More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1311 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1311  ABC-3 protein  100 
 
 		 290 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0179  ABC-3 protein  83.79 
 
 		 290 aa  421  1e-117  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.958095 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1063  ABC transporter membrane spanning protein  76.39 
 
 		 290 aa  396  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21744  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2634  cation ABC transporter, permease protein  77.16 
 
 		 289 aa  392  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.059277  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0677  ABC-3 protein  78.62 
 
 		 290 aa  393  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.697838  normal  0.0650939 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2367  hypothetical protein  76.12 
 
 		 289 aa  390  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00313159  normal  0.594079 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0622  ABC-3 protein  76.9 
 
 		 290 aa  385  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.285827  normal  0.675779 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2228  ABC-3 protein  64.69 
 
 		 289 aa  328  7e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0927  ABC-3 protein  59.17 
 
 		 290 aa  321  8e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.426068  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4558  hypothetical protein  59.52 
 
 		 290 aa  320  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1340  ABC transporter permease  61.94 
 
 		 290 aa  320  9.999999999999999e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.562769 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3427  hypothetical protein  62.37 
 
 		 289 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2783  ABC-3 protein  61.59 
 
 		 291 aa  311  7.999999999999999e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.314797  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4829  hypothetical protein  60.63 
 
 		 291 aa  310  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0915  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems permease components  59.93 
 
 		 289 aa  305  4.0000000000000004e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.891696  normal  0.706737 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0844  hypothetical protein  59.17 
 
 		 290 aa  299  4e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0721518 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0704  ABC-3 protein  59.03 
 
 		 286 aa  299  4e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.462722  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0654  ABC-3 protein  60.14 
 
 		 284 aa  298  6e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3703  ABC-3 transporter component  62.63 
 
 		 290 aa  298  6e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.406266  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2052  hypothetical protein  56.61 
 
 		 299 aa  298  6e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.146645  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4708  ABC-3 protein  57.79 
 
 		 290 aa  298  7e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.13978 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3130  ABC-3 protein  59.64 
 
 		 291 aa  297  1e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.362621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3680  ABC-3 protein  59.72 
 
 		 284 aa  291  1e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0221  hypothetical protein  58.84 
 
 		 300 aa  288  5.0000000000000004e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.860948  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2471  ABC-3 protein  56.49 
 
 		 296 aa  287  1e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3531  ABC-3 protein  58.87 
 
 		 284 aa  286  2e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1596  ABC-3 protein  56.94 
 
 		 288 aa  284  1.0000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0434418 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1143  ABC-3 protein  55.79 
 
 		 294 aa  284  1.0000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0978  ABC-3 protein  60.54 
 
 		 295 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1047  ABC-3 protein  60.7 
 
 		 295 aa  279  4e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160155 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1175  ABC-3 protein  60.7 
 
 		 295 aa  278  7e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1122  ABC-3 protein  60.49 
 
 		 285 aa  276  2e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000976582  unclonable  0.0000000110767 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3499  ABC-3 protein  57.84 
 
 		 288 aa  276  2e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1973  ABC transporter, membrane protein  55.76 
 
 		 293 aa  272  6e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3177  ABC-3 protein  55.94 
 
 		 287 aa  259  4e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3391  ABC-3 protein  57.71 
 
 		 304 aa  253  4.0000000000000004e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0468601  normal  0.064332 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5583  ABC-3 protein  58.1 
 
 		 288 aa  251  8.000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0895448  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0351  ABC transporter, permease protein  49.47 
 
 		 290 aa  248  7e-65  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5388  ABC-3 protein  57.89 
 
 		 288 aa  247  1e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.375408  normal  0.0641109 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0105  cation ABC transporter, permease protein  51.42 
 
 		 284 aa  241  7.999999999999999e-63  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.536532  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5660  hypothetical protein  51.09 
 
 		 288 aa  226  4e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.721685  normal  0.0964649 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3561  ABC-3 protein  60.07 
 
 		 295 aa  202  5e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.232243 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  33.33 
 
 		 279 aa  167  2.9999999999999998e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  35.77 
 
 		 278 aa  164  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  35.77 
 
 		 278 aa  164  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  31.9 
 
 		 277 aa  160  3e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  34.63 
 
 		 280 aa  159  6e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2066  ABC-3 protein  36.84 
 
