258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0219 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0219  integrase catalytic subunit  100 
 
 
231 aa  471  1e-132  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.465023  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0175  transposase  84.85 
 
 
232 aa  404  1.0000000000000001e-112  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2782  integrase catalytic subunit  81.82 
 
 
231 aa  390  1e-108  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0856154  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1481  transposase  70.87 
 
 
238 aa  342  2.9999999999999997e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.84376  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1485  transposase  70.87 
 
 
238 aa  342  2.9999999999999997e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1495  transposase  70.87 
 
 
238 aa  342  2.9999999999999997e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1506  transposase  71.74 
 
 
238 aa  342  2.9999999999999997e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1459  IS6 family transposase  64.38 
 
 
162 aa  217  1e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.835209  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9039  transposase  46.12 
 
 
243 aa  195  4.0000000000000005e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0563  transposase protein  47.64 
 
 
238 aa  192  5e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1460  transposase  65.69 
 
 
166 aa  187  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.277669  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0546  transposase  45.89 
 
 
238 aa  185  5e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0561  transposase protein  48.31 
 
 
233 aa  184  9e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4618  putative transposase  50.25 
 
 
233 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0617811  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4519  putative transposase  49.75 
 
 
233 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00999598  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4459  putative transposase  50.25 
 
 
233 aa  182  3e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4457  putative transposase  50.25 
 
 
233 aa  182  3e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459912  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4632  putative transposase  50.25 
 
 
233 aa  182  3e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.223023  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7074  transposase  44.83 
 
 
238 aa  181  6e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8473  putative transposase  44.1 
 
 
233 aa  181  7e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396806  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3173  transposase  45.37 
 
 
236 aa  179  2e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.19085  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3113  transposase  45.37 
 
 
236 aa  178  8e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3283  transposase  45.37 
 
 
236 aa  178  8e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4725  transposase  47.09 
 
 
237 aa  176  3e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.393822  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8012  transposase protein  47.01 
 
 
238 aa  176  4e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4506  integrase catalytic region  41.52 
 
 
236 aa  174  8e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7844  putative transposase  44.8 
 
 
233 aa  174  9e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7848  putative transposase  44.8 
 
 
233 aa  174  9e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7870  putative transposase  44.8 
 
 
233 aa  174  9e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7882  putative transposase  44.8 
 
 
233 aa  174  9e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8446  putative transposase  44.8 
 
 
233 aa  174  9e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8044  transposase  46.58 
 
 
238 aa  173  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9042  transposase  46.15 
 
 
238 aa  169  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7148  transposase  51.03 
 
 
232 aa  166  4e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4360  transposase  44.59 
 
 
237 aa  166  4e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.017545  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9135  transposase  52.22 
 
 
180 aa  161  9e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0658372  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2997  transposase  40.09 
 
 
237 aa  159  3e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3086  transposase  40.09 
 
 
237 aa  159  3e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3012  transposase  40.09 
 
 
237 aa  159  3e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2945  transposase  40.09 
 
 
237 aa  159  3e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3074  transposase  40.09 
 
 
237 aa  159  3e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3017  transposase  40.09 
 
 
237 aa  159  3e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2913  transposase  40.09 
 
 
237 aa  159  3e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1165  putative IS element transposase  40.27 
 
 
242 aa  158  6e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1696  IS6 family transposase  40.27 
 
 
242 aa  158  6e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1705  IS6 family transposase  40.27 
 
 
242 aa  158  6e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2794  ISRh1 transposase-like protein  40.27 
 
 
242 aa  158  6e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8615  putative transposase  41.44 
 
 
233 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0077  IS6 family transposase  39.82 
 
 
242 aa  155  6e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.45392  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1703  IS6 family transposase  39.82 
 
 
242 aa  155  7e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2762  transposase  40.35 
 
 
251 aa  149  4e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297514  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0790  transposase, putative  57.27 
 
 
110 aa  134  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0245034  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C12  transposase  34.98 
 
 
226 aa  130  2.0000000000000002e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1867  transposase  33.33 
 
 
226 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.823966  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D29  transposase  34.98 
 
 
226 aa  129  3e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000656405  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D32  transposase  34.98 
 
 
226 aa  129  4.0000000000000003e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A03  transposase  33.33 
 
 
226 aa  128  8.000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.136081  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A07  transposase  33.33 
 
 
226 aa  128  8.000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00101418  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0541  transposase  33.33 
 
 
226 aa  128  8.000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.509994  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0961  transposase  34.98 
 
 
226 aa  128  8.000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000241394  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C32  transposase  34.98 
 
 
226 aa  127  1.0000000000000001e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D13  transposase  34.48 
 
 
236 aa  127  1.0000000000000001e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0148  transposase  34.98 
 
 
226 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5663  integrase catalytic region  33.98 
 
 
235 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00884972 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7470  transposase  42.7 
 
 
196 aa  125  5e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5621  integrase catalytic region  33.65 
 
 
235 aa  125  5e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4167  putative transposase  37.06 
 
 
237 aa  125  6e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5614  integrase catalytic region  33.65 
 
 
235 aa  125  6e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4083  transposase  37.06 
 
 
236 aa  125  7e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0139  transposase  35.35 
 
 
226 aa  125  7e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C44  transposase  34.48 
 
 
226 aa  125  8.000000000000001e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C51  transposase  34.48 
 
 
226 aa  124  1e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C41  transposase  34.48 
 
 
226 aa  122  5e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4110  integrase  36.04 
 
 
236 aa  121  9e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5656  integrase catalytic region  32.52 
 
 
235 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.0204963 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2851  putative transposase  35.53 
 
 
237 aa  119  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.878699  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4081  putative transposase  35.03 
 
 
224 aa  117  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5626  integrase catalytic region  33.85 
 
 
243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.880162  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3268  integrase catalytic region  37.77 
 
 
212 aa  116  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5316  putative transposase  32.29 
 
 
238 aa  116  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.110723  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1573  integrase catalytic subunit  30.88 
 
 
238 aa  115  5e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2874  integrase catalytic region  36.17 
 
 
213 aa  115  6.9999999999999995e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.30961 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5309  putative transposase  32.79 
 
 
212 aa  114  8.999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5509  integrase catalytic region  32.37 
 
 
222 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.384257 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1660  transposase  32.47 
 
 
263 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_52  transposase  31.65 
 
 
246 aa  113  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00159101  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1456  hypothetical protein  77.42 
 
 
81 aa  112  4.0000000000000004e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4107  integrase  36.04 
 
 
236 aa  112  7.000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0152  transposase  35.81 
 
 
164 aa  112  7.000000000000001e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0002  truncated IS431mec-like transposase  31.79 
 
 
214 aa  110  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00153541  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4149  integrase  35.11 
 
 
213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4520  transposase  29.26 
 
 
228 aa  109  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.163983  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1668  transposase  32.65 
 
 
341 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.892331  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4558  transposase  37.97 
 
 
215 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2808  integrase catalytic region  30.77 
 
 
224 aa  109  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0988586  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2758  integrase catalytic subunit  30.77 
 
 
224 aa  109  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2763  integrase catalytic subunit  30.77 
 
 
224 aa  109  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.776965  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2803  integrase catalytic region  30.77 
 
 
224 aa  109  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0026  integrase catalytic region  30.77 
 
 
224 aa  108  5e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.509582  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0026  integrase catalytic subunit  30.77 
 
 
224 aa  108  5e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.159143  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>