More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0001 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0001  chromosomal replication initiation protein  100 
 
 		 499 aa  993    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00640124  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0001  chromosomal replication initiation protein  79.02 
 
 		 501 aa  776    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0001  chromosomal replication initiation protein  90.64 
 
 		 494 aa  842    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.852723  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0002  chromosomal replication initiation protein  77.69 
 
 		 498 aa  753    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0002  chromosomal replication initiation protein  81.74 
 
 		 501 aa  770    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0002  chromosomal replication initiation protein  79.02 
 
 		 501 aa  776    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.536334 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0003  chromosomal replication initiation protein  64.02 
 
 		 510 aa  588  1e-167  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  unclonable  0.0000000244231  normal  0.247706 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0001  chromosomal replication initiation protein  63.33 
 
 		 475 aa  586  1e-166  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.216398 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0001  chromosomal replication initiation protein  63.24 
 
 		 473 aa  581  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0001  chromosomal replication initiation protein  62.53 
 
 		 472 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0001  chromosomal replication initiation protein  61.67 
 
 		 475 aa  577  1.0000000000000001e-163  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0001  chromosomal replication initiation protein  62.42 
 
 		 472 aa  569  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0001  chromosomal replication initiation protein  62.17 
 
 		 506 aa  570  1e-161  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0001  chromosomal replication initiation protein  62.24 
 
 		 475 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0001  chromosomal replication initiation protein  61.1 
 
 		 472 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.583954  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0001  chromosomal replication initiation protein  52.62 
 
 		 506 aa  503  1e-141  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0129481  hitchhiker  0.0000000143408 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0001  chromosomal replication initiation protein  48.05 
 
 		 479 aa  445  1.0000000000000001e-124  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0301114  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0001  chromosomal replication initiation protein  47.1 
 
 		 516 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.962631  hitchhiker  0.00495499 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0001  chromosomal replication initiation protein  48.19 
 
 		 516 aa  432  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0192779 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0391  chromosomal replication initiation protein  48.22 
 
 		 524 aa  429  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.246214  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0002  chromosomal replication initiation protein  49.48 
 
 		 481 aa  429  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0480088  hitchhiker  0.0000132312 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0003  chromosomal replication initiator protein DnaA  47.42 
 
 		 519 aa  418  9.999999999999999e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118183  unclonable  1.2245600000000001e-24 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0003  chromosomal replication initiation protein  44.95 
 
 		 520 aa  409  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.0000273847  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1279  chromosomal replication initiation protein  47.25 
 
 		 524 aa  411  1e-113  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000504678  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0001  chromosomal replication initiation protein  44.83 
 
 		 496 aa  395  1e-109  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00276825  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0001  chromosomal replication initiation protein  44.83 
 
 		 496 aa  396  1e-109  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.0000869739  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2833  chromosomal replication initiation protein  44.07 
 
 		 448 aa  397  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0001  chromosomal replication initiation protein  42.49 
 
 		 470 aa  386  1e-106  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0703594  normal  0.628106 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0002  chromosomal replication initiation protein  44.59 
 
 		 461 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.020385  hitchhiker  0.000000603983 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0001  chromosomal replication initiation protein  43.22 
 
 		 509 aa  381  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0270  chromosomal replication initiation protein  41.08 
 
 		 452 aa  372  1e-102  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.43885  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0809  chromosomal replication initiation protein  41.3 
 
 		 464 aa  373  1e-102  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.54082  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0011  chromosomal replication initiation protein  44.25 
 
 		 455 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3373  chromosomal replication initiation protein  42.53 
 
 		 460 aa  371  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1342  chromosomal replication initiation protein  44.25 
 
 		 455 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0001  chromosomal replication initiation protein  42.74 
 
 		 482 aa  367  1e-100  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.4 
 
 		 477 aa  363  5.0000000000000005e-99  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0001  chromosomal replication initiation protein  39.46 
 
 		 460 aa  362  7.0000000000000005e-99  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.335135  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0001  chromosomal replication initiation protein  40.29 
 
 		 477 aa  357  2.9999999999999997e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.839498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0259  chromosomal replication initiator protein DnaA  40.34 
 
 		 474 aa  344  2e-93  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.310271  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.76 
 
 		 482 aa  342  8e-93  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000460391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0001  chromosomal replication initiation protein  40 
 
 		 475 aa  340  2.9999999999999998e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0001  chromosomal replication initiation protein  42.98 
 
 		 498 aa  330  4e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0001  chromosomal replication initiation protein  34.59 
 
 		 446 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0001  chromosomal replication initiation protein  34.59 
 
 		 446 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000244098  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0001  chromosomal replication initiation protein  34.59 
 
 		 446 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000163866  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0001  chromosomal replication initiation protein  34.59 
 
 		 446 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000459109  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0001  chromosomal replication initiation protein  34.59 
 
 		 446 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000425777  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0001  chromosomal replication initiation protein  34.17 
 
 		 446 aa  312  1e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000594007  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0001  chromosomal replication initiation protein  34.17 
 
 		 446 aa  312  1e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.19 
 
 		 453 aa  311  2e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000208022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0001  chromosomal replication initiation protein  34.38 
 
