More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Moth_1154 on replicon NC_007644
Organism: Moorella thermoacetica ATCC 39073



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007644  Moth_1154  DNA polymerase III, epsilon subunit  100 
 
 		 921 aa  1866    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1743  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.02 
 
 		 930 aa  600  1e-170  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23026  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3029  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  37.38 
 
 		 929 aa  564  1.0000000000000001e-159  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0562  DNA polymerase III, epsilon subunit  39 
 
 		 921 aa  556  1e-157  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1347  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  34.98 
 
 		 957 aa  541  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.579486 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1651  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  37.63 
 
 		 952 aa  516  1.0000000000000001e-145  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1003  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.51 
 
 		 960 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2156  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.53 
 
 		 934 aa  498  1e-139  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.814989  hitchhiker  0.00934468 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3224  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.54 
 
 		 927 aa  495  9.999999999999999e-139  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00101103  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1671  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  32.91 
 
 		 934 aa  491  1e-137  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.697043  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1709  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  33.01 
 
 		 934 aa  491  1e-137  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000649538  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1265  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  33.16 
 
 		 929 aa  488  1e-136  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00466144  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1899  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.48 
 
 		 956 aa  488  1e-136  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0589249 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3747  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  33.09 
 
 		 934 aa  485  1e-135  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.739451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1598  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  33.09 
 
 		 934 aa  485  1e-135  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00523268  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1545  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.35 
 
 		 944 aa  482  1e-134  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.676592  decreased coverage  0.000191845 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1452  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  32.84 
 
 		 934 aa  480  1e-134  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1424  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  32.62 
 
 		 934 aa  481  1e-134  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1425  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  32.91 
 
 		 934 aa  481  1e-134  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.446116  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1636  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  32.62 
 
 		 934 aa  481  1e-134  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00174148 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1565  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  32.84 
 
 		 934 aa  480  1e-134  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.554006  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1467  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  32.91 
 
 		 934 aa  480  1e-134  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533097  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2115  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  31.26 
 
 		 921 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0504  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  32.66 
 
 		 909 aa  422  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07920  helicase c2  33.86 
 
 		 822 aa  406  1e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3621  helicase c2  37.82 
 
 		 838 aa  396  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0363  ATP-dependent helicase DinG  35.79 
 
 		 840 aa  387  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.01237  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0023  Rad3-related DNA helicases  35.9 
 
 		 851 aa  389  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000466591  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3167  helicase c2  35.41 
 
 		 876 aa  383  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000644587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0509  helicase c2  37.18 
 
 		 843 aa  374  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4122  helicase c2  34.91 
 
 		 843 aa  370  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000977416  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3770  helicase c2  34.23 
 
 		 830 aa  369  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3854  helicase c2  34.51 
 
 		 830 aa  366  1e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000920192 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0024  helicase c2  31.61 
 
 		 846 aa  365  3e-99  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1942  helicase c2  29.96 
 
 		 832 aa  355  2e-96  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.357662  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0188  helicase c2  36.09 
 
 		 659 aa  353  5.9999999999999994e-96  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00148037  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1359  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.4 
 
 		 978 aa  352  3e-95  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.838712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6611  helicase c2  35.52 
 
 		 729 aa  350  6e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0933933 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1132  hypothetical protein  30.5 
 
 		 681 aa  342  2e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4478  helicase c2  35.9 
 
 		 633 aa  338  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.647625  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0411  helicase c2  34.12 
 
 		 646 aa  338  3.9999999999999995e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28440  exonuclease, DNA polymerase III, epsilon subunit family  29.39 
 
 		 986 aa  334  5e-90  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.32018  normal  0.0233138 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0897  helicase c2  35.12 
 
 		 647 aa  332  3e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2809  helicase c2  31.09 
 
 		 707 aa  331  4e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4634  helicase c2  33.43 
 
 		 674 aa  330  6e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1235  helicase c2  35.19 
 
 		 743 aa  330  7e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895293  normal  0.149585 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2524  helicase c2  34.46 
 
 		 755 aa  329  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00188741  decreased coverage  0.000000000263353 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1364  helicase c2  35.35 
 
 		 640 aa  329  1.0000000000000001e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3112  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.89 
 
 		 966 aa  329  1.0000000000000001e-88  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000116759  hitchhiker  0.000000000648685 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0820  helicase c2  34.78 
 
 		 650 aa  328  3e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.932295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1412  helicase c2  34.15 
 
 		 658 aa  328  3e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102914  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2527  helicase c2  34.56 
 
