More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0508 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0508  RNase HII  100 
 
 		 213 aa  431  1e-120  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.261807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2102  ribonuclease HII  57.64 
 
 		 210 aa  213  9.999999999999999e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497942 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2650  ribonuclease HII  56.65 
 
 		 229 aa  210  1e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2962  ribonuclease H  59.14 
 
 		 204 aa  204  6e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  55.81 
 
 		 214 aa  201  6e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0023  ribonuclease HII  56.65 
 
 		 206 aa  201  8e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0404773  normal  0.332013 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2621  ribonuclease HII  56.63 
 
 		 208 aa  199  3e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0703  ribonuclease H  52.71 
 
 		 269 aa  198  6e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.076303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1470  ribonuclease HII  55.17 
 
 		 212 aa  196  3e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.281309  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  59.68 
 
 		 201 aa  196  3e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0120  ribonuclease HII  55.17 
 
 		 212 aa  195  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.105458 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  59.14 
 
 		 201 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3151  ribonuclease HII  57.45 
 
 		 198 aa  194  7e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0033757  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  55.38 
 
 		 207 aa  192  2e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2871  ribonuclease HII  57.84 
 
 		 203 aa  193  2e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.035191  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0955  ribonuclease HII  58.06 
 
 		 198 aa  192  3e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0144418  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2966  ribonuclease HII  56.45 
 
 		 198 aa  192  3e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208356  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0721  ribonuclease HII  58.06 
 
 		 198 aa  191  5e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  56.45 
 
 		 212 aa  191  5e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0271  ribonuclease HII  56.99 
 
 		 198 aa  191  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0256  ribonuclease HII  56.99 
 
 		 198 aa  191  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4574  ribonuclease H  55.17 
 
 		 202 aa  191  8e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3147  ribonuclease HII  53.65 
 
 		 213 aa  191  9e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.236655  normal  0.0126167 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3776  ribonuclease HII  56.45 
 
 		 197 aa  190  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0312514  hitchhiker  0.00441554 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1449  ribonuclease HII  53.05 
 
 		 226 aa  190  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000143368  normal  0.271939 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0252  ribonuclease HII  56.45 
 
 		 198 aa  189  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.653457 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1027  ribonuclease HII  56.45 
 
 		 198 aa  189  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3421  ribonuclease HII  56.45 
 
 		 198 aa  189  2e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.329934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0268  ribonuclease HII  56.45 
 
 		 198 aa  189  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.443462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0252  ribonuclease HII  56.45 
 
 		 198 aa  189  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.553168 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1080  ribonuclease HII  56.45 
 
 		 198 aa  189  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1286  ribonuclease H  56.99 
 
 		 199 aa  189  2.9999999999999997e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3346  ribonuclease HII  56.99 
 
 		 198 aa  189  4e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.114641  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3420  Ribonuclease H  55.85 
 
 		 198 aa  188  5e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00118566  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0187  ribonuclease HII  55.85 
 
 		 198 aa  188  5e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000269157  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0185  ribonuclease HII  55.85 
 
 		 198 aa  188  5e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000292767  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  52.45 
 
 		 206 aa  187  1e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1357  ribonuclease HII  55.03 
 
 		 211 aa  187  1e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  55.98 
 
 		 218 aa  186  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0176  ribonuclease HII  55.85 
 
 		 198 aa  186  3e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0723713  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  55.38 
 
 		 211 aa  186  3e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0194  ribonuclease HII  55.85 
 
 		 198 aa  186  3e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00608058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0193  ribonuclease HII  55.85 
 
 		 198 aa  186  3e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.614653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  57.69 
 
 		 240 aa  185  3e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3039  ribonuclease HII  57.61 
 
 		 208 aa  185  4e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982104  normal  0.582676 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00181  ribonuclease HII  55.91 
 
 		 198 aa  184  8e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0135226  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0521  ribonuclease HII  55.73 
 
 		 197 aa  184  8e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  49.48 
 
 		 277 aa  184  8e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00180  hypothetical protein  55.91 
 
