More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3214 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3214  putative signal transduction protein  100 
 
 
293 aa  601  1.0000000000000001e-171  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1986  metal dependent phosphohydrolase  37.02 
 
 
280 aa  158  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0536621  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1978  HDIG  30.6 
 
 
280 aa  137  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.663445 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0779  metal dependent phosphohydrolase  28.74 
 
 
297 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  31.25 
 
 
397 aa  120  3e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0156  metal dependent phosphohydrolase  28.46 
 
 
412 aa  119  7e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.494474  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3011  metal dependent phosphohydrolase  34.31 
 
 
378 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0903  putative signal transduction protein  40.23 
 
 
369 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00178827  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2816  metal dependent phosphohydrolase  28.3 
 
 
297 aa  113  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  29.51 
 
 
280 aa  114  3e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1583  putative signal transduction protein  32.51 
 
 
279 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.23287  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0035  metal dependent phosphohydrolase  32.48 
 
 
298 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2576  HD domain-containing protein  30.36 
 
 
287 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0944  metal dependent phosphohydrolase  27.51 
 
 
284 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0690  metal dependent phosphohydrolase  33.62 
 
 
544 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.218536 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2081  metal dependent phosphohydrolase  32.71 
 
 
285 aa  110  3e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0631434 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1981  metal dependent phosphohydrolase  30.95 
 
 
280 aa  109  5e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2063  HD domain-containing protein  26.67 
 
 
284 aa  109  6e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.126544  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2242  metal dependent phosphohydrolase  32.54 
 
 
291 aa  109  6e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0643  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 
425 aa  107  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3231  putative signal transduction protein  34.45 
 
 
352 aa  107  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4147  putative signal transduction protein  30 
 
 
274 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0515  metal dependent phosphohydrolase  27.73 
 
 
282 aa  107  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000329454  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4280  putative signal transduction protein  30 
 
 
274 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0660971 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0187  putative signal transduction protein  30 
 
 
274 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3446  metal dependent phosphohydrolase  30.73 
 
 
289 aa  106  5e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0188  putative signal transduction protein  29.6 
 
 
274 aa  106  5e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1846  metal dependent phosphohydrolase  26.6 
 
 
283 aa  105  9e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0879  metal dependent phosphohydrolase  25.12 
 
 
298 aa  105  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1312  metal dependent phosphohydrolase  27.78 
 
 
284 aa  105  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0368639  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1873  putative signal transduction protein  31.16 
 
 
415 aa  104  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.747115  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  28.71 
 
 
283 aa  103  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1197  putative signal transduction protein  27.97 
 
 
351 aa  103  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.408421  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3956  putative signal transduction protein  30.43 
 
 
274 aa  103  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4563  hypothetical protein  30.43 
 
 
274 aa  103  4e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0663  metal dependent phosphohydrolase  31.28 
 
 
286 aa  103  4e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0667  metal dependent phosphohydrolase  27.68 
 
 
297 aa  102  5e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0639089  normal  0.446665 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3758  putative signal transduction protein  30.43 
 
 
274 aa  103  5e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3831  putative signal transduction protein  30.43 
 
 
274 aa  103  5e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0464  metal dependent phosphohydrolase  27.78 
 
 
284 aa  102  7e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3501  hypothetical protein  32.06 
 
 
274 aa  102  8e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000151947  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  29.57 
 
 
283 aa  102  8e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4028  metal dependent phosphohydrolase  27.57 
 
 
299 aa  102  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000178316 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2455  metal dependent phosphohydrolase  31.58 
 
 
455 aa  102  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0476  putative signal transduction protein  30.17 
 
 
274 aa  101  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16695  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  28.34 
 
 
284 aa  101  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885116  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3944  metal dependent phosphohydrolase  27.57 
 
 
299 aa  100  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3268  metal dependent phosphohydrolase  28.04 
 
 
297 aa  100  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.927802  hitchhiker  0.0000364844 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1161  metal dependent phosphohydrolase  29.15 
 
 
280 aa  100  3e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.663858  normal  0.172045 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3755  putative signal transduction protein  31.4 
 
 
275 aa  100  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.904282  normal  0.117296 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3455  putative signal transduction protein  31.4 
 
