More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4024 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4024  pyrroline-5-carboxylate reductase  100 
 
 		 276 aa  514  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324563  normal  0.363297 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4063  pyrroline-5-carboxylate reductase  93.5 
 
 		 277 aa  473  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.903054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3769  pyrroline-5-carboxylate reductase  92.42 
 
 		 277 aa  467  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.790636 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4946  pyrroline-5-carboxylate reductase  71.54 
 
 		 277 aa  299  4e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.891745  hitchhiker  0.000000908822 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1362  pyrroline-5-carboxylate reductase  67.42 
 
 		 272 aa  297  1e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.65645  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0881  pyrroline-5-carboxylate reductase  67.42 
 
 		 277 aa  277  1e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.120962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3106  pyrroline-5-carboxylate reductase  59.09 
 
 		 278 aa  267  1e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1743  pyrroline-5-carboxylate reductase  56 
 
 		 273 aa  265  8.999999999999999e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126409 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2514  pyrroline-5-carboxylate reductase  57.79 
 
 		 301 aa  264  1e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.332545 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1406  pyrroline-5-carboxylate reductase  57.58 
 
 		 266 aa  255  7e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.257606 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4171  pyrroline-5-carboxylate reductase  57.58 
 
 		 281 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4850  pyrroline-5-carboxylate reductase  58.33 
 
 		 277 aa  250  2e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1258  pyrroline-5-carboxylate reductase  55.35 
 
 		 276 aa  248  6e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00981476 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3882  pyrroline-5-carboxylate reductase  55.68 
 
 		 281 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1138  pyrroline-5-carboxylate reductase  58.78 
 
 		 273 aa  241  1e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268881 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3168  pyrroline-5-carboxylate reductase  52.83 
 
 		 273 aa  236  3e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.624032  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2249  pyrroline-5-carboxylate reductase  51.49 
 
 		 274 aa  230  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2538  pyrroline-5-carboxylate reductase  55.06 
 
 		 278 aa  229  5e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2265  pyrroline-5-carboxylate reductase  51.95 
 
 		 293 aa  219  3e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.739581 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2755  pyrroline-5-carboxylate reductase  51.69 
 
 		 275 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3281  pyrroline-5-carboxylate reductase  53.58 
 
 		 274 aa  219  5e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3018  pyrroline-5-carboxylate reductase  52.06 
 
 		 275 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0623  pyrroline-5-carboxylate reductase  48.29 
 
 		 271 aa  193  2e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.648438 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4871  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.12 
 
 		 268 aa  188  9e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.552368 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1323  pyrroline-5-carboxylate reductase  50.38 
 
 		 273 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.709486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3328  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.06 
 
 		 269 aa  182  4.0000000000000006e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.639937 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3963  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.02 
 
 		 280 aa  181  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.93073  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3009  pyrroline-5-carboxylate reductase  51.71 
 
 		 273 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.575876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0151  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.48 
 
 		 269 aa  178  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.779735  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0732  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.65 
 
 		 271 aa  177  2e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0782  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.65 
 
 		 271 aa  177  2e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1097  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.36 
 
 		 273 aa  171  7.999999999999999e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.616972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3364  pyrroline-5-carboxylate reductase  50.98 
 
 		 255 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2645  pyrroline-5-carboxylate reductase  51.14 
 
 		 273 aa  170  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4151  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.04 
 
 		 273 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05150  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.57 
 
 		 273 aa  165  8e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59347  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5095  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.98 
 
 		 272 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4968  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.98 
 
 		 272 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2920  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.28 
 
 		 275 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.495585  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0340  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.19 
 
 		 275 aa  163  2.0000000000000002e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5003  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.61 
 
 		 264 aa  160  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.102233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0476  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.33 
 
 		 272 aa  160  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3885  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.8 
 
 		 270 aa  161  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0846425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5320  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.7 
 
 		 272 aa  161  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2198  pyrroline-5-carboxylate reductase  50 
 
 		 267 aa  160  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00651972  normal  0.884064 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5145  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.26 
 
 		 272 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0677  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.24 
 
 		 260 aa  159  4e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0370  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.42 
 
 		 272 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0764  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.72 
 
 		 280 aa  157  1e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.253499 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2704  pyrroline-5-carboxylate reductase  49.17 
 
 		 270 aa  157  2e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5047  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.06 
 
 		 272 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.518044  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03070  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.61 
 
 		 272 aa  157  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0995956  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0929  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.35 
 
 		 273 aa  157  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1785  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.95 
 
 		 289 aa  156  3e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4472  pyrroline-5-carboxylate reductase  45.35 
 
 		 268 aa  157  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.432942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1142  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.09 
 
 		 269 aa  156  4e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2518  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.6 
 
 		 271 aa  155  6e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.554672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0493  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.96 
 
 		 273 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0716  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.15 
 
 		 271 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.796831  normal  0.766779 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3982  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.52 
 
 		 271 aa  153  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.401857 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1502  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.33 
 
 		 289 aa  152  5e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.829406 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5474  pyrroline-5-carboxylate reductase  44.65 
 
 		 273 aa  152  7e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1997  hypothetical protein  37.9 
 
 		 262 aa  150  2e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1992  hypothetical protein  36.53 
 
 		 262 aa  149  4e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3055  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.95 
 
 		 274 aa  149  4e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.145614  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1839  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.59 
 
 		 282 aa  149  5e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0610  pyrroline-5-carboxylate reductase  46.67 
 
 		 267 aa  149  5e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0436215 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0337  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.4 
 
 		 282 aa  149  5e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000202087  hitchhiker  0.00000000614659 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3093  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.16 
 
 		 273 aa  148  9e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0431736  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0165  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.98 
 
 		 277 aa  148  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000543414  hitchhiker  0.0000203969 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2708  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.8 
 
 		 264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.702325  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07387  Pyrroline-5-carboxylate reductase (EC 1.5.1.2) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96WX7]  37.41 
 
 		 283 aa  146  3e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2901  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.15 
 
 		 270 aa  147  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000081741  unclonable  0.000000152537 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0129  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.89 
 
 		 280 aa  145  6e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000153189  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3656  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.38 
 
 		 270 aa  145  7.0000000000000006e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.443187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0601  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.02 
 
 		 280 aa  145  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0177  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.23 
 
 		 277 aa  144  1e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0311023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1017  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.41 
 
 		 279 aa  144  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.275974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2260  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.81 
 
 		 293 aa  143  2e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.423593  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0045  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.98 
 
 		 286 aa  144  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.318936 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3300  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.86 
 
 		 270 aa  142  4e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.249402  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3334  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.86 
 
 		 270 aa  142  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3347  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.86 
 
 		 270 aa  142  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0535  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.93 
 
 		 277 aa  142  8e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2167  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.49 
 
 		 284 aa  141  9e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1154  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.3 
 
 		 272 aa  141  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3679  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.22 
 
 		 271 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0327  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.86 
 
 		 270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2597  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.86 
 
 		 270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.483806  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2410  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.86 
 
 		 270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1188  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.86 
 
 		 270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1383  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.18 
 
 		 263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0247  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.56 
 
 		 276 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0642346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2656  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.75 
 
 		 270 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0469003 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0646  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.54 
 
 		 270 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2757  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.57 
 
 		 274 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.447369  decreased coverage  0.0000025495 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1285  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.46 
 
 		 271 aa  139  3.9999999999999997e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5956  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.33 
 
 		 267 aa  139  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.377479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0620  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.54 
 
 		 270 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0761  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.21 
 
 		 292 aa  139  6e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>