More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1416 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1416  rod shape-determining protein RodA  100 
 
 		 384 aa  749    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0472  rod shape-determining protein RodA  47.25 
 
 		 373 aa  329  5.0000000000000004e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000647199  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2483  rod shape-determining protein RodA  48.34 
 
 		 382 aa  322  7e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113844 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2589  rod shape-determining protein RodA  47.25 
 
 		 368 aa  309  5.9999999999999995e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.319193 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1328  rod shape-determining protein rodA  44.56 
 
 		 372 aa  303  3.0000000000000004e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0994  rod shape-determining protein RodA  44.2 
 
 		 367 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228896  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0990  rod shape-determining protein RodA  44.32 
 
 		 367 aa  302  6.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109624  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1055  rod shape-determining protein RodA  44.32 
 
 		 367 aa  302  6.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000470795  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1546  rod shape-determining protein RodA  47.97 
 
 		 381 aa  301  2e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.317218  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3486  rod shape-determining protein RodA  44.99 
 
 		 368 aa  300  3e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107855  hitchhiker  0.00000000162732 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2870  rod shape-determining protein RodA  44.35 
 
 		 368 aa  300  4e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000228961  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1325  rod shape-determining protein rodA  46.29 
 
 		 372 aa  299  5e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3709  rod shape-determining protein RodA  45.77 
 
 		 368 aa  299  5e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00326456  hitchhiker  0.000393205 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3454  rod shape-determining protein RodA  45.51 
 
 		 368 aa  298  7e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0032814  hitchhiker  0.00311192 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1091  rod shape-determining protein RodA  45.51 
 
 		 368 aa  298  8e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00567468  hitchhiker  0.000000470166 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3318  rod shape-determining protein RodA  45.51 
 
 		 368 aa  298  8e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000382573  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3276  rod shape-determining protein RodA  45.51 
 
 		 368 aa  298  8e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000878779  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1167  rod shape-determining protein RodA  45.22 
 
 		 372 aa  297  2e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1559  rod shape-determining protein RodA  44.32 
 
 		 374 aa  297  2e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0999879  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0984  rod shape-determining protein RodA  44.48 
 
 		 373 aa  296  3e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.709964  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01216  hypothetical protein  44.73 
 
 		 373 aa  297  3e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1973  rod shape-determining protein RodA  48.51 
 
 		 372 aa  296  4e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004223  rod shape-determining protein RodA  44.9 
 
 		 373 aa  293  5e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000217373  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2936  rod shape-determining protein RodA  45.88 
 
 		 368 aa  292  5e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888464  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1045  rod shape-determining membrane protein; sensitivity to radiation and drugs  46.67 
 
 		 365 aa  292  5e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3150  rod shape-determining protein RodA  46.06 
 
 		 368 aa  292  8e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000182729  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1714  rod shape-determining protein RodA  46.39 
 
 		 371 aa  291  1e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.991825  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1634  rod shape-determining protein RodA  45.16 
 
 		 376 aa  291  1e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000283195  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0591  rod shape-determining protein MreD  44.8 
 
 		 379 aa  291  1e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1134  rod shape-determining protein RodA  45.24 
 
 		 366 aa  290  4e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.536387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0698  rod shape-determining protein RodA  45.01 
 
 		 373 aa  290  4e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0484762  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0320  rod shape-determining protein  44.32 
 
 		 371 aa  289  5.0000000000000004e-77  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0047182  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1169  cell wall shape-determining protein  47.18 
 
 		 370 aa  289  5.0000000000000004e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.25541  normal  0.27842 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2857  rod shape-determining protein RodA  44.35 
 
 		 366 aa  289  7e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0659  rod shape-determining protein RodA  44.72 
 
 		 386 aa  289  7e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.782988  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0579  rod shape-determining protein RodA  43.97 
 
 		 384 aa  288  1e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0112947  hitchhiker  0.000000000000132704 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1180  cell wall shape-determining protein  45.33 
 
 		 370 aa  288  1e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0230726  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2495  rod shape-determining protein RodA  45.95 
 
 		 364 aa  288  2e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0854  rod shape-determining protein RodA  45.29 
 
 		 368 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000511765  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2847  rod shape-determining protein RodA  45.81 
 
 		 373 aa  286  5e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0258119  hitchhiker  0.000000158658 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0654  cell wall shape-determining protein  45.84 
 
 		 370 aa  286  5e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00038599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1009  rod shape-determining protein RodA  48 
 
 		 376 aa  285  9e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0799  cell wall shape-determining protein  45.58 
 
 		 370 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0574935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0695  cell wall shape-determining protein  45.58 
 
 		 370 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0264  rod shape-determining protein RodA  46.78 
 
 		 366 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.068566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0741  cell wall shape-determining protein  45.58 
 
 		 370 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.175825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0755  cell wall shape-determining protein  45.58 
 
 		 370 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.850126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0681  cell wall shape-determining protein  45.58 
 
