221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1458 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1458  RimK domain-containing protein ATP-grasp  100 
 
 		 502 aa  1023    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0341602  normal  0.0124544 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0776  RimK domain-containing protein ATP-grasp  53.69 
 
 		 486 aa  505  9.999999999999999e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121233  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0957  RimK-like ATP-grasp  51.25 
 
 		 486 aa  492  9.999999999999999e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0575  RimK domain protein ATP-grasp  44.2 
 
 		 490 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0103875  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2232  RimK domain protein ATP-grasp  46 
 
 		 494 aa  399  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.360505 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1912  hypothetical protein  41.22 
 
 		 483 aa  399  9.999999999999999e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2956  ribosomal protein S6 modification protein-related protein  44.54 
 
 		 526 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0238931 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2716  RimK domain-containing protein ATP-grasp  44.74 
 
 		 526 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3347  hypothetical protein  42.04 
 
 		 495 aa  388  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2526  glutathione synthase/ribosomal protein S6 modification glutaminyl transferase  43.83 
 
 		 528 aa  383  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000161005  normal  0.270973 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2617  hypothetical protein  42.48 
 
 		 524 aa  384  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.437395 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39390  ribosomal protein S6 modification enzyme  41.63 
 
 		 495 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.836539 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1892  RimK domain-containing protein ATP-grasp  43.06 
 
 		 502 aa  382  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356939 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2764  hypothetical protein  42.59 
 
 		 489 aa  375  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.338805  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46880  glutathione synthase  42.33 
 
 		 529 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000272025 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4039  hypothetical protein  42.54 
 
 		 515 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0756389  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1157  glutathione synthase  39.84 
 
 		 483 aa  369  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2089  RimK domain protein ATP-grasp  42.57 
 
 		 518 aa  366  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2466  hypothetical protein  42.57 
 
 		 518 aa  366  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1035  RimK domain-containing protein ATP-grasp  41.2 
 
 		 499 aa  359  5e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.494403  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1291  RimK domain-containing protein ATP-grasp  38.81 
 
 		 483 aa  359  6e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.696817  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2526  hypothetical protein  42.24 
 
 		 496 aa  355  7.999999999999999e-97  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1841  RimK domain-containing protein ATP-grasp  37.3 
 
 		 492 aa  352  1e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0608327 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5784  RimK domain protein ATP-grasp  39.88 
 
 		 486 aa  346  6e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1453  glutathione synthase/ribosomal protein S6 modification enzyme (glutaminyl transferase)  39.83 
 
 		 490 aa  335  9e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.16454 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1722  glutathione synthase/ribosomal protein S6 modification enzyme (glutaminyl transferase)  38.24 
 
 		 499 aa  329  6e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2915  glutathione synthase  37.61 
 
 		 486 aa  327  3e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.525295 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4158  RimK-like ATP-grasp  36.17 
 
 		 488 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.530195  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02216  glutathione synthase  35.64 
 
 		 495 aa  320  5e-86  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000592479  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0422  hypothetical protein  34.66 
 
 		 484 aa  301  1e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0446  hypothetical protein  34.77 
 
 		 484 aa  301  2e-80  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1433  RimK domain-containing protein ATP-grasp  37.45 
 
 		 316 aa  179  1e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.133242 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0475  RimK domain-containing protein ATP-grasp  35.07 
 
 		 316 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.60167  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1695  RimK domain-containing protein ATP-grasp  39.13 
 
 		 335 aa  171  4e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.803385  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1421  RimK domain-containing protein ATP-grasp  34.33 
 
 		 316 aa  171  4e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.624987  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1626  RimK domain-containing protein ATP-grasp  36.06 
 
 		 290 aa  162  1e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0205048 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1201  RimK domain-containing protein ATP-grasp  36.84 
 
 		 255 aa  150  7e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1276  SSU ribosomal protein S6P modification protein  24.69 
 
 		 310 aa  75.1  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1137  lysine biosynthesis enzyme LysX  27.14 
 
 		 283 aa  73.6  0.000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0237722  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3666  alpha-L-glutamate ligase  25.97 
 
 		 301 aa  70.1  0.00000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000125802  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0318  lysine biosynthesis enzyme LysX  29.72 
 
 		 288 aa  70.1  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1761  lysine biosynthesis enzyme LysX  28.44 
 
 		 296 aa  68.6  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00716  ribosomal protein S6 modification protein  25.68 
 
 		 301 aa  67.8  0.0000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0604  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  26.92 
 
 		 302 aa  66.6  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2779  alpha-L-glutamate ligase  27 
 
 		 302 aa  65.9  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000513891  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2828  alpha-L-glutamate ligases, ribosomal protein S6 modification protein of RimK family protein  26.82 
 
 		 302 aa  66.6  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0291  lysine biosynthesis enzyme LysX  28.14 
 
 		 302 aa  66.2  0.000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.42871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3306  lysine biosynthesis enzyme LysX  29.17 
 
