More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0285 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0285  NUDIX hydrolase  100 
 
 
164 aa  337  2.9999999999999998e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.1016 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2211  NUDIX hydrolase  53.7 
 
 
164 aa  192  2e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2834  NUDIX hydrolase  57.23 
 
 
169 aa  184  4e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0268  NUDIX hydrolase  55.56 
 
 
165 aa  182  1.0000000000000001e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.880251  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  45.62 
 
 
179 aa  135  2e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0185  hypothetical protein  40.99 
 
 
335 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.533354  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  44.94 
 
 
180 aa  125  3e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000047  ADP-ribose pyrophosphatase  41.72 
 
 
214 aa  123  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.911513  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1572  NUDIX hydrolase  46.88 
 
 
179 aa  122  2e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  43.4 
 
 
177 aa  122  2e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05669  ADP-ribose pyrophosphatase  39.88 
 
 
171 aa  121  4e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3464  NUDIX hydrolase  44.94 
 
 
190 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.36556  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  45.06 
 
 
281 aa  118  3e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2512  NUDIX hydrolase  41.77 
 
 
172 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.335914  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0237  NUDIX hydrolase  42.95 
 
 
183 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.373824  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06830  ADP-ribose pyrophosphatase  41.51 
 
 
176 aa  114  3.9999999999999997e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0705  MutT/nudix family protein  39.26 
 
 
185 aa  114  7.999999999999999e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1905  NUDIX hydrolase  40 
 
 
179 aa  113  8.999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000619655  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  42.68 
 
 
178 aa  114  8.999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03101  NUDIX hydrolase  39.51 
 
 
187 aa  113  8.999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03091  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 
187 aa  113  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0558584  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0414  NTP pyrophosphohydrolase  43.04 
 
 
171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.136585  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0288  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 
187 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.919876  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0597  NUDIX hydrolase  38.82 
 
 
184 aa  112  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2896  NUDIX hydrolase  38.22 
 
 
166 aa  112  3e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1440  NUDIX hydrolase  40.49 
 
 
183 aa  112  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  40.51 
 
 
178 aa  111  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0213  NUDIX hydrolase  43.84 
 
 
178 aa  112  3e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0378357  normal  0.391369 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1829  NUDIX hydrolase  40.12 
 
 
176 aa  112  3e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1466  NUDIX hydrolase  40.49 
 
 
183 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3049  NUDIX hydrolase  40.62 
 
 
182 aa  110  6e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0076  NUDIX hydrolase  42.07 
 
 
184 aa  110  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.655363 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1552  NUDIX hydrolase  39.24 
 
 
179 aa  110  9e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  41.51 
 
 
177 aa  109  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2263  NUDIX hydrolase  41.61 
 
 
186 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0362  NUDIX hydrolase  43.62 
 
 
186 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  38.99 
 
 
183 aa  108  5e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3624  NUDIX hydrolase  45.65 
 
 
173 aa  107  5e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2271  ADP-ribose pyrophosphatase  42.14 
 
 
183 aa  107  6e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3558  NUDIX hydrolase  45.65 
 
 
173 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4700  NUDIX hydrolase  39.02 
 
 
184 aa  106  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.478438  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0948  NUDIX hydrolase  40.49 
 
 
182 aa  105  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4204  mutT/nudix family protein  38.85 
 
 
179 aa  105  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.365752  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03661  NUDIX hydrolase  37.13 
 
 
186 aa  105  3e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03191  NUDIX hydrolase  36.81 
 
 
186 aa  104  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.798424  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0048  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 
173 aa  104  6e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.642128 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2429  NUDIX hydrolase  38.75 
 
 
182 aa  103  7e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0417103 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4004  mutT/nudix family protein  38.22 
 
 
179 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.731081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3837  ADP-ribose diphosphatase  38.22 
 
 
179 aa  102  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3851  ADP-ribose diphosphatase  38.22 
 
 
179 aa  102  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4118  mutT/nudix family protein  38.22 
 
 
179 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177311 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1033  mutT/nudix family protein  37.58 
 
 
179 aa  102  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.721154 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1652  NUDIX hydrolase  36.53 
 
 
186 aa  102  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.568517  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0212  NUDIX hydrolase  38.75 
 
