More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4865 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0425  fumarate hydratase  70.82 
 
 		 498 aa  677    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4865  fumarate hydratase  100 
 
 		 485 aa  994    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.649966 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1166  fumarate hydratase, class II  67.22 
 
 		 482 aa  650    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1545  fumarate hydratase  73.43 
 
 		 485 aa  720    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1440  fumarate lyase  71.22 
 
 		 482 aa  645    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7115  fumarate hydratase, class II  64.99 
 
 		 487 aa  629  1e-179  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.257416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1618  fumarate hydratase  62.11 
 
 		 485 aa  621  1e-177  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3005  fumarate hydratase  60.09 
 
 		 464 aa  566  1e-160  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2866  fumarate hydratase  60.09 
 
 		 463 aa  566  1e-160  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2731  fumarate hydratase, class II  59.31 
 
 		 471 aa  566  1e-160  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.799595  normal  0.207959 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1627  fumarate hydratase  58.9 
 
 		 468 aa  554  1e-156  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2129  fumarate hydratase  60.66 
 
 		 487 aa  549  1e-155  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.000218779  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1328  fumarate hydratase  57.77 
 
 		 469 aa  551  1e-155  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50715  normal  0.832729 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2138  fumarate hydratase  58.91 
 
 		 464 aa  545  1e-154  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.273045  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1908  fumarate hydratase  59.08 
 
 		 465 aa  546  1e-154  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.856676  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1238  fumarate hydratase  55.58 
 
 		 459 aa  542  1e-153  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1197  fumarate hydratase  55.58 
 
 		 459 aa  540  9.999999999999999e-153  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2334  fumarate hydratase  58.28 
 
 		 465 aa  541  9.999999999999999e-153  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00667023  normal  0.148736 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1452  fumarate hydratase  57.33 
 
 		 465 aa  538  9.999999999999999e-153  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.315875 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0721  fumarate hydratase  58.7 
 
 		 464 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.764225 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1686  fumarate hydratase  56.8 
 
 		 467 aa  535  1e-151  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.569967  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2394  fumarate hydratase  57.61 
 
 		 462 aa  537  1e-151  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.344054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2918  fumarate hydratase, class II  58.55 
 
 		 464 aa  536  1e-151  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1667  fumarate hydratase  59.04 
 
 		 462 aa  532  1e-150  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0452593 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0812  fumarate hydratase  59.13 
 
 		 464 aa  534  1e-150  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.661312 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0283  fumarate hydratase, class II  59.08 
 
 		 468 aa  535  1e-150  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.136542 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1705  fumarate hydratase  57.21 
 
 		 467 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0627343  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1007  fumarate hydratase  58.11 
 
 		 463 aa  531  1e-150  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0281395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3201  fumarate hydratase, class II  58.33 
 
 		 464 aa  535  1e-150  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1578  fumarate hydratase  57.21 
 
 		 467 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.952 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0966  fumarate hydratase  58.95 
 
 		 464 aa  531  1e-150  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399399  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85745  fumarase  57.11 
 
 		 463 aa  531  1e-150  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1568  fumarate hydratase  56.99 
 
 		 467 aa  530  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.366448  normal  0.0865298 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1637  fumarate hydratase  56.99 
 
 		 467 aa  530  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.799774 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0970  fumarate hydratase  58.73 
 
 		 464 aa  529  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0493  fumarate hydratase  59.04 
 
 		 464 aa  530  1e-149  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01700  fumarate hydratase, putative  56.86 
 
 		 510 aa  529  1e-149  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1071  fumarate hydratase  59.96 
 
 		 465 aa  528  1e-149  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2940  fumarate hydratase  59.04 
 
 		 464 aa  530  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0259  fumarate hydratase  59.04 
 
 		 464 aa  530  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389024  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4795  fumarate hydratase, class II  60.22 
 
 		 464 aa  530  1e-149  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2886  fumarate hydratase  58.62 
 
 		 631 aa  530  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0889  fumarate hydratase  59.04 
 
 		 464 aa  530  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.445127  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1049  fumarate hydratase  58.3 
 
 		 464 aa  529  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.994408  normal  0.827821 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0611  fumarate hydratase  58.3 
 
 		 464 aa  529  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.91536  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0083  fumarate hydratase  58.08 
 
 		 466 aa  531  1e-149  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1090  fumarate hydratase  58.3 
 
 		 464 aa  529  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.316185  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1874  fumarate hydratase  56.99 
 
 		 467 aa  530  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0300838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2826  fumarate hydratase  59.04 
 
 		 464 aa  530  1e-149  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.841054  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2515  fumarate hydratase  59.04 
 
 		 464 aa  530  1e-149  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324013  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1576  fumarate hydratase  56.72 
 
 		 482 aa  525  1e-148  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0866386  normal  0.827447 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1279  fumarate hydratase  58.64 
 