 
274 aa  99.8  5e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3373  diguanylate cyclase  27.54 
 
 
505 aa  99.4  6e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0281  metal dependent phosphohydrolase  26.39 
 
 
284 aa  99.4  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00372927  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4422  metal dependent phosphohydrolase  26.37 
 
 
300 aa  99.4  7e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2652  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  32.08 
 
 
412 aa  99  9e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.5401  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2296  HD domain-containing protein  26.85 
 
 
304 aa  98.2  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.569971  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1497  metal dependent phosphohydrolase  28.63 
 
 
285 aa  98.6  1e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0904  HD domain-containing protein  30.06 
 
 
289 aa  97.8  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0769  metal dependent phosphohydrolase  28.93 
 
 
279 aa  97.8  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0888114 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0073  metal dependent phosphohydrolase  28.22 
 
 
292 aa  97.4  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0283  putative signal transduction protein  30.73 
 
 
277 aa  97.1  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  27.18 
 
 
282 aa  96.3  6e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0168  metal dependent phosphohydrolase  27.98 
 
 
407 aa  95.9  7e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0812  metal dependent phosphohydrolase  31.21 
 
 
291 aa  95.5  8e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0073  metal dependent phosphohydrolase  28.81 
 
 
285 aa  95.5  9e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3449  metal dependent phosphohydrolase  31.21 
 
 
291 aa  95.5  9e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000269119 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1690  putative signal transduction protein  25.26 
 
 
305 aa  94.4  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2448  HDIG domain-containing protein  29.95 
 
 
287 aa  94  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3744  sensor histidine kinase  31.25 
 
 
718 aa  94.4  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.297445 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1400  putative signal transduction protein  32.11 
 
 
373 aa  94.4  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0670  metal dependent phosphohydrolase  30.35 
 
 
287 aa  94.7  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0674014  normal  0.44823 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1873  diguanylate cyclase  29.51 
 
 
509 aa  93.6  3e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.41222  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3014  HD domain-containing protein  25.79 
 
 
302 aa  93.2  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0100  hypothetical protein  26.32 
 
 
290 aa  93.6  4e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0254877  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1202  signal transduction protein  31.92 
 
 
292 aa  93.2  5e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.203689  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0651  metal dependent phosphohydrolase  28.71 
 
 
280 aa  92.4  7e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1771  metal dependent phosphohydrolase  24.68 
 
 
297 aa  92.4  8e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0294  HD domain-containing protein  27.54 
 
 
303 aa  91.7  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0824041  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2716  putative signal transduction protein  28.77 
 
 
302 aa  91.7  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.484408  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3068  metal dependent phosphohydrolase  30.98 
 
 
397 aa  90.5  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.896972  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1469  putative signal transduction protein  33.52 
 
 
258 aa  89.7  5e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2482  putative signal transduction protein  31.88 
 
 
292 aa  89  8e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3076  metal dependent phosphohydrolase  30.37 
 
 
408 aa  89  9e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2368  putative signal transduction protein  32.4 
 
 
403 aa  88.2  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.374822  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04660  hypothetical protein  30.81 
 
 
274 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1787  HDIG  28.91 
 
 
279 aa  87.8  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0449  hypothetical protein  30.81 
 
 
292 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1270  metal dependent phosphohydrolase  29.17 
 
 
279 aa  87  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0532  hypothetical protein  28.23 
 
 
274 aa  87.4  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2435  putative signal transduction protein  27.17 
 
 
438 aa  86.7  5e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5352  signal transduction protein  30 
 
 
288 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.194147  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5126  putative signal transduction protein  31.25 
 
 
256 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5176  putative signal transduction protein  32.96 
 
 
290 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1135  metal dependent phosphohydrolase  29.69 
 
 
340 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0403  metal dependent phosphohydrolase  30.21 
 
 
290 aa  85.1  0.000000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1203  response regulator  28.93 
 
 
634 aa  84.3  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5000  putative signal transduction protein  32.96 
 
 
290 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.415832  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2486  histidine kinase  29.67 
 
 
716 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1225  GGDEF domain-containing protein  31.03 
 
 
517 aa  83.6  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.489016  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2242  putative signal transduction protein  29.2 
 
 
358 aa  84  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.667665 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>