 
186 aa  102  2e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.465676  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4316  mutT/nudix family protein  38.22 
 
 
179 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.875524  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  41.88 
 
 
180 aa  102  2e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 
177 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4227  mutT/nudix family protein  38.22 
 
 
179 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.057791  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0724  NUDIX hydrolase  33.76 
 
 
169 aa  101  5e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.983328  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1124  NUDIX hydrolase  38.12 
 
 
195 aa  101  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244763 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0232  hypothetical protein  39.38 
 
 
185 aa  100  6e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.714493 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4163  mutT/nudix family protein  37.58 
 
 
179 aa  100  9e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1753  NUDIX hydrolase  35.67 
 
 
180 aa  100  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3925  NUDIX hydrolase  37.58 
 
 
179 aa  100  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161416  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1673  NUDIX hydrolase  39.49 
 
 
175 aa  99.4  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542994 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2793  NUDIX hydrolase  37.58 
 
 
179 aa  99  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1048  NUDIX hydrolase  36.13 
 
 
184 aa  99.4  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3354  mutT/nudix family protein  48.89 
 
 
173 aa  98.6  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03121  NUDIX hydrolase  37.91 
 
 
189 aa  98.6  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0176  NUDIX hydrolase  44.78 
 
 
173 aa  98.6  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0982781  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0238  NUDIX hydrolase  41.48 
 
 
186 aa  98.6  4e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1754  NUDIX hydrolase  37.42 
 
 
175 aa  98.6  4e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0963  NUDIX hydrolase  37.74 
 
 
180 aa  97.8  6e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000383094  normal  0.278011 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25181  NUDIX hydrolase  36.65 
 
 
189 aa  97.4  8e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1886  NUDIX hydrolase  39.39 
 
 
172 aa  97.4  8e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.556059 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1716  NUDIX hydrolase  32.69 
 
 
171 aa  97.1  1e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0743315 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2826  pyrophosphohydrolase related protein  37.04 
 
 
192 aa  97.1  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1336  NUDIX hydrolase  37.65 
 
 
171 aa  95.9  2e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.723792 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2595  NUDIX hydrolase  36.94 
 
 
176 aa  95.5  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000152881  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2011  NUDIX hydrolase  33.96 
 
 
192 aa  93.6  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252009  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1024  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 
180 aa  93.6  1e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00585419  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  34.19 
 
 
182 aa  93.2  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2046  NUDIX hydrolase  37.66 
 
 
194 aa  92.8  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2794  NUDIX hydrolase  34.97 
 
 
181 aa  92.8  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1556  NUDIX hydrolase  33.12 
 
 
180 aa  93.2  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1587  NUDIX hydrolase  33.12 
 
 
180 aa  93.2  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.356936  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1927  NUDIX hydrolase  39.87 
 
 
184 aa  91.3  5e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00211801  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1429  NUDIX hydrolase  38.18 
 
 
176 aa  91.3  5e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.742876  normal  0.0486947 
 
 
-
 
NC_002936  DET0456  MutT/nudix family protein  36.02 
 
 
176 aa  90.1  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0404799  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2065  NUDIX family hydrolase  31.01 
 
 
176 aa  89.7  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.862102  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2078  NUDIX family hydrolase  35.58 
 
 
194 aa  89.4  2e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1026  NUDIX hydrolase  31.48 
 
 
183 aa  89.4  2e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1062  MutT/nudix family protein  33.75 
 
 
180 aa  88.2  4e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.20499  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_398  MutT/nudix, ADP-ribose pyrophosphatase  34.78 
 
 
176 aa  87.4  7e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.148699  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1912  NUDIX hydrolase  36.53 
 
 
201 aa  87.4  7e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255381  hitchhiker  0.000304952 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1537  MutT/nudix family protein  42.33 
 
 
184 aa  86.3  2e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.652785  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0518  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
167 aa  85.9  2e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.718335 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1779  adp-ribose pyrophosphatase  30.38 
 
 
176 aa  86.3  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0995  NUDIX hydrolase  43.09 
 
 
170 aa  86.3  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.575894  normal  0.946338 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0271  NUDIX hydrolase  35.15 
 
 
180 aa  85.5  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.443042  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>