 		 461 aa  527  1e-148  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1818  fumarate hydratase  57.24 
 
 		 467 aa  525  1e-148  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0435049  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4203  fumarate hydratase  57.86 
 
 		 464 aa  526  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2471  fumarate hydratase  58.77 
 
 		 462 aa  525  1e-148  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1685  fumarate hydratase  58.39 
 
 		 464 aa  528  1e-148  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2040  fumarate hydratase  57.11 
 
 		 465 aa  527  1e-148  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.938947  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3022  fumarate hydratase  57.95 
 
 		 463 aa  527  1e-148  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2655  fumarate hydratase  56.62 
 
 		 463 aa  526  1e-148  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0321342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4127  fumarate hydratase  57.77 
 
 		 461 aa  525  1e-148  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.542273  normal  0.221641 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4239  fumarate hydratase  57.77 
 
 		 461 aa  525  1e-148  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2032  fumarate hydratase, class II  57.02 
 
 		 467 aa  525  1e-147  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000761073  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2320  fumarate hydratase  57.02 
 
 		 467 aa  524  1e-147  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1796  fumarate hydratase  57.02 
 
 		 467 aa  524  1e-147  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.114122  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0240  fumarate hydratase  59.57 
 
 		 466 aa  524  1e-147  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0795  fumarate hydratase  56.86 
 
 		 466 aa  522  1e-147  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00749677  normal  0.0712325 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2019  fumarate hydratase  57.02 
 
 		 467 aa  523  1e-147  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2341  fumarate hydratase  56.67 
 
 		 465 aa  524  1e-147  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0376  fumarate hydratase  56.24 
 
 		 461 aa  522  1e-147  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1832  fumarate hydratase  56.52 
 
 		 464 aa  525  1e-147  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.87946  hitchhiker  0.00222416 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01580  fumarate hydratase  56.8 
 
 		 467 aa  521  1e-146  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191338  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0492  fumarate hydratase  54.15 
 
 		 464 aa  520  1e-146  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.212311  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0192  fumarate hydratase  57.89 
 
 		 463 aa  518  1e-146  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2279  fumarate hydratase  56.33 
 
 		 465 aa  521  1e-146  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.108005 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0637  fumarate hydratase  55.36 
 
 		 461 aa  520  1e-146  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.536555  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2445  fumarate hydratase  57.02 
 
 		 466 aa  520  1e-146  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.890321  normal  0.353648 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1589  fumarate hydratase  56.8 
 
 		 467 aa  521  1e-146  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.194502  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01570  hypothetical protein  56.8 
 
 		 467 aa  521  1e-146  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.24852  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74587  Fumarase converts fumaric acid to L-malic acid in the TCA cycle  56.43 
 
 		 492 aa  520  1e-146  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.595402 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1449  fumarate hydratase  54.8 
 
 		 513 aa  520  1e-146  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.352432 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08707  fumarate hydratase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G02470)  55.63 
 
 		 544 aa  517  1.0000000000000001e-145  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2270  fumarate hydratase  55.58 
 
 		 465 aa  516  1.0000000000000001e-145  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1556  fumarate hydratase  53.39 
 
 		 463 aa  514  1.0000000000000001e-145  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.433937  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2970  fumarate hydratase  54.49 
 
 		 468 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0174  fumarate hydratase  57.89 
 
 		 478 aa  517  1.0000000000000001e-145  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000137978  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2522  fumarate hydratase  56.89 
 
 		 465 aa  517  1.0000000000000001e-145  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2151  fumarate hydratase, class II  60.39 
 
 		 467 aa  516  1.0000000000000001e-145  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0733926 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1038  fumarate hydratase  57.52 
 
 		 466 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.88915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2016  fumarate hydratase  57.39 
 
 		 463 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1724  fumarate hydratase  54.7 
 
 		 513 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.90897  decreased coverage  0.00664146 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2882  fumarate hydratase  57.36 
 
 		 463 aa  516  1.0000000000000001e-145  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.405622  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0695  fumarate hydratase, class II  58.55 
 
 		 469 aa  514  1e-144  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259805  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3242  fumarate hydratase, class II  57.24 
 
 		 465 aa  513  1e-144  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36139  fumarate hydratase  57.4 
 
 		 462 aa  512  1e-144  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0424  fumarate hydratase  53.39 
 
 		 463 aa  513  1e-144  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1985  fumarate hydratase  55.36 
 
 		 465 aa  514  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0355  fumarate hydratase  57.58 
 
 		 463 aa  511  1e-144  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0771995  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2891  fumarate hydratase, class II  57.02 
 
 		 472 aa  512  1e-144  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2664  fumarate hydratase, class II  57.02 
 
 		 472 aa  513  1e-144  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.613599  normal  0.60037 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1873  fumarate hydratase  55.36 
 
 		 465 aa  512  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0104019  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>