More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0101 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0101  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 
205 aa  404  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.11084  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1545  amino acid transporter LysE  53.17 
 
 
204 aa  222  3e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1199  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  54.41 
 
 
203 aa  221  7e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1052  lysine exporter protein LysE/YggA  53.17 
 
 
203 aa  216  2e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0086  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  53.66 
 
 
204 aa  215  2.9999999999999998e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0680  amino acid transporter LysE  52.68 
 
 
207 aa  214  5e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.199989  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0187  amino-acid exporter protein  51.98 
 
 
204 aa  211  4.9999999999999996e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.452684  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0128  lysine exporter protein LysE/YggA  51.47 
 
 
203 aa  210  1e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0172  lysine exporter protein LysE/YggA  49.02 
 
 
203 aa  210  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.253668  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0387  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  50 
 
 
203 aa  207  7e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.45744 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2775  lysine exporter protein LysE/YggA  52.45 
 
 
205 aa  206  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2485  lysine exporter protein LysE/YggA  50.98 
 
 
204 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.238287  normal  0.209 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0887  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  52.68 
 
 
205 aa  205  4e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2195  lysine exporter protein LysE/YggA  51.96 
 
 
220 aa  201  5e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.431062 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4190  Rht family transporter amino acid efflux protein  52.08 
 
 
203 aa  197  7e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.107717  normal  0.194107 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2570  lysine exporter protein LysE/YggA  50.53 
 
 
205 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00200022  unclonable  0.0000000406824 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2814  lysine exporter protein LysE/YggA  52.2 
 
 
204 aa  195  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0715917  normal  0.713554 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3213  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  51.71 
 
 
204 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0505  lysine exporter protein LysE/YggA  51.98 
 
 
210 aa  189  2e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1790  lysine exporter protein  47.26 
 
 
202 aa  186  2e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.217291  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0041  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.46 
 
 
203 aa  160  1e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.31 
 
 
208 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2583  hypothetical protein  35.5 
 
 
208 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.258371  normal  0.140618 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1665  RhtB family transporter  45 
 
 
202 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0298  lysine exporter protein LysE/YggA  45 
 
 
202 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0024  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.43 
 
 
208 aa  124  7e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0364  lysine exporter protein LysE/YggA  36.87 
 
 
203 aa  124  7e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1992  lysine exporter protein LysE/YggA  36.82 
 
 
206 aa  124  8.000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0798  lysine exporter protein LysE/YggA  37.31 
 
 
206 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0300  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.5 
 
 
206 aa  118  6e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1611  lysine exporter protein LysE/YggA  33.83 
 
 
207 aa  118  7e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0311017  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0273  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.68 
 
 
205 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1160  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36 
 
 
207 aa  115  5e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000397574  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0823  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.04 
 
 
208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000549104  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  34.16 
 
 
211 aa  112  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  34.16 
 
 
211 aa  112  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0905  hypothetical protein  35.38 
 
 
208 aa  112  3e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.772442  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  34.16 
 
 
211 aa  112  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  34.16 
 
 
211 aa  112  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0334  lysine exporter protein LysE/YggA  34.83 
 
 
204 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  34.16 
 
 
211 aa  111  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  34.16 
 
 
211 aa  111  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0589  LysE family translocator protein  34.48 
 
 
204 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.327685  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0774  LysE type translocator  34.48 
 
 
204 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0073  transporter transmembrane protein  34.15 
 
 
215 aa  111  9e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163554  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0153  LysE family translocator protein  34.16 
 
 
211 aa  111  9e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0605  LysE family translocator protein  33.99 
 
 
204 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6113  lysine exporter protein LysE/YggA  33.99 
 
 
204 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.588565  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1147  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.5 
 
 
208 aa  109  3e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0532  lysine exporter protein LysE/YggA  33.5 
 
 
204 aa  109  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.101376  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0494  LysE family protein  34.48 
 
 
204 aa  109  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.515429  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2169  lysine exporter protein LysE/YggA  33.99 
 
 
227 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2783  lysine exporter protein LysE/YggA  33.99 
 
