219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1508 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1508  putative thioesterase  100 
 
 
153 aa  312  8e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0888126  normal  0.372254 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4741  thioesterase superfamily protein  69.74 
 
 
153 aa  219  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0117203  normal  0.418796 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4557  thioesterase superfamily protein  75.18 
 
 
145 aa  215  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.215777  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0931  thioesterase superfamily protein  74.47 
 
 
145 aa  214  4e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1413  thioesterase superfamily protein  74.47 
 
 
145 aa  214  4e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236272  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1391  thioesterase superfamily protein  74.47 
 
 
145 aa  214  5e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.243667 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2141  thioesterase superfamily protein  68.79 
 
 
164 aa  213  9.999999999999999e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000226869  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1293  thioesterase superfamily protein  73.05 
 
 
145 aa  211  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.263092  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1332  thioesterase superfamily protein  73.05 
 
 
145 aa  210  4.9999999999999996e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0269982  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2654  thioesterase family protein  72.86 
 
 
203 aa  209  1e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1670  thioesterase family protein  73.53 
 
 
149 aa  207  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.895942  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1824  thioesterase family protein  73.88 
 
 
181 aa  206  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.814646  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2493  thioesterase superfamily protein  72.14 
 
 
162 aa  206  1e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0808355  normal  0.025023 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1437  thioesterase family protein  73.88 
 
 
181 aa  206  1e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1202  thioesterase superfamily protein  68.42 
 
 
175 aa  205  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000375293  normal  0.571615 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0719  thioesterase family protein  73.88 
 
 
149 aa  205  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0443  thioesterase family protein  73.88 
 
 
149 aa  205  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1648  thioesterase family protein  73.88 
 
 
149 aa  205  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129475  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1367  thioesterase superfamily protein  71.43 
 
 
162 aa  204  3e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0000075245  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1902  thioesterase superfamily protein  73.76 
 
 
163 aa  204  3e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.119468 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1769  thioesterase superfamily protein  64 
 
 
147 aa  203  9e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201031  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1317  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  69.72 
 
 
149 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3086  thioesterase superfamily protein  68.06 
 
 
147 aa  198  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000791205  normal  0.0550819 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2066  thioesterase superfamily protein  73.28 
 
 
160 aa  198  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  hitchhiker  0.00365834 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2819  thioesterase superfamily protein  68.79 
 
 
149 aa  198  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.453856  normal  0.118463 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1614  thioesterase superfamily protein  65.56 
 
 
155 aa  196  1.0000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000153197  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1608  thioesterase superfamily protein  69.5 
 
 
150 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3308  thioesterase superfamily protein  72.39 
 
 
188 aa  195  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.362677  normal  0.831787 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1611  thioesterase superfamily protein  69.12 
 
 
147 aa  191  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525726  normal  0.904244 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1939  thioesterase superfamily protein  69.12 
 
 
147 aa  190  5e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158219  hitchhiker  0.00402541 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1678  thioesterase superfamily protein  67.61 
 
 
145 aa  186  9e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.71411 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0906  thioesterase family protein  78.07 
 
 
125 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.661315  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0966  thioesterase superfamily protein  64.79 
 
 
145 aa  181  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0382  thioesterase superfamily protein  63.43 
 
 
143 aa  178  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3395  thioesterase superfamily protein  62.68 
 
 
153 aa  177  4.999999999999999e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.435542  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3586  thioesterase superfamily protein  63.38 
 
 
153 aa  176  7e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2835  thioesterase superfamily protein  65.62 
 
 
142 aa  175  2e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3704  thioesterase superfamily protein  67.2 
 
 
153 aa  174  3e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1882  thioesterase superfamily protein  60.28 
 
 
144 aa  174  4e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1644  thioesterase superfamily protein  55 
 
 
148 aa  173  9.999999999999999e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0277  thioesterase superfamily protein  59.29 
 
 
143 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0872113 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5927  hypothetical protein  60.14 
 
 
147 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.266343  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3281  hypothetical protein  59.29 
 
 
150 aa  167  4e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.704366  normal  0.549682 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3262  putative thioesterase  60.42 
 
 
143 aa  167  5e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.849103  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68490  hypothetical protein  61.65 
 
 
147 aa  167  6e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.222508 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3994  thioesterase superfamily protein  59.72 
 
 
143 aa  165  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3106  thioesterase superfamily protein  62.4 
 
 
156 aa  163  6.9999999999999995e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346336  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37230  predicted thioesterase  56.25 
 
 
136 aa  161  3e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0929724 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6680  thioesterase  58.59 
 
