More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3162 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3162  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 397 aa  749    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1473  major facilitator transporter  68.28 
 
 		 389 aa  442  1e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3477  major facilitator transporter  63.24 
 
 		 405 aa  409  1e-113  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222248  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2415  major facilitator transporter  64.71 
 
 		 415 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0245324  normal  0.166892 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0970  major facilitator transporter  61.56 
 
 		 395 aa  404  1e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.586357 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3539  major facilitator superfamily MFS_1  63.48 
 
 		 415 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4137  major facilitator superfamily MFS_1  59.67 
 
 		 389 aa  366  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0405  transporter  58.22 
 
 		 403 aa  334  1e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.474552  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3219  major facilitator superfamily MFS_1  57.1 
 
 		 396 aa  334  1e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1108  major facilitator superfamily MFS_1  53.91 
 
 		 396 aa  331  1e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3939  major facilitator superfamily MFS_1  58.47 
 
 		 408 aa  324  2e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.798126  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2079  major facilitator transporter  49.49 
 
 		 399 aa  311  1e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.154057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2654  major facilitator superfamily MFS_1  48.11 
 
 		 399 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.400382  normal  0.458588 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1506  major facilitator transporter  47.91 
 
 		 404 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1462  major facilitator transporter  48.92 
 
 		 400 aa  300  2e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1536  major facilitator family transporter  48.73 
 
 		 429 aa  299  5e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1204  major facilitator family transporter  48.73 
 
 		 429 aa  299  5e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0572721  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3082  major facilitator family transporter  48.6 
 
 		 398 aa  298  1e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1408  major facilitator family transporter  48.6 
 
 		 398 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.74121  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1404  major facilitator family transporter  48.6 
 
 		 398 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0490  major facilitator family transporter  48.6 
 
 		 398 aa  298  1e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.252914  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0662  major facilitator family transporter  48.6 
 
 		 398 aa  298  1e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.633492  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4338  major facilitator transporter  50.66 
 
 		 399 aa  289  7e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1203  major facilitator transporter  49.48 
 
 		 399 aa  285  8e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.446653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0748  major facilitator transporter  49.23 
 
 		 399 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.251921  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1229  major facilitator transporter  49.23 
 
 		 399 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.35258  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2190  major facilitator transporter  43.09 
 
 		 394 aa  283  3.0000000000000004e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.637684  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1111  major facilitator transporter  49.87 
 
 		 399 aa  280  4e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1112  major facilitator transporter  49.34 
 
 		 399 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6027  major facilitator transporter  49.46 
 
 		 403 aa  273  3e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11639  normal  0.400144 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2837  major facilitator family transporter  48.09 
 
 		 398 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1477  major facilitator transporter  45.12 
 
 		 391 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.14668  hitchhiker  0.0000166249 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0024  major facilitator transporter  44.78 
 
 		 383 aa  263  4.999999999999999e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0151304 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1223  major facilitator transporter  40.37 
 
 		 393 aa  256  6e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7086  major facilitator transporter  42.22 
 
 		 390 aa  252  7e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5265  major facilitator superfamily MFS_1  46.52 
 
 		 394 aa  250  2e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5193  major facilitator superfamily MFS_1  46.13 
 
 		 394 aa  250  3e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.380622 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0257  major facilitator superfamily MFS_1  45.3 
 
 		 403 aa  247  2e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.209561  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7258  major facilitator superfamily MFS_1  47.53 
 
 		 407 aa  248  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173664  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1297  major facilitator superfamily MFS_1  43.14 
 
 		 410 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.807255 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4726  major facilitator transporter  46.13 
 
 		 394 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.445553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1860  major facilitator transporter  39.37 
 
 		 403 aa  244  1.9999999999999999e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000002484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2143  major facilitator transporter  47.65 
 
 		 402 aa  239  4e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1814  major facilitator superfamily MFS_1  46.81 
 
 		 402 aa  237  3e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00295222  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1738  major facilitator superfamily MFS_1  46.54 
 
 		 402 aa  235  8e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.567776  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0638  major facilitator superfamily MFS_1  42.86 
 
 		 387 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3729  major facilitator transporter  40.1 
 
 		 399 aa  233  6e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487409  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3334  major facilitator transporter  42.36 
 
 		 399 aa  232  1e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3455  major facilitator transporter  42.36 
 
 		 399 aa  231  1e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3197  major facilitator transporter  42.36 
 