 		 446 aa  311  2e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000585905  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5319  chromosomal replication initiation protein  34.23 
 
 		 446 aa  307  3e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.679479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0001  chromosomal replication initiation protein  36.02 
 
 		 453 aa  306  6e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.101414  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0001  chromosomal replication initiation protein  36.02 
 
 		 453 aa  306  6e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000795473  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0001  chromosomal replication initiation protein  34.45 
 
 		 446 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000325337  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0001  chromosomal replication initiation protein  37.5 
 
 		 452 aa  304  2.0000000000000002e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0001  chromosomal replication initiation protein  37.5 
 
 		 452 aa  304  2.0000000000000002e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2507  chromosomal replication initiation protein  38.57 
 
 		 472 aa  304  2.0000000000000002e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251721  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4153  chromosomal replication initiation protein  38.36 
 
 		 462 aa  305  2.0000000000000002e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  7.6269e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4177  chromosomal replication initiation protein  38.36 
 
 		 462 aa  305  2.0000000000000002e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510804  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0001  chromosomal replication initiation protein  38.82 
 
 		 451 aa  304  2.0000000000000002e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.000000764641  normal  0.435321 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4123  chromosomal replication initiation protein  38.88 
 
 		 466 aa  303  5.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00889574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4050  chromosomal replication initiation protein  38.88 
 
 		 466 aa  303  5.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0553543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4172  chromosomal replication initiation protein  38.88 
 
 		 466 aa  303  5.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.049293  normal  0.324603 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0001  chromosomal replication initiation protein  38.29 
 
 		 462 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000281438  unclonable  0.0000000118337 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4066  chromosomal replication initiation protein  38.88 
 
 		 466 aa  303  5.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000844177  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0001  chromosomal replication initiation protein  39.71 
 
 		 455 aa  303  6.000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.632445  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0001  chromosomal replication initiation protein  34.03 
 
 		 450 aa  303  6.000000000000001e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000447845  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0032  chromosomal replication initiation protein  38.45 
 
 		 463 aa  302  7.000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000217775  normal  0.251102 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0001  chromosomal replication initiation protein  33.82 
 
 		 446 aa  302  1e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.562714  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4230  chromosomal replication initiation protein  38.67 
 
 		 466 aa  302  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00725647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4223  chromosomal replication initiation protein  37.92 
 
 		 467 aa  301  1e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000066194  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03585  chromosomal replication initiation protein  37.92 
 
 		 467 aa  301  2e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0183504  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  37.92 
 
 		 467 aa  301  2e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000136922  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0001  chromosomal replication initiation protein  37.47 
 
 		 462 aa  301  2e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000998931  unclonable  0.00000000000343779 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3033  chromosomal replication initiator protein DnaA  37.89 
 
 		 442 aa  301  2e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.949168  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4067  chromosomal replication initiation protein  37.92 
 
 		 467 aa  301  2e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000102031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0001  chromosomal replication initiation protein  37.92 
 
 		 467 aa  301  2e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000185056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3915  chromosomal replication initiation protein  37.92 
 
 		 467 aa  301  2e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000126813  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0001  chromosomal replication initiation protein  37.47 
 
 		 462 aa  301  2e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000562887  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0001  chromosomal replication initiation protein  33.61 
 
 		 450 aa  301  2e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0001  chromosomal replication initiation protein  37.47 
 
 		 462 aa  301  2e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000157699  unclonable  0.0000121376 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00010  chromosomal replication initiation protein  37.92 
 
 		 478 aa  301  2e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.499294  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4212  chromosomal replication initiation protein  37.92 
 
 		 467 aa  301  2e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000201887  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0001  chromosomal replication initiation protein  38.19 
 
 		 459 aa  301  2e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000781636  unclonable  0.00000344978 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03529  hypothetical protein  37.92 
 
 		 467 aa  301  2e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00951486  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0001  chromosomal replication initiation protein  37.47 
 
 		 462 aa  301  2e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000257358  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0001  chromosomal replication initiation protein  34.53 
 
 		 457 aa  301  3e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000458864  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0001  chromosomal replication initiation protein  34.75 
 
 		 457 aa  300  3e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000597417  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  36.73 
 
 		 449 aa  300  4e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141272  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0001  chromosomal replication initiation protein  37.55 
 
 		 462 aa  300  5e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000211976  n/a   
 
 
 
NC_012912  Dd1591_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  38.62 
 
 		 464 aa  300  5e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00240104  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0001  chromosomal replication initiation protein  37.34 
 
 		 461 aa  299  6e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000102323  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0001  chromosomal replication initiation protein  37.37 
 
 		 452 aa  299  7e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98376e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0001  initiation of chromosome replication  34.38 
 
 		 436 aa  299  7e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0008  chromosomal replication initiation protein  38.03 
 
 		 460 aa  299  9e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0001  chromosomal replication initiation protein  38.46 
 
 		 465 aa  299  9e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00156244  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  38.16 
 
 		 462 aa  298  1e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.138659  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0001  chromosomal replication initiation protein  34.54 
 
 		 459 aa  298  1e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000386226  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>