 		 370 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000125336  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00603  cell wall shape-determining protein  45.84 
 
 		 370 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0209477  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2992  rod shape-determining protein RodA  45.84 
 
 		 370 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000333692  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3011  cell wall shape-determining protein  45.84 
 
 		 370 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000406019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0660  cell wall shape-determining protein  45.84 
 
 		 370 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000639344  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0723  cell wall shape-determining protein  45.84 
 
 		 370 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000246706  normal  0.373531 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0617  cell wall shape-determining protein  45.84 
 
 		 370 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000737698  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0686  cell wall shape-determining protein  45.84 
 
 		 370 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000809378  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0496  rod shape-determining protein RodA  44.57 
 
 		 366 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0674851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3151  cell wall shape-determining protein  44.48 
 
 		 370 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0537844  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2965  cell wall shape-determining protein  45.04 
 
 		 370 aa  283  4.0000000000000003e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.826481  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0112  rod shape-determining protein RodA  45.45 
 
 		 370 aa  283  5.000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1493  rod shape-determining protein RodA  45.86 
 
 		 385 aa  282  6.000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1514  rod shape-determining protein  41.8 
 
 		 382 aa  281  1e-74  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3022  cell wall shape-determining protein  45.89 
 
 		 370 aa  281  2e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00135301  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1850  cell wall shape-determining protein  45.61 
 
 		 370 aa  281  2e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.189784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2950  cell wall shape-determining protein  45.89 
 
 		 370 aa  281  2e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00101238  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3679  rod shape-determining protein RodA  47.29 
 
 		 376 aa  279  7e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0663  rod shape-determining protein RodA  44.21 
 
 		 362 aa  277  2e-73  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00441325  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2459  rod shape-determining protein RodA  44.32 
 
 		 366 aa  277  2e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1455  rod shape-determining protein RodA  46.32 
 
 		 373 aa  277  2e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2710  rod shape-determining protein RodA  45.97 
 
 		 361 aa  276  3e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.217076  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1371  rod shape-determining protein RodA  46.87 
 
 		 373 aa  276  4e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0444396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2544  rod shape-determining protein RodA  43.17 
 
 		 366 aa  275  7e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1358  rod shape-determining protein RodA  46.32 
 
 		 373 aa  275  8e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0173  rod shape-determining protein RodA  45.29 
 
 		 383 aa  275  9e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.463776  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0104  rod shape-determining protein RodA  45.71 
 
 		 377 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0469  rod shape-determining protein RodA  42.66 
 
 		 379 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1758  rod shape-determining protein RodA  44.51 
 
 		 366 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.225068 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2325  RodA, rod cell shape determining protein  44.9 
 
 		 379 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.574517  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0999  rod shape-determining protein RodA  44.9 
 
 		 379 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.771718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2588  rod shape-determining protein RodA  44.41 
 
 		 371 aa  273  3e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0958791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1200  cell wall shape-determining protein  47.2 
 
 		 370 aa  270  2.9999999999999997e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0596  rod shape-determining protein RodA  45.23 
 
 		 368 aa  268  1e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000143295  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0316  rod shape-determining protein RodA  43.79 
 
 		 366 aa  268  1e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2497  rod shape-determining protein RodA  46.59 
 
 		 373 aa  268  1e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.689415  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4036  rod shape-determining protein RodA  43.77 
 
 		 380 aa  268  2e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.924124  normal  0.245 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2412  rod shape-determining protein RodA  43.28 
 
 		 380 aa  266  2.9999999999999995e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.305525  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2078  rod shape-determining protein RodA  45.05 
 
 		 366 aa  266  5e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.73314  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2491  rod shape-determining protein RodA  42.58 
 
 		 366 aa  266  5e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147688  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0615  rod shape-determining protein RodA  43.3 
 
 		 381 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.131957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0929  putative rod shape determining protein  41.05 
 
 		 380 aa  263  3e-69  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0929  rod shape-determining protein RodA  41.94 
 
 		 366 aa  262  6e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00142012  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1091  cell wall shape-determining protein  43.6 
 
 		 370 aa  262  6e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08400  rod shape-determining protein RodA  46.02 
 
 		 382 aa  263  6e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.41497  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3797  rod shape-determining protein RodA  46.02 
 
 		 381 aa  261  1e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.692479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1485  rod shape-determining protein RodA  41.05 
 
 		 380 aa  261  2e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.140754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2566  rod shape-determining protein RodA  41.35 
 
 		 403 aa  259  4e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.397382  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4859  rod shape-determining protein RodA  44.71 
 
 		 380 aa  259  4e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2196  rod shape-determining protein RodA  41.67 
 
 		 364 aa  259  7e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465004 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3340  putative rod shape-determining protein RodA  45.16 
 
 		 381 aa  258  9e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00193411  normal  0.0192453 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4806  rod shape-determining protein RodA  44.41 
 
 		 374 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.42676  normal  0.152125 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4824  rod-shape-determining protein RodA  44.12 
 
 		 381 aa  258  1e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>