 		 287 aa  65.9  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0328  lysine biosynthesis enzyme LysX  27.95 
 
 		 294 aa  64.7  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0259  lysine biosynthesis enzyme LysX  28.14 
 
 		 283 aa  65.1  0.000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.661273 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0760  ribosomal protein S6 modification protein  26.05 
 
 		 301 aa  65.1  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00088888  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2545  RimK domain protein ATP-grasp  27.57 
 
 		 289 aa  64.7  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.19362  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2398  S6 modification enzyme RimK  27.31 
 
 		 307 aa  64.7  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2724  lysine biosynthesis enzyme LysX  28.85 
 
 		 281 aa  64.3  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.772565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0619  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  26.54 
 
 		 302 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.875829  normal  0.913535 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0316  lysine biosynthesis enzyme LysX  30.53 
 
 		 282 aa  64.3  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3664  alpha-L-glutamate ligase  25.32 
 
 		 301 aa  64.3  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1871  ribosomal protein S6 modification protein  25.52 
 
 		 301 aa  64.3  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1361  alpha-L-glutamate ligase  23.85 
 
 		 301 aa  63.9  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.934336  hitchhiker  0.0000103664 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3661  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  26.46 
 
 		 301 aa  64.3  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2032  SSU ribosomal protein S6P modification protein  25.1 
 
 		 301 aa  63.2  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000147156  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2585  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  28.64 
 
 		 324 aa  62.8  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1379  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  29.32 
 
 		 267 aa  62.8  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.595719 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0168  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  27.03 
 
 		 283 aa  62  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000151287  normal  0.111818 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2270  ribosomal protein S6 modification protein  25.55 
 
 		 299 aa  62  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3469  lysine biosynthesis enzyme LysX  28.65 
 
 		 285 aa  61.6  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1105  S6 modification enzyme RimK  29.03 
 
 		 262 aa  61.6  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.352091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1745  SSU ribosomal protein S6P modification protein  25.55 
 
 		 299 aa  61.6  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000225359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1825  SSU ribosomal protein S6P modification protein  25.55 
 
 		 299 aa  61.6  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000123784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2098  SSU ribosomal protein S6P modification protein  26.43 
 
 		 301 aa  61.6  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.247188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2274  SSU ribosomal protein S6P modification protein  25.55 
 
 		 299 aa  61.6  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000086692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1299  ribosomal protein S6 modification protein  25.87 
 
 		 301 aa  61.2  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.186898  normal  0.0117357 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0481  hypothetical protein  27.61 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0457  hypothetical protein  27.61 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06734  glutathione synthase  23.53 
 
 		 286 aa  61.2  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000825  ribosomal protein S6 glutaminyl transferase  23.53 
 
 		 301 aa  60.8  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000778733  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2496  alpha-L-glutamate ligase  25.17 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000126065  normal  0.0109329 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2380  alpha-L-glutamate ligase  25.17 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000191941  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1967  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  25.17 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000256532  hitchhiker  0.00043621 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2391  alpha-L-glutamate ligase  25.17 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000134298  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2143  alpha-L-glutamate ligase  25 
 
 		 301 aa  60.8  0.00000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000119851  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1687  S6 modification enzyme RimK  27.92 
 
 		 310 aa  59.7  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1291  lysine biosynthesis enzyme LysX  27.64 
 
 		 282 aa  59.3  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0244  alpha-L-glutamate ligase  25.52 
 
 		 302 aa  59.7  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.12128  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1808  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  25.64 
 
 		 269 aa  59.7  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0438  lysine biosynthesis enzyme LysX  28.14 
 
 		 281 aa  59.7  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00025755 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1502  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  28.57 
 
 		 291 aa  58.9  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3203  SSU ribosomal protein S6P modification protein  27.22 
 
 		 329 aa  58.5  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.398244  normal  0.0345991 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2061  S6 modification enzyme RimK  25.1 
 
 		 301 aa  59.3  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000579629  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0879  ribosomal protein S6 modification protein  27.75 
 
 		 300 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.734196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0924  ribosomal protein S6 modification protein  27.75 
 
 		 300 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1059  lysine biosynthesis enzyme LysX  29.17 
 
 		 282 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.411939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0449  S6 modification enzyme RimK  25.56 
 
 		 301 aa  58.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00857  ribosomal protein S6 modification protein  27.75 
 
 		 300 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2790  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  27.75 
 
 		 300 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00863  hypothetical protein  27.75 
 
 		 300 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2480  ribosomal protein S6 modification protein  27.75 
 
 		 300 aa  58.2  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2418  alpha-L-glutamate ligases, RimK family protein  25.52 
 
 		 298 aa  58.2  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0955  ribosomal protein S6 modification protein  27.75 
 
 		 300 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1006  ribosomal protein S6 modification protein  27.75 
 
 		 300 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.195269 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>