 
142 aa  160  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0588358  normal  0.343275 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2340  thioesterase superfamily protein  56.43 
 
 
148 aa  160  9e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.280619  normal  0.0595669 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4906  thioesterase superfamily protein  59.7 
 
 
142 aa  160  9e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.825665  normal  0.173535 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5810  thioesterase superfamily protein  56.83 
 
 
143 aa  157  4e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1213  thioesterase superfamily protein  61.36 
 
 
150 aa  157  6e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00301171  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1026  thioesterase superfamily protein  57.89 
 
 
137 aa  154  6e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5015  thioesterase superfamily protein  58.59 
 
 
137 aa  153  7e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.168597  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0426  thioesterase superfamily protein  51.39 
 
 
155 aa  150  5e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3691  thioesterase superfamily protein  56.2 
 
 
150 aa  149  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2050  hypothetical protein  55.47 
 
 
150 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00110893  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4685  thioesterase superfamily protein  52.27 
 
 
138 aa  147  6e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0112  thioesterase superfamily protein  50.69 
 
 
147 aa  147  7e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0121  thioesterase superfamily protein  50.69 
 
 
147 aa  147  7e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.750457  normal  0.0163891 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0102  thioesterase superfamily protein  50.69 
 
 
147 aa  147  7e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.208156 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3146  thioesterase superfamily protein  52.55 
 
 
143 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.433869  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04031  thioesterase family protein domain protein  52.8 
 
 
145 aa  144  5e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10164  hypothetical protein  48.59 
 
 
151 aa  137  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3272  thioesterase superfamily protein  45.52 
 
 
149 aa  117  7.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.96014  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07356  thioesterase family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G16350)  34.38 
 
 
169 aa  102  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.374208 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4956  thioesterase superfamily protein  36.3 
 
 
146 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000294278 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1058  putative thioesterase  41.41 
 
 
151 aa  95.1  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0254  thioesterase superfamily protein  35.82 
 
 
146 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0152562 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0279  thioesterase superfamily protein  34.33 
 
 
146 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0269  thioesterase superfamily protein  35.07 
 
 
146 aa  90.5  8e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1238  thioesterase superfamily protein  26.14 
 
 
156 aa  80.1  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.546619  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1167  acyl-CoA thioesterase  25.49 
 
 
156 aa  78.6  0.00000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.862365 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2836  thioesterase superfamily protein  33.58 
 
 
146 aa  70.9  0.000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1657  thioesterase superfamily protein  31.67 
 
 
139 aa  67.4  0.00000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2261  thioesterase superfamily protein  27.33 
 
 
161 aa  67  0.00000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6106  hypothetical protein  31.88 
 
 
154 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.493617  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1937  thioesterase superfamily protein  30.58 
 
 
136 aa  65.5  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00538677  normal  0.170289 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1527  hypothetical protein  33.09 
 
 
149 aa  65.1  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70350  hypothetical protein  30.43 
 
 
154 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2800  thioesterase superfamily protein  31.34 
 
 
138 aa  63.9  0.0000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.562988 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1926  thioesterase superfamily protein  34.15 
 
 
136 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0092  hypothetical protein  28.69 
 
 
161 aa  63.5  0.0000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.190576  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0101  thioesterase superfamily protein  26.36 
 
 
161 aa  63.2  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2829  GCN5-related N-acetyltransferase  31.16 
 
 
288 aa  63.5  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.136919 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4381  thioesterase superfamily protein  30.15 
 
 
148 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0970291 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06649  thioesterase  31.65 
 
 
150 aa  62.4  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5175  thioesterase superfamily protein  30.89 
 
 
139 aa  62.4  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001138  predicted thioesterase  30.15 
 
 
150 aa  62.8  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5551  putative thioesterase  35.83 
 
 
154 aa  62  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.427628 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2619  thioesterase superfamily protein  37.07 
 
 
140 aa  61.2  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1210  thioesterase superfamily protein  32.54 
 
 
134 aa  61.2  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000686795  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01695  Predicted thioesterase  27.87 
 
 
137 aa  60.8  0.000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.431774  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3629  thioesterase superfamily protein  34.15 
 
 
147 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3415  GCN5-related N-acetyltransferase  32.35 
 
 
289 aa  60.5  0.000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.229891  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04892  putative thioesterase  34.96 
 
 
134 aa  60.5  0.000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3305  thioesterase superfamily protein  34.15 
 
 
147 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0073  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32.06 
 
 
144 aa  59.3  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3385  GCN5-related N-acetyltransferase  28.99 
 
 
287 aa  58.2  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00858508  normal  0.169871 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>