More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0153 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0153  hypothetical protein  100 
 
 
156 aa  305  2.0000000000000002e-82  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0307047 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0404  hypothetical protein  62.09 
 
 
160 aa  170  5.999999999999999e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1308  hypothetical protein  55.71 
 
 
152 aa  144  5e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.296823  normal  0.0132705 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2411  hypothetical protein  50 
 
 
176 aa  127  6e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.19576 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1584  hypothetical protein  48.1 
 
 
162 aa  120  8e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0315966  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0569  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  45.95 
 
 
162 aa  119  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00359855  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1307  hypothetical protein  48.95 
 
 
148 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.120838  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2033  hypothetical protein  49.3 
 
 
154 aa  118  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_534  hypothetical protein  45.95 
 
 
162 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0594  hypothetical protein  45.95 
 
 
159 aa  113  7.999999999999999e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.797474  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1965  hypothetical protein  48.32 
 
 
148 aa  111  4.0000000000000004e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.31453  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0796  hypothetical protein  45.03 
 
 
155 aa  109  2.0000000000000002e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0411  hypothetical protein  46.62 
 
 
157 aa  107  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.556194 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0814  hypothetical protein  42.55 
 
 
146 aa  101  4e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.47066 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3727  hypothetical protein  44.44 
 
 
154 aa  95.9  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1012  hypothetical protein  43.31 
 
 
157 aa  95.5  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.535443  normal  0.791776 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4352  lysine decarboxylase family protein  47.66 
 
 
168 aa  95.1  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.383746  normal  0.682676 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1049  hypothetical protein  49.33 
 
 
158 aa  95.1  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.176364 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1975  hypothetical protein  41.67 
 
 
149 aa  92.4  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3844  hypothetical protein  49.35 
 
 
156 aa  88.2  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.991912  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0547  acyl-CoA synthetase  43.57 
 
 
199 aa  87.8  5e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0934  hypothetical protein  49.17 
 
 
184 aa  84.7  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2479  hypothetical protein  43.36 
 
 
158 aa  84.7  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1788  hypothetical protein  47.06 
 
 
170 aa  83.6  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0356  hypothetical protein  47.06 
 
 
181 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.329787  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1753  hypothetical protein  51.14 
 
 
171 aa  82.4  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2644  P450 cytochrome, putative  46.85 
 
 
163 aa  81.3  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3460  MCP1; molybdenum cofactor carrier protein  46.85 
 
 
163 aa  81.3  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1458  Rossmann fold nucleotide-binding protein  42.37 
 
 
165 aa  80.5  0.000000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1696  hypothetical protein  40.8 
 
 
171 aa  79  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.786228  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2145  Rossmann fold nucleotide-binding protein  42.19 
 
 
161 aa  79  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0512  hypothetical protein  50 
 
 
154 aa  77.8  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.602791  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4521  P450 cytochrome, putative  41.41 
 
 
165 aa  77  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.136581 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1030  Rossmann fold nucleotide-binding protein  40.48 
 
 
169 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4351  hypothetical protein  44.08 
 
 
156 aa  76.6  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4787  hypothetical protein  46.22 
 
 
184 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5377  hypothetical protein  46.22 
 
 
184 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5484  hypothetical protein  46.22 
 
 
184 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0351  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  47.97 
 
 
165 aa  75.1  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0109042 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0593  hypothetical protein  43.3 
 
 
174 aa  73.2  0.000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1549  P450 cytochrome, putative  43.86 
 
 
161 aa  73.2  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30378  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12514  hypothetical protein  40.57 
 
 
207 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.95195e-34  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0872  hypothetical protein  30.6 
 
 
239 aa  71.6  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.736442  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2912  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like  44.44 
 
 
165 aa  72  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2625  hypothetical protein  31.82 
 
 
239 aa  72  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.553648 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2231  hypothetical protein  31.82 
 
 
317 aa  70.9  0.000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0450  hypothetical protein  47.9 
 
 
181 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3656  hypothetical protein  32.5 
 
 
252 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.387963  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4494  hypothetical protein  32.5 
 
 
252 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.535293  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3871  hypothetical protein  32.5 
 