 
204 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407704  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3931  amino acid transporter LysE  34.48 
 
 
213 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2794  lysine exporter protein LysE/YggA  33.99 
 
 
204 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.31715 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1191  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.17 
 
 
211 aa  108  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217594  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3099  LysE family protein  33.99 
 
 
194 aa  108  5e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1522  LysE family protein  33.99 
 
 
194 aa  108  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2950  LysE family protein  33.99 
 
 
194 aa  108  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0068  LysE family protein  33.99 
 
 
194 aa  108  5e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0244  homoserine/homoserine lactone efflux protein  35.5 
 
 
206 aa  108  8.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.347313  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1045  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.5 
 
 
211 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2843  lysine exporter protein LysE/YggA  33.5 
 
 
204 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3353  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.37 
 
 
218 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.37 
 
 
218 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0023  lysine exporter protein LysE/YggA  34.01 
 
 
209 aa  107  1e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2701  lysine exporter protein LysE/YggA  33.5 
 
 
204 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.224581 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3105  lysine exporter protein LysE/YggA  36.32 
 
 
207 aa  107  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1363  LysE family translocator protein  33.66 
 
 
213 aa  106  2e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.640513  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4114  amino acid efflux pump, RhtB family protein  35.82 
 
 
204 aa  105  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1108  lysine exporter protein LysE/YggA  36.63 
 
 
207 aa  105  6e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.150394  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0836  lysine exporter protein LysE/YggA  35.44 
 
 
207 aa  105  7e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1001  lysine exporter protein LysE/YggA  34.68 
 
 
206 aa  104  9e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.953537  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0867  lysine exporter protein LysE/YggA  36.65 
 
 
207 aa  104  9e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.627781  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3092  lysine exporter protein LysE/YggA  39.31 
 
 
208 aa  103  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0606278  hitchhiker  0.00000000000145641 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1442  lysine exporter protein LysE/YggA  35.47 
 
 
217 aa  104  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.754857 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1808  lysine exporter protein LysE/YggA  35.82 
 
 
207 aa  103  2e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.702237  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2059  LysE family amino acid efflux protein  34.62 
 
 
217 aa  103  2e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.513091  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0418  transport transmembrane protein  37.5 
 
 
206 aa  102  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.475588  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4686  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.92 
 
 
216 aa  102  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0784  amino acid efflux/transport protein  35.44 
 
 
208 aa  102  4e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0130  LysE family protein  34.16 
 
 
211 aa  102  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2384  homoserine/homoserine lactone efflux protein  33.66 
 
 
205 aa  102  5e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6476  lysine exporter protein LysE/YggA  33.66 
 
 
211 aa  101  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.772782 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0604  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.33 
 
 
204 aa  101  8e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0141585 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3122  lysine exporter protein LysE/YggA  34.8 
 
 
213 aa  101  9e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.188461 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2025  lysine exporter protein LysE/YggA  33.82 
 
 
208 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.464731  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3964  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.22 
 
 
209 aa  100  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2300  lysine exporter protein LysE/YggA  33.82 
 
 
208 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.735083  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2313  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.82 
 
 
208 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00564099  hitchhiker  0.00590082 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2073  lysine exporter protein LysE/YggA  33.82 
 
 
208 aa  99.8  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106619  normal  0.299626 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0914  amino acid efflux protein, putative  33.98 
 
 
209 aa  99.4  3e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.996112 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2383  lysine exporter protein LysE/YggA  33.17 
 
 
217 aa  99.4  3e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77882  normal  0.612853 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003307  putative threonine efflux protein  32.86 
 
 
208 aa  99.4  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0929  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.78 
 
 
209 aa  99.4  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4152  homoserine/homoserine lactone efflux protein  35.08 
 
 
206 aa  99  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000943916  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0038  lysine exporter protein LysE/YggA  31.19 
 
 
211 aa  99  4e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2862  lysine exporter protein LysE/YggA  31.16 
 
 
213 aa  99  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2136  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.78 
 
 
212 aa  98.6  6e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2925  amino acid transporter LysE  32.5 
 
 
209 aa  98.2  7e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0920317  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>