 		 399 aa  232  1e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3304  major facilitator family transporter  43.44 
 
 		 398 aa  231  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4478  major facilitator transporter  43.18 
 
 		 407 aa  229  4e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.414241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4774  major facilitator superfamily MFS_1  47.35 
 
 		 389 aa  230  4e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0610  major facilitator transporter  39.59 
 
 		 399 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0971506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0160  major facilitator transporter  39.59 
 
 		 399 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1589  major facilitator transporter  41.42 
 
 		 395 aa  228  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.24766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0185  major facilitator transporter  45.18 
 
 		 410 aa  228  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.151586 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4954  major facilitator transporter  40.65 
 
 		 405 aa  226  4e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960972  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2743  major facilitator transporter  40.36 
 
 		 399 aa  226  6e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0608632  normal  0.943249 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3326  major facilitator superfamily MFS_1  42.12 
 
 		 406 aa  226  6e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0643  major facilitator transporter  39.84 
 
 		 385 aa  226  7e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0684  major facilitator family transporter  40.63 
 
 		 400 aa  225  1e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.837842  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0591  major facilitator family transporter  40.63 
 
 		 400 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3138  major facilitator transporter  42.66 
 
 		 398 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0153  major facilitator superfamily MFS_1  45.71 
 
 		 419 aa  224  2e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02536  predicted transporter  41.16 
 
 		 394 aa  223  3e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3925  major facilitator family transporter  41.16 
 
 		 394 aa  224  3e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.51646 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2817  major facilitator family transporter  41.16 
 
 		 394 aa  223  3e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1026  major facilitator transporter  41.16 
 
 		 394 aa  223  3e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.164339 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1982  major facilitator family transporter  40.63 
 
 		 400 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.21038  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3754  major facilitator transporter  40.7 
 
 		 407 aa  222  9e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.503769  normal  0.0279175 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5605  major facilitator transporter  39.89 
 
 		 405 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.919705 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7020  major facilitator transporter  39.42 
 
 		 405 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303658  normal  0.0738208 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1474  major facilitator transporter  39.42 
 
 		 405 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00116593  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6354  major facilitator transporter  39.42 
 
 		 405 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.623556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2964  major facilitator family transporter  40.9 
 
 		 394 aa  220  3e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5822  major facilitator transporter  39.89 
 
 		 405 aa  220  3e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2393  major facilitator superfamily drug efflux transporter  39.63 
 
 		 404 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.988182  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38000  MFS permease  40.16 
 
 		 401 aa  220  3.9999999999999997e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1438  major facilitator superfamily MFS_1  44.3 
 
 		 447 aa  219  7e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3482  major facilitator superfamily MFS_1  42.54 
 
 		 406 aa  219  7.999999999999999e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3161  major facilitator transporter  40.32 
 
 		 394 aa  218  1e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1224  MFS permease  36.01 
 
 		 415 aa  218  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1598  major facilitator transporter  43.08 
 
 		 403 aa  218  2e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.665811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2949  major facilitator transporter  46.26 
 
 		 405 aa  216  5e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.137006  normal  0.503548 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5392  major facilitator transporter  44.35 
 
 		 412 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0287626  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5469  major facilitator transporter  44.35 
 
 		 412 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414502  normal  0.121802 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2920  major facilitator superfamily MFS_1  40.43 
 
 		 389 aa  215  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4800  major facilitator transporter  44.63 
 
 		 412 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1909  major facilitator superfamily MFS_1  41.04 
 
 		 408 aa  214  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.765785  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0862  major facilitator superfamily MFS_1  43.79 
 
 		 399 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1704  major facilitator transporter  38.46 
 
 		 426 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136946  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2803  major facilitator family transporter  41.16 
 
 		 394 aa  212  1e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.188499  normal  0.0180883 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5762  major facilitator transporter  39.52 
 
 		 404 aa  212  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2036  major facilitator transporter  41.73 
 
 		 402 aa  211  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.296988  normal  0.627164 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5352  major facilitator transporter  45.45 
 
 		 410 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.660653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4811  major facilitator transporter  45.18 
 
 		 410 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.439865  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3309  major facilitator superfamily MFS_1  40.95 
 
 		 418 aa  210  3e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0894  major facilitator superfamily MFS_1  43.06 
 
 		 399 aa  209  6e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0703604  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3465  major facilitator superfamily MFS_1  38.16 
 
 		 389 aa  209  7e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0698654 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>