 		 653 aa  328  3e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0816709  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1612  putative ATP-dependent helicase  34.14 
 
 		 751 aa  327  5e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00100383  normal  0.548735 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4323  helicase c2  35.37 
 
 		 631 aa  327  9e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0709  helicase c2  34.48 
 
 		 650 aa  326  1e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.968194 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0997  helicase c2  34.15 
 
 		 643 aa  325  2e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.179863 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1342  helicase c2  34.29 
 
 		 754 aa  324  4e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6284  helicase c2  33.79 
 
 		 749 aa  324  4e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.27054  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1795  helicase c2  33.79 
 
 		 749 aa  324  4e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1106  helicase c2  31.64 
 
 		 636 aa  323  9.999999999999999e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.243566 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1991  ATP-dependent helicase, putative  34.47 
 
 		 645 aa  322  1.9999999999999998e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1626  ATP-dependent DNA helicase-related protein  34.55 
 
 		 713 aa  321  3.9999999999999996e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2207  putative ATP-dependent helicase  35.37 
 
 		 749 aa  321  5e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0911  putative ATP-dependent helicase  31.29 
 
 		 651 aa  319  2e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1575  putative ATP-dependent helicase  32.6 
 
 		 646 aa  318  3e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.718112  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004095  DinG family ATP-dependent helicase YoaA  31.8 
 
 		 646 aa  318  4e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2251  ATP-dependent helicase, putative  34.76 
 
 		 755 aa  317  5e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.247338  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1921  helicase c2  33.66 
 
 		 725 aa  317  8e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.782434  normal  0.028244 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1835  helicase c2  32.69 
 
 		 636 aa  317  9e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00837342  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01778  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  32.69 
 
 		 636 aa  315  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.548012  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1896  hypothetical protein  32.69 
 
 		 636 aa  315  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01766  hypothetical protein  32.69 
 
 		 636 aa  315  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.479225  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2535  hypothetical protein  32.69 
 
 		 636 aa  315  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.50615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1825  helicase c2  32.69 
 
 		 636 aa  315  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.979985  normal  0.491186 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2034  hypothetical protein  32.69 
 
 		 636 aa  315  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1380  hypothetical protein  32.69 
 
 		 636 aa  314  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.434814  normal  0.350106 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01374  ATP-dependent helicase  32.5 
 
 		 644 aa  314  5.999999999999999e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2677  helicase c2  32.84 
 
 		 646 aa  313  7.999999999999999e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.663694  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1859  helicase c2  32.64 
 
 		 674 aa  313  1e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.347581  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1990  ATP-dependent helicase DinG  30.19 
 
 		 709 aa  312  2e-83  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0081  putative ATP-dependent helicase  35.22 
 
 		 752 aa  312  2e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.892999  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1326  ATP-dependent helicase, putative  35.22 
 
 		 752 aa  312  2e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0729389  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2336  ATP-dependent helicase, putative  35.22 
 
 		 752 aa  312  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1965  hypothetical protein  32.99 
 
 		 636 aa  312  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1086  putative ATP-dependent helicase  35.22 
 
 		 752 aa  312  2e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00956322  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1961  hypothetical protein  32.99 
 
 		 636 aa  312  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.915388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1815  putative ATP-dependent helicase  35.22 
 
 		 752 aa  312  2e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2022  hypothetical protein  32.99 
 
 		 636 aa  312  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.6889  normal  0.891564 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2068  hypothetical protein  32.54 
 
 		 636 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1495  hypothetical protein  33.28 
 
 		 636 aa  311  4e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1310  hypothetical protein  32.99 
 
 		 636 aa  311  5e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.027986  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1197  helicase c2  34.22 
 
 		 661 aa  311  5e-83  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000973223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0636  helicase c2  33.48 
 
 		 660 aa  310  6.999999999999999e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1403  helicase c2  34.26 
 
 		 757 aa  310  6.999999999999999e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.127709  hitchhiker  0.000000348035 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01131  ATP-dependent helicase  32.16 
 
 		 639 aa  310  1.0000000000000001e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.625206  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1805  helicase c2  32.34 
 
 		 659 aa  310  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0648  helicase c2  30.84 
 
 		 668 aa  308  2.0000000000000002e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1779  helicase c2:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  34.47 
 
 		 641 aa  308  2.0000000000000002e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.66637 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1940  ATP-dependent helicase DinG  34.48 
 
 		 665 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.497186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2302  ATP-dependent helicase, DinG family protein  30.93 
 
 		 662 aa  309  2.0000000000000002e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.783815  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>