 		 304 aa  156  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2804  ABC-3 protein  36.23 
 
 		 289 aa  153  2.9999999999999998e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0291  ABC transporter, permease protein  34.85 
 
 		 278 aa  150  3e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  31.99 
 
 		 288 aa  150  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  31.99 
 
 		 288 aa  149  4e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1043  ABC-3 protein  37.99 
 
 		 312 aa  149  8e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151088 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3635  ABC-3 protein  31.99 
 
 		 288 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  32.04 
 
 		 288 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  32.04 
 
 		 288 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2130  ABC-3 protein  33.21 
 
 		 286 aa  140  3e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0882717 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1702  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeD  32.35 
 
 		 297 aa  139  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1812  ABC-3 protein  32.35 
 
 		 297 aa  139  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0136745  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2633  chelated iron transport system membrane protein  32.35 
 
 		 297 aa  139  3.9999999999999997e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  0.711765 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  32.72 
 
 		 281 aa  139  4.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2174  ABC-3 protein  36.36 
 
 		 306 aa  134  9.999999999999999e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0325  chelated iron ABC transporter, permease  32.26 
 
 		 280 aa  133  3e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.057736  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  31.91 
 
 		 280 aa  132  9e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1916  ABC-3 protein  31.73 
 
 		 285 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2208  ABC-3 protein  31.67 
 
 		 285 aa  130  3e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.033424  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3405  hypothetical protein  33.58 
 
 		 285 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.555758 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  32.27 
 
 		 285 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3260  ABC-3 protein  30.1 
 
 		 294 aa  128  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00406808  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1013  ABC transporter  33.57 
 
 		 291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134252  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3701  ABC-3 protein  32.36 
 
 		 282 aa  125  7e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  30.39 
 
 		 285 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1661  putative ABC transporter membrane protein  35.25 
 
 		 303 aa  123  5e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.726587  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1589  ABC-3 protein  34.55 
 
 		 281 aa  122  6e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  31.77 
 
 		 300 aa  122  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1256  ABC-3 protein  34.06 
 
 		 280 aa  121  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.400724  hitchhiker  0.000923088 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0776  ABC-3 protein  32.86 
 
 		 290 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0803  ABC-3 protein  32.86 
 
 		 290 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06291  ABC transporter  32.07 
 
 		 290 aa  121  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06591  ABC transporter  32.07 
 
 		 290 aa  121  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.591644  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0918  ABC-3 protein  32.25 
 
 		 278 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0960733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0892  ABC-3 protein  32.25 
 
 		 278 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3278  ABC-3 protein  32.38 
 
 		 291 aa  119  6e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1656  ABC-3 metal transporter  31.56 
 
 		 283 aa  118  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.764054  hitchhiker  0.000770166 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1236  anchored repeat-type ABC transporter, permease subunit  30.97 
 
 		 287 aa  115  7.999999999999999e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000156655 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1230  hypothetical protein  33.68 
 
 		 301 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2858  ABC-3 protein  35.82 
 
 		 303 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2573  manganese transport system membrane protein MntB  32.01 
 
 		 276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.449069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2917  ABC-3 protein  32.93 
 
 		 285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0039  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system permease components  32.58 
 
 		 290 aa  113  3e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2146  hypothetical protein  36.89 
 
 		 295 aa  113  3e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1485  ABC transporter  32.97 
 
 		 274 aa  112  7.000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.122101  normal  0.297655 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2045  ABC-3 protein  31.99 
 
 		 278 aa  112  7.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00377513  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2603  ABC-3 protein  31.46 
 
 		 275 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3358  hypothetical protein  30.5 
 
 		 297 aa  111  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0130649  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2143  ABC-3 protein  34.35 
 
 		 304 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18711  ABC transporter  32.85 
 
 		 289 aa  110  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.24081 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1114  ABC-3 protein  27.8 
 
 		 279 aa  110  4.0000000000000004e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10471  ABC transporter  32.1 
 
 		 289 aa  109  5e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.246572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2131  ABC-3 protein  30.56 
 
 		 286 aa  109  7.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.241388 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>