More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1714 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1714  aminotransferase class V  100 
 
 		 396 aa  812    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.280776 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6552  Serine--glyoxylate transaminase  71.76 
 
 		 417 aa  598  1e-170  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.323999 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7112  aminotransferase class V  71.25 
 
 		 417 aa  595  1e-169  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3261  serine-glyoxylate aminotransferase  70.78 
 
 		 415 aa  578  1e-164  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.491157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5929  Serine--glyoxylate transaminase  70 
 
 		 421 aa  568  1e-161  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.293616  normal  0.115656 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3670  aminotransferase class V  68.12 
 
 		 402 aa  550  1e-155  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.569732 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1795  Serine--glyoxylate transaminase  66.41 
 
 		 402 aa  547  1e-154  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.758509  normal  0.307754 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2131  aminotransferase class V  66.41 
 
 		 402 aa  547  1e-154  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1747  aminotransferase class V  66.84 
 
 		 402 aa  542  1e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.223279 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1406  serine--glyoxylate aminotransferase  63.85 
 
 		 395 aa  522  1e-147  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.600675  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1388  serine-glyoxylate aminotransferase  59.22 
 
 		 391 aa  492  9.999999999999999e-139  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0981  aminotransferase, class V  58.96 
 
 		 391 aa  491  1e-137  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3921  Serine--glyoxylate transaminase  58.44 
 
 		 396 aa  467  9.999999999999999e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2602  serine-glyoxylate aminotransferase  56.99 
 
 		 396 aa  456  1e-127  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0190637  normal  0.923656 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2489  putative serine--glyoxylate aminotransferase  59.57 
 
 		 400 aa  455  1e-127  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3308  serine-glyoxylate aminotransferase  55.9 
 
 		 398 aa  456  1e-127  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.662608  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0887  serine--glyoxylate transaminase  54.87 
 
 		 396 aa  450  1e-125  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.894708 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2699  serine-glyoxylate aminotransferase  55.9 
 
 		 396 aa  443  1e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.734695  normal  0.425338 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6210  Serine--glyoxylate transaminase  55.03 
 
 		 396 aa  434  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.164021 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5729  Serine-glyoxylate aminotransferase  53.32 
 
 		 401 aa  408  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6959  Serine--glyoxylate transaminase  51.76 
 
 		 406 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.987633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3001  Serine--glyoxylate transaminase  52.47 
 
 		 406 aa  403  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000231297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0923  aminotransferase, class V  50.38 
 
 		 401 aa  404  1e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000440044  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3524  Serine--glyoxylate transaminase  54.07 
 
 		 398 aa  400  9.999999999999999e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.119567  normal  0.298821 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5140  aminotransferase, class V  50.63 
 
 		 406 aa  395  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3022  aminotransferase, class V  51.51 
 
 		 406 aa  394  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.376021 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2753  aminotransferase, class V  49.87 
 
 		 406 aa  393  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3325  serine--glyoxylate aminotransferase  51.03 
 
 		 422 aa  392  1e-108  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4253  Serine--glyoxylate transaminase  49.75 
 
 		 406 aa  390  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2413  aminotransferase, class V  49.23 
 
 		 415 aa  389  1e-107  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0849168 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3400  Serine--glyoxylate transaminase  53.42 
 
 		 402 aa  390  1e-107  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5630  Serine-glyoxylate aminotransferase (SGAT)  52.28 
 
 		 401 aa  391  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5728  serine-glyoxylate aminotransferase  50 
 
 		 395 aa  387  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.474874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4717  Serine--glyoxylate transaminase  51.82 
 
 		 391 aa  387  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00393654 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4200  aminotransferase class V  52.08 
 
 		 391 aa  383  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.357141 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3418  Serine--glyoxylate transaminase  49.62 
 
 		 400 aa  383  1e-105  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2804  Serine--glyoxylate transaminase  48.48 
 
 		 399 aa  383  1e-105  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19938  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2906  aminotransferase class V  50.64 
 
 		 414 aa  383  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1162  aminotransferase, class V  48.09 
 
 		 398 aa  381  1e-104  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.000700049  normal  0.406686 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0548  Serine--glyoxylate transaminase  49.49 
 
 		 403 aa  380  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4570  Serine--glyoxylate transaminase  51.3 
 
 		 391 aa  376  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0189325 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0602  Serine--glyoxylate transaminase  48.84 
 
 		 394 aa  378  1e-103  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3052  Serine--glyoxylate transaminase  48.09 
 
 		 413 aa  376  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160259 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2767  aminotransferase class V  49.36 
 
 		 397 aa  361  1e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.169864  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3486  Serine--glyoxylate transaminase  48.2 
 
 		 397 aa  350  3e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.415302  normal  0.243284 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4911  aminotransferase class V  49.73 
 
 		 397 aa  345  8.999999999999999e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.158383  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4373  Serine--glyoxylate transaminase  48.69 
 
