33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_1802 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1802  hypothetical protein  100 
 
 		 424 aa  845    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0194967  unclonable  0.00000000902281 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1773  hypothetical protein  67.31 
 
 		 718 aa  219  7.999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00222697 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0145  hypothetical protein  67.95 
 
 		 712 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1193  S-layer protein  59.26 
 
 		 1336 aa  170  5e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0165  hypothetical protein  41.71 
 
 		 312 aa  151  2e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00021132  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0135  hypothetical protein  48.98 
 
 		 754 aa  144  3e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0602047  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0119  APHP domain-containing protein  40 
 
 		 976 aa  127  5e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1838  Carbohydrate binding family 6  34.71 
 
 		 1035 aa  65.1  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.533489  normal  0.441295 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  32.23 
 
 		 1931 aa  62.4  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0686  periplasmic copper-binding  31.82 
 
 		 461 aa  61.6  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.241556 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1037  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  29.92 
 
 		 614 aa  59.7  0.00000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1781  hypothetical protein  37 
 
 		 724 aa  53.1  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0894  periplasmic copper-binding  30.36 
 
 		 433 aa  52  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1181  S-layer family protein  36.11 
 
 		 447 aa  50.8  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.635181  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0737  hypothetical protein  38.89 
 
 		 447 aa  50.4  0.00006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.854836 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0084  S-layer protein  38.89 
 
 		 447 aa  50.1  0.00008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1344  periplasmic copper-binding  31.82 
 
 		 954 aa  49.3  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.283677  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1007  periplasmic copper-binding  28.46 
 
 		 697 aa  49.7  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.525995  normal  0.505832 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1008  periplasmic copper-binding  30.28 
 
 		 698 aa  48.5  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  32.41 
 
 		 838 aa  48.5  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1803  parallel beta-helix repeat-containing protein  28.57 
 
 		 594 aa  48.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0567689  unclonable  0.00000000968755 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1342  periplasmic copper-binding  34.15 
 
 		 919 aa  47.8  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0562  S-layer protein  38.03 
 
 		 437 aa  47.8  0.0004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.242159  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0802  S-layer protein  36.11 
 
 		 444 aa  47.8  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.648701  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1206  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  29.33 
 
 		 677 aa  47.8  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1833  periplasmic copper-binding  31.2 
 
 		 595 aa  47.8  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107364 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1686  periplasmic copper-binding  32.04 
 
 		 1056 aa  47  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0405  Carbohydrate binding family 6  33 
 
 		 749 aa  46.6  0.0008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.85643 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  33.05 
 
 		 777 aa  46.2  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0198  periplasmic copper-binding  29.63 
 
 		 810 aa  45.1  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.212278  normal  0.0186793 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  29.7 
 
 		 1300 aa  44.7  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  31.4 
 
 		 978 aa  44.3  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2454  hypothetical protein  35.8 
 
 		 467 aa  43.9  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.471508 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>