223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2141 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_0883  MmgE/PrpD family protein  75.98 
 
 
481 aa  726    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.585439  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2745  hypothetical protein  69.07 
 
 
482 aa  670    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.183054 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1360  MmgE/PrpD family protein  80.23 
 
 
483 aa  734    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.737608  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2141  MmgE/PrpD family protein  100 
 
 
488 aa  997    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.628932 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1268  MmgE/PrpD family protein  61.38 
 
 
455 aa  571  1.0000000000000001e-162  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0482  MmgE/PrpD family protein  52.3 
 
 
457 aa  468  9.999999999999999e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0407  MmgE/PrpD family protein  52.95 
 
 
456 aa  466  9.999999999999999e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.544537 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1269  MmgE/PrpD  52.75 
 
 
463 aa  456  1e-127  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0971  hypothetical protein  41.91 
 
 
471 aa  333  5e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226989  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5792  MmgE/PrpD family protein  40.67 
 
 
461 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205473  normal  0.299026 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4091  hypothetical protein  40.75 
 
 
451 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.42622  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6206  MmgE/PrpD family protein  40.3 
 
 
451 aa  281  1e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0172  MmgE/PrpD family protein  35.29 
 
 
451 aa  256  9e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1910  hypothetical protein  36.16 
 
 
451 aa  247  3e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3581  MmgE/PrpD family protein  34.77 
 
 
453 aa  218  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.604157  normal  0.0576732 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1226  hypothetical protein  32.05 
 
 
490 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1004  putative MmgE/Prp family protein  30.65 
 
 
458 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.451747 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21260  MmgE/PrpD family protein  34.56 
 
 
456 aa  201  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3582  MmgE/PrpD family protein  33.03 
 
 
451 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0594439 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0284  putative MmgE/Prp family protein  32.07 
 
 
500 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1585  MmgE/PrpD family protein  34.87 
 
 
482 aa  195  2e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0449825  hitchhiker  0.00338638 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3457  MmgE/PrpD family protein  32.6 
 
 
462 aa  192  9e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1168  MmgE/PrpD family protein  31.12 
 
 
456 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2966  MmgE/PrpD  27.83 
 
 
469 aa  186  1.0000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4177  MmgE/PrpD family protein  28.97 
 
 
441 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3047  MmgE/PrpD family protein  31.78 
 
 
449 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.110565  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3583  MmgE/PrpD family protein  33.82 
 
 
462 aa  179  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0329422 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3986  MmgE/PrpD family protein  28.37 
 
 
441 aa  177  3e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4633  hypothetical protein  30.98 
 
 
450 aa  173  6.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6463  MmgE/PrpD family protein  32.58 
 
 
458 aa  172  9e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3512  MmgE/PrpD family protein  31.59 
 
 
453 aa  172  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208219  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6170  MmgE/PrpD family protein  31.29 
 
 
458 aa  172  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52880  hypothetical protein  30.68 
 
 
450 aa  169  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5368  hypothetical protein  29.79 
 
 
451 aa  169  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.775637  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0016  hypothetical protein  35.01 
 
 
456 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4513  MmgE/PrpD family protein  28.7 
 
 
463 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0496  MmgE/PrpD family protein  29.17 
 
 
461 aa  165  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0705  MmgE/PrpD  32.47 
 
 
458 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0564  MmgE/PrpD family protein  31.82 
 
 
454 aa  163  6e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.626803  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1347  MmgE/PrpD family protein  33.89 
 
 
458 aa  162  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0281  MmgE/PrpD family protein  25.78 
 
 
446 aa  161  2e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0134  MmgE/PrpD family protein  32.88 
 
 
454 aa  161  3e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.99136  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2225  MmgE/PrpD family protein  32.52 
 
 
503 aa  161  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3898  hypothetical protein  31.18 
 
 
459 aa  160  4e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125384  normal  0.388647 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4085  MmgE/PrpD family protein  31.68 
 
 
476 aa  160  5e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0581  MmgE/PrpD  32.78 
 
 
462 aa  160  6e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0367  MmgE/PrpD  34.99 
 
 
455 aa  159  7e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.559091  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3608  MmgE/PrpD family protein  27.83 
 
 
468 aa  160  7e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.351268  normal  0.839729 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0200  MmgE/PrpD family protein  31.95 
 
 
454 aa  159  9e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1583  MmgE/PrpD family protein  26.85 
 
