrahydrofolate deformylase  47.52 
 
 		 285 aa  263  2e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000424508  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0678  formyltetrahydrofolate deformylase  49.64 
 
 		 285 aa  261  6.999999999999999e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2073  formyltetrahydrofolate deformylase  49.64 
 
 		 288 aa  260  2e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0345334  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2199  formyltetrahydrofolate deformylase  45.16 
 
 		 288 aa  259  4e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1693  formyltetrahydrofolate deformylase  49.29 
 
 		 290 aa  258  6e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0638  formyltetrahydrofolate deformylase  45.52 
 
 		 287 aa  258  9e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2099  formyltetrahydrofolate deformylase  48.03 
 
 		 289 aa  256  2e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.810337  normal  0.272125 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1977  formyltetrahydrofolate deformylase  48.11 
 
 		 284 aa  256  4e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4436  formyltetrahydrofolate deformylase  47.86 
 
 		 282 aa  255  5e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00849533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0692  formyltetrahydrofolate deformylase  44.09 
 
 		 288 aa  255  5e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0174  formyltetrahydrofolate deformylase  48.03 
 
 		 287 aa  254  1.0000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56060  formyltetrahydrofolate deformylase  48.57 
 
 		 283 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7341  formyltetrahydrofolate deformylase  48.74 
 
 		 284 aa  253  3e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0997377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4882  formyltetrahydrofolate deformylase  48.57 
 
 		 283 aa  252  6e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.784471  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3312  formyltetrahydrofolate deformylase  46.79 
 
 		 283 aa  251  7e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.929874  normal  0.815852 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1367  formyltetrahydrofolate deformylase  48.21 
 
 		 283 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0129513  normal  0.181813 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1007  formyltetrahydrofolate deformylase  47.86 
 
 		 283 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000029138  hitchhiker  0.000000000000593821 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4356  formyltetrahydrofolate deformylase  48.21 
 
 		 283 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000805788  normal  0.0308915 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4447  formyltetrahydrofolate deformylase  48.21 
 
 		 283 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000794151  decreased coverage  0.00000544491 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1110  formyltetrahydrofolate deformylase  47.78 
 
 		 303 aa  249  3e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.344472  normal  0.241232 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38280  formyltetrahydrofolate deformylase  48.2 
 
 		 283 aa  249  4e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3621  formyltetrahydrofolate deformylase  46.93 
 
 		 284 aa  249  4e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.155921  normal  0.0233728 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4314  formyltetrahydrofolate deformylase  47.5 
 
 		 283 aa  248  9e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000262425  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4018  formyltetrahydrofolate deformylase  47.5 
 
 		 283 aa  248  1e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0329939  normal  0.0297352 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3853  formyltetrahydrofolate deformylase  47.87 
 
 		 287 aa  247  2e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.565594  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0297  formyltetrahydrofolate deformylase  46.07 
 
 		 282 aa  246  2e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.338729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0556  formyltetrahydrofolate deformylase  48.75 
 
 		 297 aa  246  3e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1668  formyltetrahydrofolate deformylase  45.58 
 
 		 292 aa  246  3e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000000107141  normal  0.242712 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5709  formyltetrahydrofolate deformylase  47.86 
 
 		 287 aa  246  4e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.506805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1789  formyltetrahydrofolate deformylase  43.49 
 
 		 309 aa  245  4.9999999999999997e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00390951  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00495  formyltetrahydrofolate deformylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11620)  45.45 
 
 		 289 aa  244  9.999999999999999e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.39908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3983  formyltetrahydrofolate deformylase  47.87 
 
 		 285 aa  244  9.999999999999999e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.523347 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1789  formyltetrahydrofolate deformylase  45.32 
 
 		 283 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1020  formyltetrahydrofolate deformylase  46.07 
 
 		 284 aa  243  1.9999999999999999e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0438  formyltetrahydrofolate deformylase  45.91 
 
 		 282 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1303  formyltetrahydrofolate deformylase  46.69 
 
 		 295 aa  243  1.9999999999999999e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.154885 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4112  formyltetrahydrofolate deformylase  47.16 
 
 		 289 aa  243  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3699  formyltetrahydrofolate deformylase  49.46 
 
 		 303 aa  243  3e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2326  formyltetrahydrofolate deformylase  42.29 
 
 		 284 aa  243  3.9999999999999997e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0336  formyltetrahydrofolate deformylase  46.79 
 
 		 287 aa  242  6e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2211  formyltetrahydrofolate deformylase  46.45 
 
 		 288 aa  242  7e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308703  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0609  formyltetrahydrofolate deformylase  46.59 
 
 		 282 aa  241  9e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0467  formyltetrahydrofolate deformylase  44.91 
 
 		 293 aa  241  1e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1352  formyltetrahydrofolate deformylase  44.09 
 
 		 282 aa  241  1e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000782528  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19121  formyltetrahydrofolate deformylase  45.59 
 
 		 290 aa  241  1e-62  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.288968  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4789  formyltetrahydrofolate deformylase  46.24 
 
 		 285 aa  241  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4704  formyltetrahydrofolate deformylase  44.06 
 
 		 289 aa  240  2e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452468  normal  0.348836 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18931  formyltetrahydrofolate deformylase  44.85 
 
 		 284 aa  239  4e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.857167  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4033  formyltetrahydrofolate deformylase  45.52 
 
 		 287 aa  239  4e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.971472  hitchhiker  0.00329385 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0606  formyltetrahydrofolate deformylase  46.45 
 
 		 289 aa  239  4e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930988 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1795  formyltetrahydrofolate deformylase  44.49 
 
 		 284 aa  238  9e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.571525  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6004  formyltetrahydrofolate deformylase  45.52 
 
 		 293 aa  237  1e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.91162  normal  0.0315018 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1145  formyltetrahydrofolate deformylase  47.14 
 
 		 287 aa  237  1e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.857181  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0154  formyltetrahydrofolate deformylase  47.5 
 
 		 283 aa  238  1e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00603763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3590  formyltetrahydrofolate deformylase  48.39 
 
 		 298 aa  236  2e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0056  formyltetrahydrofolate deformylase  44.77 
 
 		 289 aa  236  2e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.333172  normal  0.573023 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5200  formyltetrahydrofolate deformylase  46.95 
 
 		 281 aa  237  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.569737 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2544  formyltetrahydrofolate deformylase  47.29 
 
 		 282 aa  237  2e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.553017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5913  formyltetrahydrofolate deformylase  45.88 
 
 		 296 aa  237  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.779943  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2993  formyltetrahydrofolate deformylase  47.31 
 
 		 280 aa  236  3e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0786  formyltetrahydrofolate deformylase  46.26 
 
 		 316 aa  236  3e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18381  formyltetrahydrofolate deformylase  45.29 
 
 		 284 aa  236  4e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0648  formyltetrahydrofolate deformylase  45.85 
 
 		 282 aa  236  4e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.101006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3717  formyltetrahydrofolate deformylase  45.16 
 
 		 309 aa  234  9e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2508  formyltetrahydrofolate deformylase  49.12 
 
 		 288 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.257697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12031  predicted protein  46.79 
 
 		 297 aa  234  1.0000000000000001e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0206302  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2236  formyltetrahydrofolate deformylase  45.23 
 
 		 288 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1114  formyltetrahydrofolate deformylase  43.73 
 
 		 286 aa  234  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.851375  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0213  formyltetrahydrofolate deformylase  46.26 
 
 		 283 aa  234  1.0000000000000001e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.543031 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3290  formyltetrahydrofolate deformylase  44.09 
 
 		 282 aa  234  2.0000000000000002e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.38752 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>