More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0200 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  100 
 
 
313 aa  621  1e-177  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0220  ribokinase  53.05 
 
 
305 aa  276  2e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.328501  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  43.69 
 
 
309 aa  238  8e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  45.37 
 
 
299 aa  232  7e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0558  PfkB domain protein  43.61 
 
 
295 aa  228  1e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3765  ribokinase  48.72 
 
 
304 aa  226  3e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0637373 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2909  ribokinase  47.15 
 
 
302 aa  223  2e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0179509 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  45.81 
 
 
306 aa  222  8e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7623  ribokinase  46.5 
 
 
308 aa  221  2e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.921063  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  45.63 
 
 
309 aa  220  2e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4591  ribokinase  43.52 
 
 
295 aa  220  2e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  45.63 
 
 
309 aa  219  7e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  43.83 
 
 
301 aa  218  1e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  45.81 
 
 
305 aa  217  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3280  ribokinase  44.59 
 
 
305 aa  216  3e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  40.45 
 
 
304 aa  212  5e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  45.05 
 
 
302 aa  212  5e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  45.05 
 
 
302 aa  212  7e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  43.87 
 
 
302 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  42.9 
 
 
305 aa  210  2e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  42.77 
 
 
315 aa  209  5e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0865  ribokinase  40.97 
 
 
305 aa  207  2e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.657252 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  45.63 
 
 
295 aa  205  8e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  41.27 
 
 
308 aa  205  9e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  41.38 
 
 
308 aa  204  2e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  41.38 
 
 
308 aa  204  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1923  ribokinase  43.55 
 
 
305 aa  204  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.254632  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  41.38 
 
 
308 aa  204  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  41.72 
 
 
306 aa  203  3e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0225  ribokinase  40 
 
 
317 aa  203  3e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  40.72 
 
 
302 aa  203  3e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  43.09 
 
 
302 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3974  ribokinase  41.9 
 
 
308 aa  203  4e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00187599  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  45.22 
 
 
308 aa  202  7e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  44.19 
 
 
308 aa  201  1e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4524  ribokinase  41.9 
 
 
308 aa  201  1e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00216955  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4171  ribokinase  42.54 
 
 
310 aa  201  1e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000241058  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4120  ribokinase  42.59 
 
 
314 aa  201  2e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.444588  normal  0.199768 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  44.76 
 
 
308 aa  201  2e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  40.63 
 
 
305 aa  201  2e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4897  ribokinase  42.63 
 
 
318 aa  201  2e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00647815  hitchhiker  8.86041e-07 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03638  ribokinase  42.59 
 
 
309 aa  200  3e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00223583  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03583  hypothetical protein  42.59 
 
 
309 aa  200  3e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00147711  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2649  ribokinase  40.84 
 
 
319 aa  200  3e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  2.12257e-05  normal  0.357458 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5188  ribokinase  42.27 
 
 
314 aa  199  4e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.034479  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  40 
 
 
307 aa  199  4e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  45.4 
 
 
297 aa  199  4e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4242  ribokinase  42.27 
 
 
309 aa  199  5e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00710658 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3968  ribokinase  42.27 
 
 
309 aa  199  5e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112559  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4268  ribokinase  42.27 
 
 
309 aa  199  5e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00050994  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0943  ribokinase  43.59 
 
 
321 aa  199  7e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.826251  normal  0.172047 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  40.13 
 
 
305 aa  198  8e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2877  ribokinase-like domain-containing protein  45.48 
 
 
300 aa  197  1e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.98714  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4167  ribokinase  41.96 
 
 
309 aa  198  1e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.895072  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4215  ribokinase  41.96 
 
 
309 aa  197  2e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  42.44 
 
 
308 aa  196  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  42.44 
 
 
308 aa  196  3e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39540  sugar kinase, ribokinase  43.09 
 
 
296 aa  196  4e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1402  ribokinase  46.3 
 
 
318 aa  196  5e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0972031 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6126  ribokinase  44.01 
 
 
308 aa  195  9e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.425434 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5761  ribokinase  44.01 
 
 
308 aa  195  9e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4168  ribokinase  41.77 
 
 
309 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4277  ribokinase  41.77 
 
 
309 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.136431  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4218  ribokinase  41.77 
 
 
309 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.980767 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2837  ribokinase  40.76 
 
 
302 aa  193  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4097  ribokinase  41.77 
 
 
309 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4234  ribokinase  40.63 
 
 
308 aa  194  2e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000102528  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  37.66 
 
 
306 aa  194  2e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6608  ribokinase  44.01 
 
 
308 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.487327  normal  0.393887 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4112  ribokinase  41.77 
 
 
309 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2371  ribokinase  44.52 
 
 
306 aa  193  4e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0559074  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  37.7 
 
 
310 aa  192  7e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  38.71 
 
 
311 aa  192  9e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3179  ribokinase  38.83 
 
 
303 aa  190  2e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1312  ribokinase  42.9 
 
 
299 aa  190  3e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  42.77 
 
 
312 aa  189  5e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  41.8 
 
 
310 aa  189  5e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1130  ribokinase  41.16 
 
 
311 aa  189  7e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1610  ribokinase  41.16 
 
 
311 aa  189  7e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.231434  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1603  ribokinase  37.38 
 
 
310 aa  188  9e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  6.77641e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2689  ribokinase  36.06 
 
 
345 aa  188  9e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1587  ribokinase  41.48 
 
 
311 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.646425 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  41.16 
 
 
309 aa  188  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3580  ribokinase  39.48 
 
 
303 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4112  ribokinase  39.23 
 
 
314 aa  187  3e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal  0.0163752 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2120  PfkB domain protein  34.52 
 
 
290 aa  186  4e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3648  ribokinase  39.48 
 
 
303 aa  186  4e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.16351  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3771  ribokinase  38.91 
 
 
303 aa  185  7e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0659  ribokinase  38.91 
 
 
303 aa  185  7e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3477  ribokinase  38.83 
 
 
303 aa  184  1e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1612  ribokinase family sugar kinase  34.19 
 
 
340 aa  184  2e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0874983  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0878  ribokinase  42.63 
 
 
321 aa  184  2e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0605401  normal  0.165576 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0253  ribokinase  38.26 
 
 
304 aa  182  5e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0259  ribokinase  38.26 
 
 
304 aa  182  5e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3307  ribokinase  37.86 
 
 
303 aa  182  6e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0646  ribokinase  37.86 
 
 
303 aa  182  6e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.497411 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2588  PfkB domain-containing protein  43.14 
 
 
311 aa  181  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.02383  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  35.9 
 
 
307 aa  179  4e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  1.50833e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3570  PfkB  40.95 
 
 
297 aa  179  6e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.498935  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1119  ribokinase  37.54 
 
 
302 aa  178  9e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.970785  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>