 
446 aa  159  1e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0146  MmgE/PrpD  31.36 
 
 
457 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6849  MmgE/PrpD family protein  29.62 
 
 
460 aa  159  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1882  MmgE/PrpD family protein  33.33 
 
 
443 aa  158  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1394  MmgE/PrpD family protein  25.73 
 
 
446 aa  157  4e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0615722  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3540  MmgE/PrpD  31.29 
 
 
457 aa  157  5.0000000000000005e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10861  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1204  MmgE/PrpD family protein  28.1 
 
 
449 aa  155  2e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1260  putative MmgE/Prp family protein  33.33 
 
 
503 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3028  MmgE/PrpD family protein  33.33 
 
 
503 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2736  MmgE/PrpD  30.54 
 
 
460 aa  154  5e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01619  conserved hypothetical protein  27.75 
 
 
501 aa  153  7e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.17235 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1311  MmgE/PrpD family protein  31.29 
 
 
454 aa  152  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3985  MmgE/PrpD family protein  30.34 
 
 
450 aa  152  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18590  uncharacterized protein involved in propionate catabolism  32.06 
 
 
465 aa  152  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6601  MmgE/PrpD family protein  30.23 
 
 
462 aa  151  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.148689 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6636  MmgE/PrpD family protein  30.84 
 
 
457 aa  151  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.29162 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1760  MmgE/PrpD family protein  33.8 
 
 
445 aa  150  5e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2140  MmgE/PrpD family protein  31.19 
 
 
461 aa  150  6e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00607749 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6172  MmgE/PrpD family protein  31.1 
 
 
464 aa  150  7e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.661576  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5808  MmgE/PrpD  31.1 
 
 
463 aa  149  8e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6148  MmgE/PrpD family protein  32.41 
 
 
442 aa  149  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3107  MmgE/PrpD family protein  32.44 
 
 
447 aa  149  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.367847  normal  0.515928 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4176  MmgE/PrpD family protein  30.32 
 
 
450 aa  147  3e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0820  2-methylcitrate dehydratase  26.46 
 
 
457 aa  147  6e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0206  MmgE/PrpD family protein  26.7 
 
 
449 aa  146  7.0000000000000006e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2858  MmgE/PrpD  28.86 
 
 
450 aa  145  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6217  MmgE/PrpD family protein  30.12 
 
 
461 aa  145  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00176752  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0040  MmgE/PrpD family protein  26.98 
 
 
453 aa  144  4e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2582  putative MmgE/Prp family protein  29.98 
 
 
494 aa  143  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.194391 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6625  MmgE/PrpD family protein  33.42 
 
 
447 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4086  hypothetical protein  28.96 
 
 
470 aa  141  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4102  hypothetical protein  29.64 
 
 
461 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4067  MmgE/PrpD family protein  30.92 
 
 
468 aa  140  6e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.530176  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1242  MmgE/PrpD family protein  31.46 
 
 
458 aa  140  7e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.424636  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1511  MmgE/PrpD  26.75 
 
 
472 aa  140  7e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0113  MmgE/PrpD family protein  30.17 
 
 
465 aa  138  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1510  MmgE/PrpD  26.82 
 
 
449 aa  138  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0614  MmgE/PrpD family protein  29.19 
 
 
470 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.708965  normal  0.0263157 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0286  putative MmgE/PrpD family protein  27.25 
 
 
481 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.522372  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6810  MmgE/PrpD family protein  27.71 
 
 
460 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4189  MmgE/PrpD  27.05 
 
 
481 aa  134  3e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127966  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4958  MmgE/PrpD family protein  30.41 
 
 
464 aa  134  5e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0116  MmgE/PrpD family protein  32.93 
 
 
454 aa  134  5e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.697081 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5175  hypothetical protein  27.66 
 
 
453 aa  133  9e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4983  MmgE/PrpD family protein  27.54 
 
 
486 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.33687  normal  0.0207357 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3094  MmgE/PrpD family protein  29.43 
 
 
453 aa  131  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6631  MmgE/PrpD family protein  32.57 
 
 
468 aa  130  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0359328  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4443  MmgE/PrpD family protein  30.22 
 
 
464 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.945637 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1703  Fis family transcriptional regulator  26.44 
 
 
453 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0229045 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4268  MmgE/PrpD family protein  29.92 
 
 
454 aa  127  4.0000000000000003e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0368  MmgE/PrpD  30.11 
 
 
472 aa  127  5e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>