 
252 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20921  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4828  hypothetical protein  32.5 
 
 
252 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.203832  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0462  hypothetical protein  39.25 
 
 
166 aa  69.3  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2861  hypothetical protein  35.45 
 
 
241 aa  68.6  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.33158  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1689  hypothetical protein  33.64 
 
 
239 aa  68.2  0.00000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1818  hypothetical protein  47.06 
 
 
151 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132048  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2080  hypothetical protein  47.06 
 
 
170 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0604  decarboxylase family protein  31.67 
 
 
249 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.266669  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1107  hypothetical protein  47.06 
 
 
170 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0816  hypothetical protein  47.06 
 
 
170 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3768  hypothetical protein  31.67 
 
 
252 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00574254  hitchhiker  0.00551314 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0977  hypothetical protein  34.86 
 
 
268 aa  67.4  0.00000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.213763  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3242  hypothetical protein  31.67 
 
 
252 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0247899 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1555  hypothetical protein  33.94 
 
 
273 aa  67  0.00000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2043  hypothetical protein  30.91 
 
 
317 aa  67  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3379  hypothetical protein  36.7 
 
 
260 aa  67.4  0.00000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.063845 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2219  hypothetical protein  31.67 
 
 
252 aa  67  0.00000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2436  hypothetical protein  30.91 
 
 
317 aa  67  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.14401  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1695  decarboxylase family protein  30.83 
 
 
244 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.232557  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0318  decarboxylase family protein  30.83 
 
 
249 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0852  decarboxylase family protein  30.83 
 
 
249 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.134375  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2404  decarboxylase family protein  30.83 
 
 
244 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0352  decarboxylase family protein  30.83 
 
 
244 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2547  hypothetical protein  30.83 
 
 
244 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0928666  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1499  decarboxylase family protein  30.83 
 
 
244 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780956  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0875  hypothetical protein  35.78 
 
 
332 aa  65.9  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.237559 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1094  hypothetical protein  34.33 
 
 
279 aa  65.9  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.208202  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4084  hypothetical protein  37.17 
 
 
275 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3023  hypothetical protein  34.17 
 
 
248 aa  65.5  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.897661  normal  0.886093 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0918  hypothetical protein  40.19 
 
 
181 aa  65.1  0.0000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3662  hypothetical protein  33.94 
 
 
263 aa  65.1  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0914373  normal  0.810533 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1082  hypothetical protein  35.45 
 
 
225 aa  65.1  0.0000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.396045  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2835  hypothetical protein  30 
 
 
247 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4048  hypothetical protein  34.86 
 
 
266 aa  65.1  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6789  hypothetical protein  30 
 
 
218 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0818446  hitchhiker  0.00000113726 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1089  hypothetical protein  28.15 
 
 
247 aa  63.9  0.0000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3171  hypothetical protein  38.53 
 
 
260 aa  63.9  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.809527 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2925  hypothetical protein  40.16 
 
 
182 aa  63.9  0.0000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.221472  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4418  hypothetical protein  30 
 
 
247 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.52452  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3751  hypothetical protein  37.61 
 
 
283 aa  63.2  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0136365  normal  0.197215 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8428  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  33.03 
 
 
267 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676666  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1173  hypothetical protein  33.03 
 
 
266 aa  62.8  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0612248  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0357  hypothetical protein  35.96 
 
 
245 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.216985  normal  0.764349 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25950  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  34.86 
 
 
280 aa  62.4  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.256647  normal  0.891073 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3081  hypothetical protein  33.03 
 
 
243 aa  62.8  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000255019 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2835  hypothetical protein  31.19 
 
 
216 aa  62.4  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000181982  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3095  conserved hypothetical protein TIGR00730  33.64 
 
 
245 aa  62  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0359  hypothetical protein  30.89 
 
 
243 aa  62  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0930458 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2693  hypothetical protein  33.64 
 
 
239 aa  62  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.721192  hitchhiker  0.0000460605 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4300  hypothetical protein  32.09 
 
 
262 aa  61.6  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.336059  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1842  hypothetical protein  33.03 
 
 
289 aa  61.6  0.000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0573823  normal  0.171511 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>