 		 397 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.150786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1369  Serine--glyoxylate transaminase  47.41 
 
 		 397 aa  330  3e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0008  serine--glyoxylate transaminase  41.25 
 
 		 383 aa  284  2.0000000000000002e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0160251  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2630  aminotransferase class V  41.21 
 
 		 382 aa  279  8e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3486  aminotransferase class V  41.21 
 
 		 382 aa  279  8e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0780  Serine--glyoxylate transaminase  39.13 
 
 		 395 aa  277  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.138734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0019  Serine--glyoxylate transaminase  38.38 
 
 		 388 aa  276  5e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000322298  hitchhiker  0.00000185369 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4341  aminotransferase class V  42.45 
 
 		 382 aa  275  9e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.182025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0544  putative aminotransferase, class V  39.25 
 
 		 395 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.155819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3803  aminotransferase class V  40.16 
 
 		 384 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4629  Serine--glyoxylate transaminase  39.9 
 
 		 395 aa  274  3e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0857  aminotransferase class V  38.62 
 
 		 395 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1188  aminotransferase class V  40.21 
 
 		 383 aa  267  2e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.26379  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3167  Serine--glyoxylate transaminase  40.76 
 
 		 385 aa  267  2.9999999999999995e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1383  aminotransferase, class V  37.76 
 
 		 384 aa  260  2e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000831703  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1429  aminotransferase class V  37.76 
 
 		 384 aa  260  4e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.126435  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0191  Serine--glyoxylate transaminase  41.58 
 
 		 382 aa  258  1e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.746637 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0013  aminotransferase, class V  39.06 
 
 		 385 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141675  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4689  aminotransferase, class V  39.57 
 
 		 393 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0103  class V aminotransferase  37.14 
 
 		 382 aa  252  9.000000000000001e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0836  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  37.56 
 
 		 400 aa  251  1e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.259424  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00351  soluble hydrogenase small subunit  36.51 
 
 		 385 aa  245  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0945  Serine--pyruvate transaminase  39.14 
 
 		 386 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0754728  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2693  aminotransferase class V  37.14 
 
 		 381 aa  243  5e-63  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00390195  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00341  soluble hydrogenase small subunit  36.46 
 
 		 387 aa  239  5.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0011  aminotransferase, class V  39.05 
 
 		 384 aa  239  5.999999999999999e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000196245  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0040  aminotransferase class V  36.36 
 
 		 385 aa  238  2e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0119169  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0111  aminotransferase, class V  34.9 
 
 		 380 aa  238  2e-61  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2460  Serine--glyoxylate transaminase  35.23 
 
 		 379 aa  237  3e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00341  soluble hydrogenase small subunit  36.26 
 
 		 387 aa  236  5.0000000000000005e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2018  Serine--glyoxylate transaminase  38.16 
 
 		 400 aa  236  8e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00331  soluble hydrogenase small subunit  33.94 
 
 		 384 aa  235  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0245  Serine-pyruvate aminotransferase/aspartate aminotransferase  38.48 
 
 		 400 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0035  soluble hydrogenase small subunit  35.36 
 
 		 387 aa  235  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00341  soluble hydrogenase small subunit  37.11 
 
 		 387 aa  234  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1361  soluble hydrogenase small subunit  33.94 
 
 		 384 aa  233  4.0000000000000004e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1888  aminotransferase, class V  38.22 
 
 		 400 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.918879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  36.2 
 
 		 382 aa  233  6e-60  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2300  Serine--glyoxylate transaminase  34.29 
 
 		 379 aa  231  1e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000212673  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0106  aminotransferase, class V  36.36 
 
 		 379 aa  231  2e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3472  aminotransferase, class V  36.97 
 
 		 396 aa  229  7e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2090  putative serine--glyoxylate aminotransferase  39.27 
 
 		 418 aa  228  1e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.71592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1351  aminotransferase class V  37.13 
 
 		 363 aa  228  2e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0217  Serine--glyoxylate transaminase  34.72 
 
 		 379 aa  228  2e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0575  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  37.85 
 
 		 362 aa  226  4e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0155  Serine--glyoxylate transaminase  35.05 
 
 		 380 aa  226  7e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00431  soluble hydrogenase small subunit  36.79 
 
 		 382 aa  225  1e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0009  aminotransferase class V  38.3 
 
 		 383 aa  225  1e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1389  alanine--glyoxylate transaminase  35.32 
 
 		 382 aa  224  2e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0040  soluble hydrogenase small subunit  37.6 
 
 		 397 aa  224  3e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0600  soluble hydrogenase, tritium exchange subunit  37.29 
 
 		 362 aa  223  4e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00706485  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1247  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  35.06 
 
 		 382 aa  223  6e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.465201  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_540  aminotransferase, class V  37.29 
 
 		 362 aa  222  7e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0499245  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0257  response regulator receiver protein  33.07 
 
 		 382 aa  222  8e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>