 		 198 aa  184  8e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.010735  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3477  ribonuclease HII  55.91 
 
 		 198 aa  184  8e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000111932  normal  0.110141 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38850  ribonuclease HII  58.15 
 
 		 207 aa  184  9e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1103  ribonuclease HII  46.57 
 
 		 198 aa  184  1.0000000000000001e-45  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1115  ribonuclease HII  56.52 
 
 		 213 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1284  ribonuclease HII  58.24 
 
 		 212 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.103887  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1548  ribonuclease HII  57.92 
 
 		 217 aa  182  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  57.22 
 
 		 198 aa  182  3e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0560  ribonuclease HII  50.99 
 
 		 229 aa  182  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1153  ribonuclease HII  54.27 
 
 		 206 aa  182  3e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.344887  normal  0.712948 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0391  ribonuclease H  51.71 
 
 		 199 aa  182  4.0000000000000006e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.451839 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1437  ribonuclease HII  56.91 
 
 		 196 aa  181  6e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.480003  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  57.22 
 
 		 209 aa  181  6e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  57.22 
 
 		 209 aa  181  6e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3267  ribonuclease HII  55.73 
 
 		 213 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.279787  normal  0.160809 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0067  ribonuclease HII  54.19 
 
 		 212 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.970815 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2164  ribonuclease HII  60.22 
 
 		 203 aa  181  8.000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.159466  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  49.48 
 
 		 257 aa  181  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  49.5 
 
 		 210 aa  181  9.000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1335  ribonuclease HII  47.62 
 
 		 245 aa  181  1e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1418  ribonuclease HII  54.4 
 
 		 236 aa  180  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222636  normal  0.0561712 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1867  ribonuclease HII  54.45 
 
 		 218 aa  180  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0144978  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1356  ribonuclease HII  53.99 
 
 		 232 aa  180  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1271  ribonuclease HII  55.73 
 
 		 210 aa  180  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1166  ribonuclease HII  51.98 
 
 		 206 aa  180  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1596  Ribonuclease H  54.23 
 
 		 208 aa  180  1e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0869663 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1756  ribonuclease HII  58.2 
 
 		 196 aa  179  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.384083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1292  ribonuclease HII  53.61 
 
 		 232 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.060784  normal  0.581124 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0451  ribonuclease HII  50.97 
 
 		 216 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.286866  normal  0.12494 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  53.76 
 
 		 208 aa  179  2.9999999999999997e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1643  ribonuclease HII  56.32 
 
 		 209 aa  179  4e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4068  ribonuclease HII  55.8 
 
 		 207 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0312759 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5315  ribonuclease HII  55.73 
 
 		 214 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120662  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2613  ribonuclease HII  56.28 
 
 		 240 aa  178  5.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0516  ribonuclease HII  49.75 
 
 		 229 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337743  normal  0.991257 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2038  ribonuclease HII  55.21 
 
 		 217 aa  177  7e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1357  ribonuclease HII  55.74 
 
 		 218 aa  177  8e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  53.76 
 
 		 199 aa  177  8e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1160  ribonuclease HII  56.35 
 
 		 207 aa  177  8e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.392772  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1605  ribonuclease HII  55.8 
 
 		 207 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.388739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  51.89 
 
 		 202 aa  177  1e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1907  ribonuclease HII  55.21 
 
 		 217 aa  177  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  51.89 
 
 		 202 aa  177  1e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0936  ribonuclease HII  50.25 
 
 		 279 aa  177  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4172  ribonuclease HII  55.8 
 
 		 207 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2441  ribonuclease HII  54.59 
 
 		 248 aa  176  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  0.0206101 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2422  ribonuclease HII  58.06 
 
 		 214 aa  176  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000428257  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2025  ribonuclease HII  55.21 
 
 		 214 aa  176  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1568  ribonuclease HII  52.97 
 
 		 214 aa  176  2e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0878508  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6072  ribonuclease HII  55.21 
 
 		 214 aa  176  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1324  ribonuclease HII  55.68 
 
 		 249 aa  176  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2005  ribonuclease HII  55.21 
 
 		 214 aa  176  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>